More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0908 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0908  histidine kinase  100 
 
 
388 aa  772    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 
1014 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.95 
 
 
687 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 
719 aa  141  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.688425  normal  0.99318 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 
958 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2916  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39 
 
 
576 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
1017 aa  137  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 
944 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
718 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 
810 aa  133  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
695 aa  133  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
711 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0833  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
722 aa  129  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.357142  unclonable  0.00000000104285 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0604  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
1174 aa  130  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.42995  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 
885 aa  129  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
677 aa  129  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  33.77 
 
 
470 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
511 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 
827 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
718 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.149473  decreased coverage  0.00105308 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.69 
 
 
973 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0644  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 
754 aa  124  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  31.93 
 
 
1629 aa  124  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0134  histidine kinase  29.8 
 
 
547 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 
701 aa  124  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3102  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
1211 aa  123  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.39 
 
 
933 aa  123  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2968  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 
392 aa  123  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3856  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
378 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1168  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
676 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  32.13 
 
 
927 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 
969 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
597 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1547  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 
520 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1418  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.76 
 
 
853 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237881  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
509 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
620 aa  120  3e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0065  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
377 aa  120  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0353  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
332 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1421  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 
404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 
531 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
763 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
592 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  33.74 
 
 
1046 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 
473 aa  119  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3188  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.49 
 
 
572 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 
597 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 
1352 aa  119  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
579 aa  119  9e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 
546 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.8 
 
 
689 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0145505 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  34.24 
 
 
461 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 
911 aa  118  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 
1965 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  28.85 
 
 
617 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
906 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 
625 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  32.63 
 
 
560 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.19 
 
 
1419 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 
612 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5839  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
902 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.243698  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
609 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
815 aa  117  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  34.07 
 
 
1257 aa  117  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  31.6 
 
 
484 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  31.6 
 
 
484 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2189  histidine kinase  34.73 
 
 
482 aa  117  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
380 aa  117  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 
2783 aa  116  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
610 aa  117  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
640 aa  116  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  31.66 
 
 
613 aa  117  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
652 aa  116  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.950985 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 
611 aa  116  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 
717 aa  116  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  30.24 
 
 
484 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0397  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.12 
 
 
755 aa  116  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  31.2 
 
 
484 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4566  sensor histidine kinase  31.6 
 
 
484 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784652  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  31.37 
 
 
484 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 
1026 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
619 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4921  sensor histidine kinase  31.6 
 
 
484 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.348457  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2814  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.5 
 
 
763 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.155467  normal  0.302046 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 
593 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0937  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
534 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0830916  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3143  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
652 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.417887  normal  0.0487579 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  31.2 
 
 
484 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
932 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3302  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.5 
 
 
763 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6751  Osmosensitive K channel His kinase sensor  32.94 
 
 
902 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  28.75 
 
 
885 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3573  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 
1120 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2385  phytochrome:GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:HWE histidine kinase  30.47 
 
 
1003 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.460117  normal  0.215255 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.87 
 
 
864 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5362  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
643 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  33.46 
 
 
576 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 
816 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0485  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
726 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0662755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.85 
 
 
1051 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>