More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1049 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1049  30S ribosomal protein S2  100 
 
 
264 aa  532  1e-150  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0905437  normal  0.331293 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1780  30S ribosomal protein S2  67.36 
 
 
243 aa  348  7e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000158872  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1966  ribosomal protein S2  69.78 
 
 
251 aa  340  9e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  57.44 
 
 
262 aa  307  1.0000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  60.09 
 
 
233 aa  306  3e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  60.61 
 
 
235 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  61.23 
 
 
232 aa  300  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  56.22 
 
 
262 aa  299  4e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  60.26 
 
 
235 aa  298  6e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  52.11 
 
 
262 aa  296  3e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  61.88 
 
 
248 aa  296  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  54.51 
 
 
257 aa  295  6e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  53.54 
 
 
255 aa  294  8e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  53.54 
 
 
255 aa  294  8e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  58.05 
 
 
238 aa  293  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  57.69 
 
 
235 aa  292  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  56 
 
 
244 aa  291  6e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  58.37 
 
 
233 aa  291  6e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  58.8 
 
 
233 aa  291  7e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  58.8 
 
 
233 aa  291  7e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  58.8 
 
 
233 aa  291  7e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  58.8 
 
 
233 aa  291  7e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  58.8 
 
 
233 aa  291  7e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  58.8 
 
 
233 aa  291  7e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  58.8 
 
 
233 aa  291  7e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  58.08 
 
 
244 aa  290  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  58.37 
 
 
233 aa  289  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  58.37 
 
 
233 aa  289  3e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  54.84 
 
 
252 aa  289  3e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  57.85 
 
 
257 aa  287  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  57.51 
 
 
233 aa  286  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  54.98 
 
 
271 aa  286  2e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  57.27 
 
 
232 aa  286  2.9999999999999996e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  58.15 
 
 
255 aa  285  5e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  53.2 
 
 
257 aa  285  5e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  57.85 
 
 
300 aa  285  7e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  57.14 
 
 
289 aa  284  9e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  57.71 
 
 
259 aa  284  1.0000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0237  ribosomal protein S2  54.13 
 
 
314 aa  282  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245227  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2680  30S ribosomal protein S2  56.39 
 
 
246 aa  282  3.0000000000000004e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000034456  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  53.97 
 
 
282 aa  282  4.0000000000000003e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  52.42 
 
 
281 aa  281  8.000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  56.44 
 
 
274 aa  280  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2104  ribosomal protein S2  56.52 
 
 
272 aa  280  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  57.39 
 
 
287 aa  280  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  56.83 
 
 
236 aa  280  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  55.61 
 
 
251 aa  279  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3991  ribosomal protein S2  56.95 
 
 
316 aa  279  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1974  30S ribosomal protein S2  55.84 
 
 
284 aa  278  5e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34334  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1993  30S ribosomal protein S2  55.84 
 
 
284 aa  278  5e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2039  30S ribosomal protein S2  55.84 
 
 
284 aa  278  5e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.07144  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  55.8 
 
 
251 aa  278  6e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2507  ribosomal protein S2  56.03 
 
 
353 aa  278  6e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282743  normal  0.375385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0474  30S ribosomal protein S2  56.44 
 
 
304 aa  277  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536253  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4133  30S ribosomal protein S2  55.41 
 
 
279 aa  277  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549369  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0994  30S ribosomal protein S2  57.21 
 
 
303 aa  277  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271344  normal  0.423917 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0578  ribosomal protein S2  57.71 
 
 
243 aa  277  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3113  ribosomal protein S2  54.98 
 
 
296 aa  276  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0242876 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  56.5 
 
 
255 aa  276  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  56.5 
 
 
255 aa  276  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  54.39 
 
 
262 aa  275  4e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  51.38 
 
 
258 aa  275  4e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  55.46 
 
 
280 aa  275  4e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1954  30S ribosomal protein S2  57.02 
 
 
233 aa  275  5e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000941341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1672  30S ribosomal protein S2  57.02 
 
 
233 aa  275  5e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000487185  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  55.36 
 
 
256 aa  275  6e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1203  30S ribosomal protein S2  56 
 
 
246 aa  275  7e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159372  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  54.39 
 
 
260 aa  275  7e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3410  ribosomal protein S2  56.22 
 
 
283 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.7242  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0676  30S ribosomal protein S2  55.41 
 
 
292 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.560219  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3243  SSU ribosomal protein S2P  54.11 
 
 
307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191936  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2209  30S ribosomal protein S2  55.61 
 
 
273 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.092398  normal  0.16392 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  55.51 
 
 
257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1004  ribosomal protein S2  53.81 
 
 
283 aa  273  3e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.663705  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1415  ribosomal protein S2  50.97 
 
 
311 aa  273  3e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  54.71 
 
 
301 aa  272  4.0000000000000004e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0551  30S ribosomal protein S2  52.16 
 
 
262 aa  272  5.000000000000001e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000123187  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2198  30S ribosomal protein S2  53.39 
 
 
297 aa  271  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.441521 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09890  SSU ribosomal protein S2P  57.01 
 
 
278 aa  271  8.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  55.8 
 
 
315 aa  270  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1484  ribosomal protein S2  54.91 
 
 
326 aa  271  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068355  normal  0.329281 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11190  SSU ribosomal protein S2P  54.62 
 
 
310 aa  270  2e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.025157  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1848  ribosomal protein S2  55.07 
 
 
288 aa  270  2e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0363359  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23610  SSU ribosomal protein S2P  53.36 
 
 
317 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.699441  normal  0.141313 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  54.63 
 
 
252 aa  269  4e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  54.67 
 
 
343 aa  269  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1180  ribosomal protein S2  54.46 
 
 
317 aa  268  5e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.920095  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10120  SSU ribosomal protein S2P  51.42 
 
 
318 aa  268  5e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  54.67 
 
 
314 aa  268  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1230  30S ribosomal protein S2  54.98 
 
 
279 aa  268  8.999999999999999e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133873  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1529  ribosomal protein S2  51.88 
 
 
344 aa  266  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0105  30S ribosomal protein S2  53.17 
 
 
255 aa  266  2e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000131996  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5911  ribosomal protein S2  53.51 
 
 
304 aa  265  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  55.2 
 
 
301 aa  265  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  51.01 
 
 
267 aa  265  5.999999999999999e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2376  ribosomal protein S2  52.56 
 
 
261 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0975  SSU ribosomal protein S2P  51.36 
 
 
260 aa  265  5.999999999999999e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1542  SSU ribosomal protein S2P  56.89 
 
 
275 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0403  30S ribosomal protein S2  50.2 
 
 
253 aa  264  1e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.489561  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08130  SSU ribosomal protein S2P  52.65 
 
 
250 aa  264  1e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000058431  unclonable  0.00000000192008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>