More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1059 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  100 
 
 		 402 aa  819    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  69.13 
 
 		 381 aa  530  1e-149  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  68.52 
 
 		 380 aa  528  1e-149  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  58.45 
 
 		 369 aa  435  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  60.94 
 
 		 370 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  60.05 
 
 		 372 aa  433  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  59.08 
 
 		 369 aa  434  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  60.6 
 
 		 370 aa  432  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  61.73 
 
 		 374 aa  434  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  60 
 
 		 366 aa  431  1e-119  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  60.16 
 
 		 370 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  60.38 
 
 		 367 aa  427  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  60.68 
 
 		 384 aa  426  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  60.38 
 
 		 367 aa  427  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  59.13 
 
 		 367 aa  421  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  57.92 
 
 		 369 aa  424  1e-117  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  58.42 
 
 		 364 aa  424  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  59.56 
 
 		 364 aa  422  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  58.15 
 
 		 364 aa  422  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  59.13 
 
 		 367 aa  421  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  57.88 
 
 		 364 aa  421  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  60.92 
 
 		 372 aa  421  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  61.14 
 
 		 370 aa  421  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  58.08 
 
 		 364 aa  419  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.81 
 
 		 366 aa  418  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  58.08 
 
 		 366 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.53 
 
 		 366 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.81 
 
 		 366 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  57.53 
 
 		 366 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.53 
 
 		 366 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.53 
 
 		 366 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  58.36 
 
 		 366 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  58.56 
 
 		 370 aa  416  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  57.53 
 
 		 366 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  57.45 
 
 		 367 aa  415  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.53 
 
 		 366 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.53 
 
 		 366 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  57.18 
 
 		 367 aa  414  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  56.83 
 
 		 367 aa  410  1e-113  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  55.95 
 
 		 368 aa  411  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  58.15 
 
 		 366 aa  409  1e-113  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  58.15 
 
 		 366 aa  409  1e-113  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  59.62 
 
 		 370 aa  408  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  59.51 
 
 		 367 aa  411  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  55.56 
 
 		 367 aa  406  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  56.32 
 
 		 374 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  53.55 
 
 		 426 aa  402  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  53.41 
 
 		 371 aa  399  9.999999999999999e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  57.34 
 
 		 369 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1925  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  56.99 
 
 		 377 aa  398  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  53.96 
 
 		 410 aa  396  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.83 
 
 		 406 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  55.88 
 
 		 378 aa  395  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  55.68 
 
 		 371 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  56.79 
 
 		 369 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  52.59 
 
 		 405 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  53.15 
 
 		 406 aa  391  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1671  ABC transporter related  53.35 
 
 		 366 aa  390  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.98 
 
 		 369 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  56.35 
 
 		 376 aa  388  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  53.66 
 
 		 365 aa  391  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  53.15 
 
 		 363 aa  389  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  55.77 
 
 		 585 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  52.63 
 
 		 404 aa  390  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  55.65 
 
 		 365 aa  385  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.79 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.79 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  52.75 
 
 		 404 aa  386  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0218  ABC-type sugar transport system, ATPase component  55.41 
 
 		 367 aa  388  1e-106  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0122274  hitchhiker  0.000000441743 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2164  ABC transporter related  54.01 
 
 		 392 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  55.65 
 
 		 365 aa  385  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  54.52 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  55.15 
 
 		 349 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  54.52 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  54.52 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  55.86 
 
 		 365 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  54.05 
 
 		 380 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  55.43 
 
 		 366 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1433  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.25 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.52 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  55.18 
 
 		 352 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0242  ABC transporter related  54.79 
 
 		 377 aa  377  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  55.43 
 
 		 366 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  53.97 
 
 		 373 aa  377  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  54.65 
 
 		 353 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  51.82 
 
 		 381 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  51.83 
 
 		 380 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  52.51 
 
 		 351 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1651  ABC-type sugar transport system, ATPase component  53.8 
 
 		 402 aa  374  1e-102  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1532  ABC transporter related  54.19 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  55.22 
 
 		 358 aa  373  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  51.81 
 
 		 382 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  53.55 
 
 		 385 aa  375  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  53.63 
 
 		 393 aa  374  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1671  ABC transporter related  52 
 
 		 373 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  50.53 
 
 		 362 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1071  ABC transporter ATP-binding protein  53.16 
 
 		 372 aa  369  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.457538  normal  0.825195 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0586  ABC transporter related  53.16 
 
 		 371 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0376883  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3490  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  55.77 
 
 		 370 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.662972  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  54.14 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>