More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0833 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  628  1e-179  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  58.22 
 
 		 325 aa  355  5.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  57.23 
 
 		 314 aa  345  7e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  60.07 
 
 		 328 aa  342  5.999999999999999e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  56.16 
 
 		 345 aa  337  9.999999999999999e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  55.56 
 
 		 314 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  55.38 
 
 		 314 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  55.63 
 
 		 316 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  54.63 
 
 		 313 aa  335  5.999999999999999e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  54.4 
 
 		 314 aa  334  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  54.75 
 
 		 314 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  55.29 
 
 		 308 aa  330  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3704  hypothetical protein  55.48 
 
 		 328 aa  323  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  55.97 
 
 		 314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  55.63 
 
 		 314 aa  319  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  53.77 
 
 		 324 aa  317  2e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  47.3 
 
 		 329 aa  298  7e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  50.17 
 
 		 311 aa  296  3e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  47.6 
 
 		 334 aa  295  5e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  47.42 
 
 		 332 aa  293  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  47.59 
 
 		 374 aa  292  4e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0361  hypothetical protein  48.6 
 
 		 323 aa  290  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.662417  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  50.17 
 
 		 330 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4163  hypothetical protein  47.14 
 
 		 328 aa  280  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000721269  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0596  hypothetical protein  48.15 
 
 		 336 aa  279  4e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  44.27 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  44.27 
 
 		 328 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5905  hypothetical protein  46.6 
 
 		 325 aa  276  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.339531 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3237  hypothetical protein  44.27 
 
 		 328 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1395  hypothetical protein  48.28 
 
 		 335 aa  276  4e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0574924  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3075  hypothetical protein  51.65 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  48.81 
 
 		 322 aa  267  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  45.64 
 
 		 319 aa  263  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  46.92 
 
 		 322 aa  262  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1042  hypothetical protein  43.84 
 
 		 329 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2072  hypothetical protein  45.97 
 
 		 319 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1642  hypothetical protein  45.97 
 
 		 319 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274465  normal  0.0446405 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2569  hypothetical protein  44.76 
 
 		 319 aa  251  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0034025 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3625  hypothetical protein  41.92 
 
 		 339 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2009  hypothetical protein  46.91 
 
 		 319 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2518  hypothetical protein  43.62 
 
 		 319 aa  242  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  44.26 
 
 		 319 aa  240  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0323  hypothetical protein  41.88 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1234  hypothetical protein  44.97 
 
 		 319 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0998  hypothetical protein  37.67 
 
 		 333 aa  236  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3011  hypothetical protein  43.64 
 
 		 319 aa  229  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655008 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1237  hypothetical protein  41.34 
 
 		 337 aa  229  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.462545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5058  hypothetical protein  42.55 
 
 		 358 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.566129  normal  0.354156 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2012  twin-arginine translocation pathway signal  40.85 
 
 		 341 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2509  hypothetical protein  41.88 
 
 		 317 aa  219  5e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0752263  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00840  hypothetical protein  37.3 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0173913  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4958  hypothetical protein  40.71 
 
 		 319 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3102  hypothetical protein  40.41 
 
 		 338 aa  195  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.571018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6270  putative tricarboxylic transport membrane protein  33.67 
 
 		 342 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0141318 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  36.21 
 
 		 346 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  35.11 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  35.59 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  35.02 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2824  hypothetical protein  33.97 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  33.33 
 
 		 325 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  36.07 
 
 		 322 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0734  hypothetical protein  34.22 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0775704  decreased coverage  0.00137039 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  32.03 
 
 		 323 aa  164  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3489  hypothetical protein  32.89 
 
 		 324 aa  162  9e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  34.1 
 
 		 329 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2741  hypothetical protein  36.07 
 
 		 321 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0278237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  35.41 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  35.41 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3123  hypothetical protein  32.31 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  31.41 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0154  hypothetical protein  34.56 
 
 		 326 aa  153  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1873  hypothetical protein  31.53 
 
 		 326 aa  153  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797689  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0967  tricarboxylate-binding protein  30.31 
 
 		 323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3342  hypothetical protein  33.44 
 
 		 326 aa  152  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.019229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  30.41 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  30.95 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2732  hypothetical protein  32.79 
 
 		 326 aa  151  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2897  hypothetical protein  34.43 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1457  hypothetical protein  32.18 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  32.27 
 
 		 330 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1011  putative lipoprotein  30.32 
 
 		 324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.9236  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2117  hypothetical protein  33.91 
 
 		 320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.820451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1091  putative lipoprotein  30.94 
 
 		 325 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1006  tricarboxylate-binding protein  30.14 
 
 		 322 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0839  hypothetical protein  30.45 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00353012  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  34.48 
 
 		 336 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1418  tricarboxylate transport protein TctC, putative  31.89 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4303  hypothetical protein  31.89 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4393  hypothetical protein  31.89 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0871  putative lipoprotein  30.22 
 
 		 348 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0925  putative lipoprotein  30.22 
 
 		 325 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1636  TctC protein  32.44 
 
 		 321 aa  143  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.777278  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5629  periplasmic tricarboxylate binding receptor (TctC)  29.54 
 
 		 333 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1058  hypothetical protein  32.23 
 
 		 326 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0813  hypothetical protein  29.6 
 
 		 322 aa  142  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4344  putative lipoprotein  29.96 
 
 		 325 aa  142  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0136809  hitchhiker  0.000000000438941 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2982  tricarboxylic transport  32.09 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.672552 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3085  tricarboxylic transport  32.09 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2965  tricarboxylic transport  32.09 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443141 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1353  hypothetical protein  30.9 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0759073  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>