More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0834 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0834  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  100 
 
 		 540 aa  1050    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0952704  normal  0.0982471 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0355  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  44.88 
 
 		 544 aa  309  8e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2789  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.74 
 
 		 536 aa  278  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0472  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  36.16 
 
 		 532 aa  274  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0688  sensor histidine kinase  34.67 
 
 		 534 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0470  sensor histidine kinase  34.72 
 
 		 536 aa  273  6e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.974367  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0527  sensor histidine kinase  34.91 
 
 		 536 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0559  sensor histidine kinase  34.91 
 
 		 536 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0470  sensor histidine kinase  34.28 
 
 		 536 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.398861  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0620  sensor histidine kinase  35.76 
 
 		 536 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0615  sensor histidine kinase  34.34 
 
 		 534 aa  269  8e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0595  sensor protein CitS  34.21 
 
 		 533 aa  268  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4744  sensor protein CitS  35.15 
 
 		 533 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2898  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.29 
 
 		 553 aa  243  7.999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0700  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.65 
 
 		 543 aa  240  4e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3991  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.78 
 
 		 553 aa  240  5e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00164194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1004  sensor histidine kinase  28.68 
 
 		 529 aa  236  6e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.68776e-61 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0928  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.75 
 
 		 537 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0876  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.13 
 
 		 537 aa  236  7e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3432  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.54 
 
 		 537 aa  236  9e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0904  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.75 
 
 		 537 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0938  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.75 
 
 		 537 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.101589 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2441  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.33 
 
 		 540 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3096  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.75 
 
 		 537 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0965  sensor histidine kinase  28.71 
 
 		 529 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1089  sensor histidine kinase  28.68 
 
 		 529 aa  233  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0837  sensor histidine kinase  28.68 
 
 		 529 aa  231  4e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0869  sensor histidine kinase  28.63 
 
 		 529 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0923  sensor histidine kinase  28.63 
 
 		 529 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4311  sensory histidine kinase DcuS  30.62 
 
 		 533 aa  229  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412968  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1210  putative sensor kinase citA  33.94 
 
 		 538 aa  228  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000551679  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1009  sensor histidine kinase  28.41 
 
 		 529 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5639  sensory histidine kinase DcuS  30.99 
 
 		 543 aa  227  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4592  sensory histidine kinase DcuS  31.19 
 
 		 543 aa  228  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3902  sensory histidine kinase DcuS  30.99 
 
 		 543 aa  227  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4679  sensory histidine kinase DcuS  30.99 
 
 		 543 aa  227  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3867  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.99 
 
 		 543 aa  227  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4346  sensor histidine kinase  28.38 
 
 		 529 aa  226  7e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149156  hitchhiker  0.000000000000186115 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4366  sensory histidine kinase DcuS  30.99 
 
 		 543 aa  226  8e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.206477  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02431  sensor kinase CitA  31.58 
 
 		 541 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0811  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.52 
 
 		 529 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0515  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.17 
 
 		 526 aa  224  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003319  sensor kinase CitA  32.97 
 
 		 539 aa  223  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1377  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.08 
 
 		 525 aa  217  5e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2790  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.54 
 
 		 547 aa  217  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000273411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4559  sensory histidine kinase DcuS  31.49 
 
 		 543 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3006  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.75 
 
 		 552 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0490  sensory histidine kinase DcuS  30.79 
 
 		 534 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4699  sensory histidine kinase DcuS  31.49 
 
 		 543 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4725  sensory histidine kinase DcuS  29.71 
 
 		 534 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4650  sensory histidine kinase DcuS  31.49 
 
 		 543 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4650  sensory histidine kinase DcuS  31.49 
 
 		 543 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.414572  normal  0.461897 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3025  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.75 
 
 		 552 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4567  sensory histidine kinase DcuS  31.49 
 
 		 543 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0496  sensory histidine kinase DcuS  30.17 
 
 		 528 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0545  sensory histidine kinase DcuS  30.52 
 
 		 534 aa  213  9e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.847766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0576  sensory histidine kinase DcuS  30.52 
 
 		 534 aa  213  9e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0642  sensor histidine kinase DpiB  30.57 
 
 		 552 aa  212  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0459667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0639  sensory histidine kinase DcuS  30.52 
 
 		 534 aa  212  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0670  sensor histidine kinase DpiB  31.11 
 
 		 552 aa  212  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0246714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0487  sensory histidine kinase DcuS  30.31 
 
 		 534 aa  211  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0489  sensory histidine kinase DcuS  30.1 
 
 		 534 aa  210  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0632  sensory histidine kinase DcuS  30.31 
 
 		 534 aa  211  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2555  sensory histidine kinase DcuS  31.23 
 
 		 538 aa  210  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129089 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00589  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with citB  30.38 
 
 		 552 aa  210  5e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0707  sensor histidine kinase DpiB  30.38 
 
 		 552 aa  210  5e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0614  sensory histidine kinase DcuS  30.1 
 
 		 534 aa  209  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0638  sensor histidine kinase DpiB  30.19 
 
 		 552 aa  209  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.736103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4645  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.39 
 
 		 529 aa  207  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0010254  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0500  sensor histidine kinase  29.18 
 
 		 516 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0318  sensor kinase citA  31.24 
 
 		 565 aa  206  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4102  sensory histidine kinase DcuS  30.21 
 
 		 537 aa  204  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1959  sensory histidine kinase DcuS  28.91 
 
 		 533 aa  204  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516955 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0044  sensory histidine kinase DcuS  30.68 
 
 		 542 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0038  sensory histidine kinase DcuS  30.88 
 
 		 542 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0511  sensor histidine kinase  28.12 
 
 		 516 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0680  sensor kinase DpiB  32.7 
 
 		 553 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.520362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0666  sensor kinase DpiB  32.7 
 
 		 553 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.863518  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0784  sensor kinase DpiB  32.7 
 
 		 553 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.636686  normal  0.450792 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0740  sensor kinase DpiB  32.7 
 
 		 553 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3705  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.91 
 
 		 527 aa  198  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5600  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.86 
 
 		 549 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3378  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.48 
 
 		 545 aa  197  6e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.960766  normal  0.505448 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2325  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.66 
 
 		 531 aa  193  5e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.18048  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3910  sensory histidine kinase DcuS  29.18 
 
 		 537 aa  192  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8198  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.83 
 
 		 538 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0059  sensor kinase DpiB  30.15 
 
 		 552 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2224  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.66 
 
 		 541 aa  188  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.691075  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0058  sensor kinase DpiB  30.21 
 
 		 552 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.736152  normal  0.965676 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0057  sensor kinase DpiB  30.21 
 
 		 552 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0425242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0060  sensor kinase DpiB  30.15 
 
 		 552 aa  187  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0058  sensor kinase DpiB  30.02 
 
 		 552 aa  186  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  0.361929 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4414  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.19 
 
 		 558 aa  184  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3731  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.78 
 
 		 532 aa  183  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.95506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1749  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.23 
 
 		 534 aa  183  8.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000244457  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0350  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.5 
 
 		 555 aa  182  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8065  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.08 
 
 		 583 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1529  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.48 
 
 		 569 aa  181  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000208522 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1396  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.41 
 
 		 556 aa  180  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0792453  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3869  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.5 
 
 		 540 aa  179  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0780654  normal  0.0130314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>