More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0738 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  100 
 
 		 422 aa  805    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  57.74 
 
 		 409 aa  388  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  44.8 
 
 		 428 aa  333  3e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  46.67 
 
 		 433 aa  315  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2300  major facilitator transporter  47.96 
 
 		 432 aa  310  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  44.42 
 
 		 472 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3517  major facilitator transporter  47.71 
 
 		 428 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  42.79 
 
 		 405 aa  302  6.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  41.12 
 
 		 430 aa  301  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  43.87 
 
 		 427 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  43.36 
 
 		 427 aa  298  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0305  major facilitator superfamily MFS_1  48.4 
 
 		 432 aa  298  9e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382232  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  41.08 
 
 		 431 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3532  major facilitator superfamily MFS_1  42.17 
 
 		 427 aa  296  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697797  normal  0.296652 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  41.18 
 
 		 430 aa  294  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  41.2 
 
 		 427 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  42.93 
 
 		 425 aa  293  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  44.15 
 
 		 442 aa  292  7e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1220  major facilitator superfamily MFS_1  45.48 
 
 		 429 aa  291  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.409801 
 
 
-
 
NC_003296  RS03015  putative transport transmembrane protein  42.22 
 
 		 432 aa  290  3e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.120422 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  44.08 
 
 		 435 aa  290  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  41.51 
 
 		 429 aa  290  3e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  46.33 
 
 		 442 aa  290  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 457 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3852  major facilitator superfamily MFS_1  41.63 
 
 		 432 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133619  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3966  major facilitator superfamily MFS_1  41.63 
 
 		 432 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  0.02436 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  41.04 
 
 		 427 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  43.97 
 
 		 431 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  46.06 
 
 		 438 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  44.71 
 
 		 418 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  42.52 
 
 		 435 aa  286  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  39.86 
 
 		 431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  44.98 
 
 		 428 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 436 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  41 
 
 		 433 aa  282  9e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0405  major facilitator transporter  42.31 
 
 		 427 aa  282  9e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0431  major facilitator transporter  42.31 
 
 		 427 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.592654  normal  0.379231 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0473  major facilitator transporter  41.83 
 
 		 427 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.472982 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0500  major facilitator transporter  41.83 
 
 		 427 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3626  major facilitator transporter  42.62 
 
 		 427 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2897  major facilitator transporter  42.55 
 
 		 427 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388241  normal  0.82876 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4080  major facilitator superfamily MFS_1  43.66 
 
 		 424 aa  280  4e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245287  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2605  major facilitator transporter  41.59 
 
 		 427 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3171  major facilitator transporter  42.03 
 
 		 427 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1737  major facilitator transporter  42.03 
 
 		 427 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0029  major facilitator transporter  42.03 
 
 		 427 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2806  transporter, putative  42.03 
 
 		 427 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  41.79 
 
 		 427 aa  278  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3602  major facilitator transporter  42.03 
 
 		 427 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3613  monocarboxylate MFS permease  42.03 
 
 		 427 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3588  major facilitator transporter  42.07 
 
 		 427 aa  277  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.94844  normal  0.904194 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  42.46 
 
 		 437 aa  269  7e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  40.25 
 
 		 433 aa  262  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  43.62 
 
 		 427 aa  259  8e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  41.33 
 
 		 441 aa  249  9e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1057  major facilitator superfamily MFS_1  45.34 
 
 		 424 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  34.03 
 
 		 406 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 405 aa  182  7e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  37.83 
 
 		 400 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  38.1 
 
 		 400 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  37.57 
 
 		 406 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  35.4 
 
 		 407 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 		 452 aa  173  5e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  33.85 
 
 		 403 aa  172  9e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  32 
 
 		 414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  32.94 
 
 		 452 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  37.78 
 
 		 409 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  38.02 
 
 		 409 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  32.99 
 
 		 405 aa  164  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  32.58 
 
 		 414 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  32.99 
 
 		 405 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47560  putative MFS transporter  38.1 
 
 		 399 aa  163  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.973553 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  35.41 
 
 		 412 aa  162  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 414 aa  161  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  36.1 
 
 		 417 aa  161  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 400 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  35.22 
 
 		 402 aa  160  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 412 aa  159  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 406 aa  159  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 436 aa  157  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 403 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4104  MFS family transporter  37.73 
 
 		 399 aa  156  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  35.71 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 417 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  34.75 
 
 		 402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 408 aa  153  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  32.15 
 
 		 413 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 410 aa  151  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  32.38 
 
 		 528 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 411 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  32.58 
 
 		 412 aa  149  7e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  34.93 
 
 		 408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  34.92 
 
 		 402 aa  147  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 411 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  34.28 
 
 		 408 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 410 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 416 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  32.15 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>