More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0799 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0799  ABC transporter related  100 
 
 		 240 aa  474  1e-133  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1539  ABC transporter related  57.26 
 
 		 234 aa  260  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  56.84 
 
 		 234 aa  260  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  53.42 
 
 		 234 aa  257  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  54.74 
 
 		 234 aa  254  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2428  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  52.14 
 
 		 234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0310  ABC transporter related  51.28 
 
 		 234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327886  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  54.31 
 
 		 234 aa  251  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  51.12 
 
 		 234 aa  251  8.000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  51.28 
 
 		 234 aa  251  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  56.36 
 
 		 234 aa  250  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.85 
 
 		 234 aa  249  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  54.74 
 
 		 234 aa  249  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  50.85 
 
 		 234 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1617  ABC transporter related  52.99 
 
 		 234 aa  247  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  50.43 
 
 		 237 aa  246  3e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1679  ABC transporter-like protein  55.98 
 
 		 234 aa  246  3e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.0768267 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  50.85 
 
 		 234 aa  245  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  53.3 
 
 		 234 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0145  ABC transporter related  53.19 
 
 		 243 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.71 
 
 		 234 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  50 
 
 		 236 aa  243  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.67 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  51.28 
 
 		 236 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  51.72 
 
 		 235 aa  242  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  52.59 
 
 		 235 aa  241  5e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  52.54 
 
 		 247 aa  240  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  49.14 
 
 		 259 aa  239  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0338  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.49 
 
 		 235 aa  239  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  52.77 
 
 		 239 aa  239  4e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1444  ABC transporter related  48.09 
 
 		 237 aa  239  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  50 
 
 		 234 aa  238  5e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0731  ABC transporter related  51.72 
 
 		 236 aa  238  5.999999999999999e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  52.34 
 
 		 251 aa  238  6.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4333  ABC transporter related  54.08 
 
 		 246 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.175987  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3684  ABC transporter related  53.65 
 
 		 246 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  51.06 
 
 		 239 aa  238  8e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3725  ABC transporter component  53.88 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0944457  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  51.91 
 
 		 238 aa  237  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  52.99 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  52.16 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5326  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.36 
 
 		 243 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  50 
 
 		 249 aa  236  3e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  54.74 
 
 		 233 aa  236  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  52.99 
 
 		 237 aa  235  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1776  ABC transporter related  53.22 
 
 		 244 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.85 
 
 		 247 aa  234  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  48.71 
 
 		 235 aa  234  6e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  46.78 
 
 		 236 aa  234  8e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2498  ABC transporter related  51.28 
 
 		 234 aa  234  9e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  50 
 
 		 233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  53.62 
 
 		 238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  52.97 
 
 		 238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  51.91 
 
 		 236 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  48.28 
 
 		 233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  53.45 
 
 		 234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0838  ABC transporter related  51.29 
 
 		 239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  51.28 
 
 		 236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3657  ABC transporter related  50 
 
 		 235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.222709  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0248  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  53.02 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  49.14 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  47.84 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  50.42 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3664  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  53.02 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  50 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3970  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  53.02 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.394941  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  52.59 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  51.72 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0102  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  52.59 
 
 		 233 aa  233  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  51.29 
 
 		 258 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3977  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.43 
 
 		 235 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.099286  decreased coverage  0.00201124 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3857  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  52.59 
 
 		 237 aa  233  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.43 
 
 		 236 aa  232  4.0000000000000004e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0108  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  52.16 
 
 		 233 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  54.71 
 
 		 245 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  45.49 
 
 		 237 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  50 
 
 		 238 aa  232  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  49.14 
 
 		 235 aa  232  5e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  52.59 
 
 		 237 aa  231  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  52.59 
 
 		 237 aa  231  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  52.59 
 
 		 237 aa  231  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  49.14 
 
 		 237 aa  231  7.000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  52.59 
 
 		 237 aa  231  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  52.59 
 
 		 237 aa  231  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  51.29 
 
 		 234 aa  231  8.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  49.57 
 
 		 244 aa  231  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  50.43 
 
 		 239 aa  231  9e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  52.94 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  47.84 
 
 		 235 aa  230  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  50.22 
 
 		 235 aa  231  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  52.94 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2394  ABC transporter related  52.68 
 
 		 241 aa  230  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805678  normal  0.040758 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  50.43 
 
 		 237 aa  230  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  50 
 
 		 236 aa  231  1e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  46.55 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  50.43 
 
 		 237 aa  230  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  50 
 
 		 237 aa  230  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.98 
 
 		 238 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2998  ABC transporter related  50 
 
 		 242 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.557756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>