More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0938 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  100 
 
 		 207 aa  402  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0998  hypothetical protein  39.8 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.338338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  43.19 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  39.73 
 
 		 259 aa  112  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  37.93 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  32.43 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  29.61 
 
 		 245 aa  106  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  34.63 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  41.55 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  32.56 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  31.98 
 
 		 232 aa  99  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1648  phosphoribosyltransferase  35.27 
 
 		 206 aa  98.6  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  31.12 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  31.12 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  32.86 
 
 		 230 aa  96.3  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  34.07 
 
 		 230 aa  95.9  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  34.39 
 
 		 239 aa  95.5  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  54.64 
 
 		 239 aa  92  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01730  putative amidophosphoribosyl-transferase  30.48 
 
 		 226 aa  91.3  8e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  34.98 
 
 		 271 aa  91.3  9e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  29.6 
 
 		 227 aa  91.3  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  37.33 
 
 		 255 aa  90.9  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  31.96 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1195  competence protein F  36.64 
 
 		 240 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  37.22 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  38.35 
 
 		 241 aa  90.1  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  28.83 
 
 		 239 aa  90.1  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  35 
 
 		 241 aa  89.4  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  36.49 
 
 		 245 aa  89.4  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  33.02 
 
 		 276 aa  89  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  34.36 
 
 		 270 aa  88.6  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  41.36 
 
 		 235 aa  88.6  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  34.55 
 
 		 241 aa  88.2  7e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  23.77 
 
 		 230 aa  87.4  1e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  33.02 
 
 		 255 aa  87.4  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  52.58 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  25.23 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  34.35 
 
 		 269 aa  87  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  37.5 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  27.01 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  34.08 
 
 		 231 aa  85.9  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  35.62 
 
 		 247 aa  85.5  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.65 
 
 		 238 aa  85.5  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2856  competence protein F  37.07 
 
 		 240 aa  85.5  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  37.32 
 
 		 251 aa  84.7  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.78 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  31.84 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  38.01 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  33.92 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  33.48 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  36.77 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  29.41 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  27.42 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2548  amidophosphoribosyltransferase-like protein  40.7 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.332374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  35.61 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  32.49 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  42.15 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  35.84 
 
 		 255 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  36.44 
 
 		 263 aa  81.6  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  34.58 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  36.44 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2431  competence protein FC  27.36 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  38.31 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0797  amidophosphoribosyltransferase-like protein  27.13 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.582256  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  36.41 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  36.16 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0541  phosphoribosyltransferase  35.52 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2902  competence protein F, putative  32.91 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4231  amidophosphoribosyltransferases-like  33.16 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  37.33 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  36.79 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  35.08 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  32.47 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4601  competence protein F  38.16 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0226  competence protein  32.37 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  34.7 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  30.56 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2082  phosphoribosyltransferase  37.38 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0714276  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02872  competence protein F  47.83 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  35.15 
 
 		 269 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2633  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.47 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  34.36 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1047  amidophosphoribosyltransferase family protein  31.43 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  33.17 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  36.11 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  40.44 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  37.18 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  33.93 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1381  phosphoribosyltransferase protein-like protein  27.43 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.431166  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  28.88 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  35.47 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  40.13 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  34.93 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2857  phosphoribosyltransferase  38.54 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  31.37 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  31.98 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  32.86 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>