52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0901 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0901  major facilitator transporter  100 
 
 		 376 aa  673    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 395 aa  86.3  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 395 aa  79.3  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  24.54 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1174  major facilitator transporter  20.27 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.394628  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  26.67 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13440  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 		 394 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1959  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 386 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0139885  hitchhiker  0.0025051 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2341  major facilitator superfamily MFS_1  25.3 
 
 		 390 aa  53.1  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0563  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 425 aa  53.1  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0483  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 354 aa  53.1  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 420 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  20.92 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  20.92 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1762  major facilitator superfamily (MFS)transporter  26.27 
 
 		 401 aa  50.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112506  normal  0.0259533 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1304  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 390 aa  50.1  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1853  major facilitator superfamily permease  30.28 
 
 		 471 aa  50.1  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0268  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.77 
 
 		 500 aa  49.7  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0312698  decreased coverage  0.00157172 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 386 aa  49.3  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  22.7 
 
 		 395 aa  48.9  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1115  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 393 aa  47.4  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.948444  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1778  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 474 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000929318  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1088  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.67 
 
 		 446 aa  47  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0364  major facilitator transporter  24.77 
 
 		 415 aa  47  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  27.6 
 
 		 435 aa  46.6  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0534  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 391 aa  46.6  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0005  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 421 aa  46.6  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0753564  normal  0.228788 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 409 aa  46.2  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03315  MFS permease  25.61 
 
 		 367 aa  45.4  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  23.57 
 
 		 487 aa  45.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0439  major facilitator transporter  21.66 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.116076  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  23.21 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3410  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 484 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  28.52 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  18.35 
 
 		 505 aa  45.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 405 aa  44.3  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2076  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 389 aa  44.3  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  21.83 
 
 		 394 aa  44.3  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1880  major facilitator superfamily permease  28.89 
 
 		 503 aa  43.9  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0049  sugar efflux permease  27.03 
 
 		 485 aa  43.5  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0250  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 		 367 aa  43.5  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.651007  normal  0.954901 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  24.31 
 
 		 393 aa  43.5  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1423  major facilitator superfamily permease  23.28 
 
 		 464 aa  43.5  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.904673  hitchhiker  0.0000661431 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05820  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.38 
 
 		 510 aa  43.5  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0420  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 		 460 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01506  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05090)  21.9 
 
 		 417 aa  43.5  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  29.2 
 
 		 412 aa  43.1  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>