More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0713 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0713  aminotransferase, class V  100 
 
 		 397 aa  789    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342271  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2387  aminotransferase class V  39 
 
 		 355 aa  244  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.271517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0174  aminotransferase class V  39.55 
 
 		 360 aa  228  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  34.77 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  33.33 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  33.95 
 
 		 379 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  33.16 
 
 		 380 aa  211  2e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  34.21 
 
 		 384 aa  210  4e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  33.94 
 
 		 379 aa  209  6e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  34.66 
 
 		 379 aa  209  8e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  33.42 
 
 		 384 aa  209  8e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  34.67 
 
 		 380 aa  208  2e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  33.86 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  35.58 
 
 		 400 aa  197  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  34.82 
 
 		 382 aa  194  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  35.19 
 
 		 384 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  34.38 
 
 		 382 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  34.38 
 
 		 382 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0969  aminotransferase class V  32.06 
 
 		 374 aa  188  1e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.716227  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1762  aminotransferase class V  33.6 
 
 		 412 aa  187  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.0159311 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  33.25 
 
 		 385 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  35.34 
 
 		 386 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  34.46 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  34.32 
 
 		 382 aa  182  9.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0114  L-aspartate aminotransferase / phosphoserine aminotransferase  32.99 
 
 		 395 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  33.95 
 
 		 384 aa  180  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  30.75 
 
 		 387 aa  180  4e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  32.11 
 
 		 384 aa  179  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  32.11 
 
 		 384 aa  179  9e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  30.96 
 
 		 387 aa  179  9e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  35.2 
 
 		 397 aa  178  1e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  34.73 
 
 		 383 aa  178  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 382 aa  177  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  31.83 
 
 		 387 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  31.15 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  28.83 
 
 		 386 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  34.03 
 
 		 388 aa  172  7.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  34.32 
 
 		 382 aa  171  3e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  30.16 
 
 		 383 aa  169  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  32.38 
 
 		 383 aa  169  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  31.73 
 
 		 382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0909  aminotransferase class V  33.06 
 
 		 377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.520093  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  29.49 
 
 		 381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  32.16 
 
 		 382 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  30.26 
 
 		 385 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  30.64 
 
 		 382 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  29.84 
 
 		 383 aa  160  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  30.59 
 
 		 396 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0751  aminotransferase class V  32.54 
 
 		 356 aa  157  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000622725 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  30.77 
 
 		 382 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0736  aminotransferase class V  32.25 
 
 		 356 aa  156  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  30.5 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3345  Alanine--glyoxylate transaminase  32.26 
 
 		 355 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000754514  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  29.43 
 
 		 385 aa  153  5e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  29.66 
 
 		 387 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  30.4 
 
 		 382 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  32.39 
 
 		 389 aa  152  7e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3000  alanine--glyoxylate transaminase  33.33 
 
 		 362 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  33.33 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164021 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5630  Serine-glyoxylate aminotransferase (SGAT)  30.63 
 
 		 401 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  29.74 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  30.36 
 
 		 357 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  34.64 
 
 		 401 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3173  aminotransferase, class V  30.17 
 
 		 357 aa  150  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000995852  normal  0.606873 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3260  phosphoserine aminotransferase, putative  32.22 
 
 		 357 aa  149  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0451268  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  30.2 
 
 		 417 aa  149  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  31.87 
 
 		 398 aa  147  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  30 
 
 		 417 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  30.59 
 
 		 422 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  29.35 
 
 		 398 aa  146  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  30.92 
 
 		 395 aa  146  6e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  33.22 
 
 		 413 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  31.68 
 
 		 398 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3418  Serine--glyoxylate transaminase  32.21 
 
 		 400 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  32.05 
 
 		 421 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  29.94 
 
 		 362 aa  142  7e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  31.27 
 
 		 404 aa  142  8e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  29.38 
 
 		 415 aa  142  9e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  31.07 
 
 		 381 aa  142  9e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  29.57 
 
 		 362 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  29.65 
 
 		 362 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  27.57 
 
 		 394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1715  aminotransferase class V  29.41 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  27.81 
 
 		 391 aa  140  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1929  aminotransferase class V  30.49 
 
 		 370 aa  140  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  27.62 
 
 		 360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2772  aminotransferase  31.47 
 
 		 358 aa  139  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.22169e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  32.63 
 
 		 391 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  29.4 
 
 		 380 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  28.53 
 
 		 360 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  29.2 
 
 		 363 aa  138  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  31.23 
 
 		 401 aa  139  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  28.9 
 
 		 402 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  31.47 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  30.06 
 
 		 391 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  29.87 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  32.15 
 
 		 414 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  30.71 
 
 		 395 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  32.28 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  29.55 
 
 		 406 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>