More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1041 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1041  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
222 aa  450  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0213116 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1959  glycosyl transferase family 2  63.13 
 
 
212 aa  236  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.597827  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1787  family 2 glycosyl transferase  58.62 
 
 
210 aa  219  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.350467  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07780  glycosyl transferase family 2  44.55 
 
 
209 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1438  glycosyl transferase family 2  41.95 
 
 
213 aa  170  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.192606  normal  0.0852028 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1651  glycosyl transferase family protein  38.31 
 
 
206 aa  155  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1807  glycosyl transferase family 2  39.23 
 
 
222 aa  150  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  39.72 
 
 
693 aa  142  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  32.87 
 
 
228 aa  102  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0824  glycosyl transferase family protein  37.02 
 
 
234 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.216941  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0298  glycosyl transferase family 2  33.17 
 
 
217 aa  101  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00219104  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06620  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 
221 aa  83.2  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1685  glycosyl transferase family 2  34.59 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.908588  hitchhiker  0.00379696 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1612  glycosyl transferase family protein  36.49 
 
 
231 aa  81.6  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1389  glycosyl transferase family 2  40.91 
 
 
226 aa  81.3  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  41.94 
 
 
448 aa  79.7  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2150  glycosyl transferase  36.06 
 
 
237 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6919  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 
241 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00000675814  hitchhiker  0.000119796 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2044  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.462866  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  41.61 
 
 
253 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  33.53 
 
 
305 aa  74.7  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0752  glycosyl transferase family protein  45.38 
 
 
243 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000917436  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  32.64 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  39.29 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0763  glycosyl transferase family 2  48.21 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.855183  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1090  glycosyl transferase family protein  39.13 
 
 
236 aa  72  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11948  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0593  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
268 aa  72  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0136  dolichyl-phosphate mannose synthase  39.66 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  38.6 
 
 
355 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  34.02 
 
 
340 aa  70.5  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3310  glycosyl transferase family 2  32.48 
 
 
359 aa  69.3  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  37.61 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 
340 aa  68.6  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0116  glycosyl transferase family 2  42.02 
 
 
265 aa  68.6  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15820  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  33.89 
 
 
343 aa  68.6  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0138111  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2961  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  41.07 
 
 
334 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.720485  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  34.17 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1495  glycosyl transferase family protein  34.07 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.025805  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  39.39 
 
 
336 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2187  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  36.29 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.442863  normal  0.431936 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  35.78 
 
 
780 aa  65.9  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0166  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  39.39 
 
 
513 aa  65.9  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4853  glycosyl transferase family 2  36.29 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2592  glycosyl transferase family 2  40.5 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 
229 aa  65.5  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  42.02 
 
 
394 aa  65.1  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1142  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  31.9 
 
 
321 aa  65.1  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16010  Glycosyl transferase, family 2  30.77 
 
 
322 aa  65.1  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000000647727  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3172  family 2 glycosyl transferase  47.13 
 
 
412 aa  65.1  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0033  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.03 
 
 
247 aa  64.7  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0326174 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
362 aa  64.3  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1577  glycosyl transferase family 2  32.86 
 
 
238 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.469655 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08600  glycosyl transferase  32.58 
 
 
225 aa  64.7  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.36917 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1024  glycosyl transferase family 2  50 
 
 
268 aa  64.3  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.708512  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4066  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 
257 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766809  normal  0.229172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1452  glycosyl transferase family protein  38.94 
 
 
299 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.591361 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1732  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  39.47 
 
 
321 aa  63.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.14375  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0054  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.03 
 
 
528 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00397279  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08960  glycosyl transferase  48.28 
 
 
245 aa  63.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.206591 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
228 aa  63.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2413  glycosyl transferase family 2  39.32 
 
 
243 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.367693 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  45.12 
 
 
450 aa  63.5  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 
414 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  35.67 
 
 
430 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  39.45 
 
 
324 aa  63.2  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4508  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  35.48 
 
 
319 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 
227 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
232 aa  63.2  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06330  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  43.24 
 
 
312 aa  63.2  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1868  glycosyl transferase family protein  38.14 
 
 
503 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.790321  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01630  glycosyl transferase  40 
 
 
285 aa  62.8  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.76765 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3023  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.4 
 
 
505 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 
346 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0034  family 2 glycosyl transferase  39.74 
 
 
246 aa  62.8  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4005  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  39.62 
 
 
334 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0113294  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4079  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  39.62 
 
 
334 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4235  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  39.62 
 
 
334 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.362311 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3959  glycosyl transferase family 2  29.26 
 
 
236 aa  62.4  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  35.44 
 
 
315 aa  62.4  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  34.96 
 
 
273 aa  62.4  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  42.68 
 
 
291 aa  62.4  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
420 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0419  cell wall biogenesis glycosyltransferase  25 
 
 
518 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
613 aa  62  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1727  glycosyl transferase family protein  40.54 
 
 
329 aa  62  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.350304  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3618  hypothetical protein  37.11 
 
 
240 aa  61.6  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
226 aa  62  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  30.57 
 
 
314 aa  61.6  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3553  glycosyl transferase family 2  43.82 
 
 
456 aa  61.6  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1737  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
312 aa  61.6  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2614  glycosyl transferase family 2  36.67 
 
 
253 aa  61.6  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501358  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  37.07 
 
 
256 aa  61.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 
227 aa  61.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  39.08 
 
 
414 aa  61.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  41.25 
 
 
313 aa  61.2  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>