34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0832 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0832  integral membrane protein  100 
 
 		 172 aa  320  5e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000357641  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8067  hypothetical protein  33.72 
 
 		 178 aa  86.3  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3501  integral membrane protein  35.42 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3247  integral membrane protein  30.18 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3236  integral membrane protein  30.18 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3298  integral membrane protein  30.18 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172548  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3441  hypothetical protein  38.28 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00151639  normal  0.878549 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37820  hypothetical protein  33.79 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.156933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4162  hypothetical protein  32.72 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0836389  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00850  hypothetical protein  33.9 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00463032  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3005  integral membrane protein  31.82 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0295794 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0322  hypothetical protein  28.57 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751848  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3918  putative tricarboxylic transport membrane protein  28.35 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0635614  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0067  integral membrane protein  33.54 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1394  integral membrane protein  29.76 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.070776  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1828  hypothetical protein  35.66 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.47902 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5906  putative tricarboxylic transport membrane protein  39.37 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.896471  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0595  putative integral membrane protein  29.2 
 
 		 167 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00342772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2147  hypothetical protein  33.09 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3430  hypothetical protein  33.06 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784858  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3314  putative tricarboxylic transport membrane protein  30.65 
 
 		 161 aa  52.8  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188099  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3550  hypothetical protein  32.23 
 
 		 182 aa  50.8  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  30.66 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0307  putative tricarboxylic transport membrane protein  29.76 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3335  hypothetical protein  33.06 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.122468 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4256  putative tricarboxylic transport membrane protein  29.13 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.313811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3635  hypothetical protein  29.84 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6111  hypothetical protein  29.13 
 
 		 164 aa  48.1  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3103  hypothetical protein  32.32 
 
 		 203 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531887  normal  0.721362 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3626  integral membrane protein  34.43 
 
 		 171 aa  45.1  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3967  membrane protein TctB, putative  31.47 
 
 		 152 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.605379  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4233  membrane protein TctB, putative  32.39 
 
 		 152 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2568  hypothetical protein  27.04 
 
 		 164 aa  44.7  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0024808 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1235  hypothetical protein  30.52 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.422621 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>