More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0788 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  431  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 198 aa  108  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  43.96 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  35.07 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 285 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 332 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3127  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_003296  RS03754  transcription regulator protein  33.82 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.727658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  24.46 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  36.19 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  29.38 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4562  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.602927 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3490  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 238 aa  62  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3248  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 207 aa  62  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 210 aa  62  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  50.77 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  32.5 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 183 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 197 aa  61.6  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  26.7 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  29.73 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  26.7 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  26.7 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  43.24 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  26.7 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  34.35 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  52 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  27.11 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  26.14 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  26.14 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1502  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385487  normal  0.318035 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.35 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.35 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.35 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>