More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0772 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
156 aa  312  9.999999999999999e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 
152 aa  153  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  49.34 
 
 
153 aa  153  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 
154 aa  152  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 
177 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 
152 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 
152 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 
152 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  49.33 
 
 
152 aa  152  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.48 
 
 
156 aa  149  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  46.67 
 
 
152 aa  147  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  41.18 
 
 
159 aa  147  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  46.45 
 
 
156 aa  145  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  50.33 
 
 
154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  47.33 
 
 
152 aa  144  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 
152 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  47.33 
 
 
152 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
156 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  47.33 
 
 
152 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  47.33 
 
 
152 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  47.68 
 
 
161 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  47.68 
 
 
161 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  42.38 
 
 
156 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  47.33 
 
 
175 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 
202 aa  141  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  47.68 
 
 
161 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  47.33 
 
 
229 aa  141  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 
156 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
156 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  45.81 
 
 
155 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  47.33 
 
 
175 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  49.3 
 
 
156 aa  141  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  47.33 
 
 
175 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  47.33 
 
 
175 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  45.81 
 
 
155 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 
202 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  45.81 
 
 
155 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 
154 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  48.68 
 
 
163 aa  140  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 
154 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 
154 aa  140  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 
153 aa  140  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 
155 aa  140  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
154 aa  140  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  47.4 
 
 
163 aa  140  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  49.34 
 
 
158 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  48.67 
 
 
161 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  48.03 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  49.34 
 
 
158 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  49.34 
 
 
158 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  48.67 
 
 
161 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  46.67 
 
 
229 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  44.67 
 
 
175 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 
162 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  49.34 
 
 
158 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 
165 aa  139  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 
161 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 
154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 
153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  48.67 
 
 
155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 
175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
164 aa  138  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 
156 aa  138  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 
175 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 
162 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  44.94 
 
 
162 aa  137  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 
181 aa  137  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
155 aa  137  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  46.26 
 
 
213 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  47.97 
 
 
155 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 
175 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  44.08 
 
 
164 aa  136  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1571  leucine-responsive regulatory protein  44 
 
 
153 aa  136  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  44.08 
 
 
164 aa  136  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  45.03 
 
 
173 aa  136  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 
157 aa  136  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  49.02 
 
 
159 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  44.08 
 
 
164 aa  136  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  49.02 
 
 
169 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1518  leucine-responsive regulatory protein  44 
 
 
153 aa  136  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  45.1 
 
 
161 aa  135  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 
169 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1596  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 
153 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.699626  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  45.03 
 
 
173 aa  135  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  38.16 
 
 
157 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0773  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 
154 aa  134  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0723  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 
154 aa  134  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  43.67 
 
 
162 aa  134  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
158 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  43.67 
 
 
162 aa  134  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  47.71 
 
 
159 aa  134  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  44.44 
 
 
165 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 
156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  46.67 
 
 
155 aa  133  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 
159 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 
157 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  47.71 
 
 
159 aa  133  9e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  42.11 
 
 
154 aa  132  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  42.76 
 
 
164 aa  133  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>