17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0977 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0977  Rad52/22 double-strand break repair protein  100 
 
 
201 aa  413  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  1.68807e-09  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2611  Rad52/22 double-strand break repair protein  48.25 
 
 
238 aa  121  9e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0535  hypothetical protein  37.04 
 
 
151 aa  102  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116997  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2527  Rad52/22 double-strand break repair protein  42.34 
 
 
170 aa  92  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00242809  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1173  hypothetical protein  38.46 
 
 
211 aa  87.4  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  7.29431e-06  normal  0.496656 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0052  putative prophage protein  37.7 
 
 
282 aa  75.9  3e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.012266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0517  Rad52/22 double-strand break repair protein  33.33 
 
 
167 aa  73.9  1e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.743906  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0086  prophage protein  37.82 
 
 
118 aa  73.2  2e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0080  prophage protein  37.82 
 
 
118 aa  73.2  2e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.568604  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0612  gp49  32.32 
 
 
235 aa  72.8  3e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0180237  hitchhiker  0.00151942 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2129  hypothetical protein  31.87 
 
 
252 aa  67.8  1e-10  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0322  hypothetical protein  29.41 
 
 
242 aa  62.4  5e-09  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1314  Rad52/22 double-strand break repair protein  35.25 
 
 
179 aa  55.1  7e-07  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.321327  normal  0.202591 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0281  hypothetical protein  30.33 
 
 
207 aa  49.3  4e-05  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0576  hypothetical protein  31.75 
 
 
170 aa  48.1  9e-05  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00845502  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3545  RAD52/22 double-strand break repair protein  29.84 
 
 
170 aa  46.2  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  5.61994e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0565  RAD52/22 double-strand break repair protein  29.46 
 
 
169 aa  43.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.103803 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>