More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0918 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0918  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  100 
 
 
197 aa  369  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4079  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  41.92 
 
 
172 aa  109  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965894  normal  0.0565222 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3129  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  41.92 
 
 
170 aa  105  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4235  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  40.96 
 
 
168 aa  105  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000857433  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26881  NADH dehydrogenase subunit J  41.75 
 
 
200 aa  101  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3346  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  39.29 
 
 
167 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.605889  normal  0.446678 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4001  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  39.88 
 
 
167 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.34885e-17 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1535  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  39.55 
 
 
173 aa  98.6  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3917  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  40.48 
 
 
167 aa  98.6  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1525  NADH dehydrogenase subunit J  37.57 
 
 
200 aa  97.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1345  NADH dehydrogenase subunit J  36.14 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2410  NADH dehydrogenase subunit J  40.23 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6673  NADH dehydrogenase subunit J  44.71 
 
 
277 aa  96.3  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0282  NADH dehydrogenase subunit J  40.12 
 
 
200 aa  95.9  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0347  NADH dehydrogenase I, J subunit  37.5 
 
 
167 aa  95.1  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1237  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  33.73 
 
 
179 aa  95.1  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02311  NADH dehydrogenase subunit J  37.43 
 
 
200 aa  95.5  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1292  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  39.88 
 
 
169 aa  94.7  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3407  NADH dehydrogenase subunit J  38.24 
 
 
173 aa  94.7  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1577  NADH dehydrogenase subunit J  34.69 
 
 
207 aa  94.7  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.14601  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01751  NADH dehydrogenase subunit J  36.65 
 
 
200 aa  92.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.233324  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2527  NADH dehydrogenase subunit J  37.43 
 
 
204 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0400  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase subunit 6  38.78 
 
 
205 aa  91.7  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0160  NADH dehydrogenase subunit J  37.43 
 
 
199 aa  91.7  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0631187  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01781  NADH dehydrogenase subunit J  33.73 
 
 
199 aa  91.3  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7682  NADH dehydrogenase subunit J  38.41 
 
 
287 aa  91.3  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3215  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  41.92 
 
 
174 aa  91.3  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2053  NADH dehydrogenase subunit J  36.36 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.151289 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5144  NADH dehydrogenase subunit J  33.53 
 
 
174 aa  90.5  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4976  NADH dehydrogenase subunit J  33.53 
 
 
174 aa  90.5  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4994  NADH dehydrogenase subunit J  33.53 
 
 
174 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5385  NADH dehydrogenase subunit J  33.53 
 
 
174 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.82495e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5536  NADH dehydrogenase subunit J  33.53 
 
 
174 aa  90.5  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01871  NADH dehydrogenase subunit J  33.16 
 
 
199 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1926  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  37.17 
 
 
282 aa  89.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.856585  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5535  NADH dehydrogenase subunit J  32.35 
 
 
174 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0371244 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5092  NADH dehydrogenase subunit J  32.37 
 
 
174 aa  89.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1668  NADH dehydrogenase subunit J  34.9 
 
 
207 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2052  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  40.23 
 
 
212 aa  90.1  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.432383  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1433  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  37.77 
 
 
215 aa  89.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.469547  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5419  NADH dehydrogenase subunit J  32.94 
 
 
174 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7010  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  36.75 
 
 
167 aa  89.4  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5470  NADH dehydrogenase subunit J  32.94 
 
 
174 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5107  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  35.53 
 
 
184 aa  89.4  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01761  NADH dehydrogenase subunit J  36.26 
 
 
199 aa  89.4  3e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4986  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  31.63 
 
 
220 aa  89  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.489443  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5415  NADH dehydrogenase subunit J  32.35 
 
 
174 aa  89  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1373  NADH dehydrogenase I chain J  37.5 
 
 
169 aa  89  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00182046  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1040  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  39.88 
 
 
168 aa  89  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3626  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  34.72 
 
 
196 aa  88.6  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0734484 
 
 
-
 
NC_002978  WD0965  NADH dehydrogenase I, J subunit  35.37 
 
 
195 aa  88.6  6e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03250  NADH dehydrogenase subunit J  43.83 
 
 
304 aa  88.2  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1882  NADH dehydrogenase subunit J  36.05 
 
 
210 aa  88.2  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.633846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0983  NADH dehydrogenase subunit J  41.32 
 
 
293 aa  88.2  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2205  NADH dehydrogenase subunit J  36.05 
 
 
210 aa  87.8  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4549  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  38.89 
 
 
273 aa  87.8  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1245  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  39.76 
 
 
170 aa  87.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0793888  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1041  NADH dehydrogenase subunit J  33.16 
 
 
206 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.999896  hitchhiker  0.0000032944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1012  NADH dehydrogenase subunit J  33.16 
 
 
206 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1751  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  37.5 
 
 
201 aa  86.3  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3247  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  37.14 
 
 
217 aa  87  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.968108  normal  0.951896 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2040  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  36.31 
 
 
172 aa  86.7  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000947304  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0995  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  39.13 
 
 
197 aa  85.9  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2716  NADH dehydrogenase subunit J  39.25 
 
 
202 aa  85.9  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307115 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2414  NADH dehydrogenase subunit J  35 
 
 
205 aa  85.9  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1307  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  37.95 
 
 
166 aa  85.1  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2278  NADH dehydrogenase subunit J  31.73 
 
 
216 aa  84.7  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.425688  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1412  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain J  35.71 
 
 
215 aa  84.7  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0333706 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3501  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  37.29 
 
 
218 aa  84.7  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3813  NADH dehydrogenase subunit J  32.58 
 
 
174 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2157  NADH dehydrogenase subunit J  31.73 
 
 
216 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1100  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  33.67 
 
 
201 aa  84  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2291  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  34.91 
 
 
205 aa  84  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1628  NADH dehydrogenase subunit J  31.88 
 
 
216 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283353  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2240  NADH dehydrogenase subunit J  31.88 
 
 
216 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.204099  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2264  NADH dehydrogenase subunit J  31.88 
 
 
216 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95038  normal  0.114346 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0190  NADH dehydrogenase subunit J  30.77 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2000  NADH dehydrogenase subunit J  34.73 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.232284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0593  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 6 (chain J)-like protein  34.74 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3630  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  37.42 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0811  NADH dehydrogenase subunit J  33.51 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0806  NADH dehydrogenase subunit J  33.51 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5568  NADH dehydrogenase subunit J  33.33 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3295  NADH dehydrogenase subunit J  34.36 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1037  NADH dehydrogenase subunit J  32.04 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.307574  normal  0.37068 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0966  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  34.81 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0759428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4454  NADH dehydrogenase subunit J  38.15 
 
 
256 aa  82  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.821732 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4056  NADH dehydrogenase subunit J  39.66 
 
 
256 aa  81.6  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.814675  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0850  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  40.62 
 
 
195 aa  81.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00988578  hitchhiker  0.000000229803 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13175  NADH dehydrogenase subunit J  37.95 
 
 
262 aa  81.3  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0936  NADH dehydrogenase subunit J  34.78 
 
 
225 aa  81.3  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0874597  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0547  NADH dehydrogenase subunit J  38.75 
 
 
267 aa  81.3  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.424646  normal  0.443604 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0958  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6  30.3 
 
 
198 aa  80.9  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0739195  normal  0.459515 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1599  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  34.34 
 
 
168 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5171  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6  32.5 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0278  NADH dehydrogenase subunit J  31.73 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.960759  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1151  NADH dehydrogenase I chain J  34.04 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6085  NADH dehydrogenase subunit J  40.26 
 
 
323 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302185  normal  0.0550219 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3205  NADH dehydrogenase subunit J  31.28 
 
 
229 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00105562  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0249  NADH dehydrogenase subunit J  31.73 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>