More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1064 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  100 
 
 		 252 aa  510  1e-144  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  70.9 
 
 		 249 aa  355  5e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0519  ABC transporter related  68.42 
 
 		 247 aa  345  6e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0536  ABC transporter related  68.02 
 
 		 247 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0985  ABC transporter related  68.02 
 
 		 247 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.178128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  67.07 
 
 		 246 aa  339  2.9999999999999998e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  66.8 
 
 		 253 aa  335  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  66.26 
 
 		 246 aa  334  7.999999999999999e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.78 
 
 		 253 aa  331  6e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  62.8 
 
 		 253 aa  329  2e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4002  ABC transporter related  67.61 
 
 		 253 aa  329  3e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.78 
 
 		 284 aa  328  6e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  65.43 
 
 		 242 aa  325  4.0000000000000003e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2001  ABC transporter related  67.92 
 
 		 258 aa  325  6e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  64.92 
 
 		 262 aa  323  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  63.75 
 
 		 240 aa  323  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  63.93 
 
 		 245 aa  323  2e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  63.6 
 
 		 239 aa  322  4e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  65.71 
 
 		 247 aa  322  5e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  63.64 
 
 		 244 aa  321  7e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.67 
 
 		 240 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  64.41 
 
 		 242 aa  320  9.999999999999999e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0238  ABC transporter related  64.05 
 
 		 250 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.783536  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0244  ABC transporter related  64.05 
 
 		 250 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  64.98 
 
 		 263 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  64.92 
 
 		 248 aa  319  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  65.02 
 
 		 265 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  64.14 
 
 		 257 aa  317  9e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  64.41 
 
 		 263 aa  317  1e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  63.56 
 
 		 273 aa  317  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  63.41 
 
 		 246 aa  316  2e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  63.64 
 
 		 267 aa  316  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  63.31 
 
 		 256 aa  316  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  63.27 
 
 		 251 aa  317  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  62.96 
 
 		 253 aa  316  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  62.92 
 
 		 242 aa  316  3e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  65.84 
 
 		 243 aa  315  4e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  63.75 
 
 		 242 aa  315  4e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  62.86 
 
 		 247 aa  315  5e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  64.2 
 
 		 245 aa  315  6e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  64.14 
 
 		 266 aa  314  7e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1806  ATPase  63.49 
 
 		 247 aa  314  8e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.842088 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  64.53 
 
 		 267 aa  314  9e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  63.56 
 
 		 273 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  63.71 
 
 		 251 aa  313  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  62.45 
 
 		 252 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  62.3 
 
 		 255 aa  314  9.999999999999999e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  63.22 
 
 		 253 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.13 
 
 		 269 aa  313  9.999999999999999e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  65.18 
 
 		 247 aa  313  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  64.32 
 
 		 246 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  60.78 
 
 		 258 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  63.14 
 
 		 262 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  62.92 
 
 		 242 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  62.9 
 
 		 255 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  63.75 
 
 		 244 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  63.14 
 
 		 262 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0299  ABC transporter-related protein  61.9 
 
 		 252 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  64.05 
 
 		 248 aa  312  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  62.86 
 
 		 247 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  63.4 
 
 		 257 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  64.17 
 
 		 242 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.32 
 
 		 252 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.73 
 
 		 252 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  62.96 
 
 		 245 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  63.83 
 
 		 257 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  61.79 
 
 		 246 aa  311  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0358  ABC transporter related  60.47 
 
 		 252 aa  311  5.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  63.71 
 
 		 261 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  62.24 
 
 		 245 aa  311  6.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  64.53 
 
 		 256 aa  311  6.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  62.71 
 
 		 262 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  60.56 
 
 		 258 aa  311  7.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  62.55 
 
 		 248 aa  310  1e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  62.98 
 
 		 269 aa  310  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.91 
 
 		 252 aa  310  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.73 
 
 		 249 aa  310  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.91 
 
 		 252 aa  310  2e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  60.91 
 
 		 252 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  60.91 
 
 		 252 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  60.91 
 
 		 252 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  60.91 
 
 		 252 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  64.53 
 
 		 268 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.91 
 
 		 252 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  60.8 
 
 		 260 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  62.2 
 
 		 247 aa  308  4e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  58.61 
 
 		 259 aa  308  5e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  62.45 
 
 		 252 aa  308  5e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3964  ABC transporter related  61.42 
 
 		 258 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  62.13 
 
 		 258 aa  308  6.999999999999999e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  62.81 
 
 		 246 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  62.13 
 
 		 258 aa  308  6.999999999999999e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  62.04 
 
 		 270 aa  308  6.999999999999999e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  64.58 
 
 		 248 aa  307  8e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4395  ABC transporter related  64.2 
 
 		 243 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0223537  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4332  ABC transporter related  63.64 
 
 		 258 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  62.81 
 
 		 246 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  64.17 
 
 		 248 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  61.98 
 
 		 250 aa  306  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1741  ABC transporter related  61.87 
 
 		 267 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>