More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0574 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0574  50S ribosomal protein L20  100 
 
 		 119 aa  240  3.9999999999999997e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1253  ribosomal protein L20  62.07 
 
 		 116 aa  152  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78638  normal  0.232233 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1385  50S ribosomal protein L20  61.74 
 
 		 115 aa  149  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000012054  normal  0.0978836 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  62.07 
 
 		 117 aa  147  6e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  62.07 
 
 		 118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  61.74 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2317  50S ribosomal protein L20  61.21 
 
 		 118 aa  143  8.000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000405852  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  60.34 
 
 		 117 aa  142  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  60.34 
 
 		 117 aa  142  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0084  ribosomal protein L20  59.48 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000355513  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  59.48 
 
 		 118 aa  141  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 121 aa  141  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0347  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1997  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00229305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2300  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000821818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0494  50S ribosomal protein L20  59.65 
 
 		 117 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  58.47 
 
 		 118 aa  138  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  58.47 
 
 		 118 aa  138  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  58.47 
 
 		 118 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  58.47 
 
 		 118 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  58.47 
 
 		 118 aa  138  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  58.47 
 
 		 118 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  58.47 
 
 		 118 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  58.47 
 
 		 118 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0129  50S ribosomal protein L20P  56.9 
 
 		 118 aa  138  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.049531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  58.47 
 
 		 118 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  57.39 
 
 		 118 aa  138  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  58.47 
 
 		 118 aa  138  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1840  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2240  50S ribosomal protein L20  61.74 
 
 		 119 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00478573  hitchhiker  0.00537539 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2611  50S ribosomal protein L20  61.74 
 
 		 119 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0328909  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  56.78 
 
 		 119 aa  137  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  57.76 
 
 		 119 aa  137  6e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 		 118 aa  137  6e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 117 aa  137  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 		 119 aa  137  7e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0219  ribosomal protein L20  55.17 
 
 		 118 aa  136  8.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0696  50S ribosomal protein L20  57.39 
 
 		 115 aa  136  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129228  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  56.52 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  58.77 
 
 		 117 aa  136  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  56.52 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 		 119 aa  136  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  56.52 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 		 119 aa  136  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 		 119 aa  136  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 		 117 aa  135  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2216  ribosomal protein L20  57.76 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000311515  normal  0.131567 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1757  50S ribosomal protein L20  62.26 
 
 		 117 aa  134  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0134124  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 		 119 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 		 119 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0469  50S ribosomal protein L20  56.52 
 
 		 120 aa  134  4e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.667366  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  59.82 
 
 		 117 aa  134  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0366  50S ribosomal protein L20P  56.03 
 
 		 117 aa  134  6.0000000000000005e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000702723  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1974  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  55.17 
 
 		 118 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0207  50S ribosomal protein L20  66.32 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2052  50S ribosomal protein L20  55.46 
 
 		 119 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00996082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0217  50S ribosomal protein L20  56.52 
 
 		 120 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000274969  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  55.17 
 
 		 118 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15180  LSU ribosomal protein L20P  54.31 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00260509  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  54.78 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1580  50S ribosomal protein L20  57.39 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1644  50S ribosomal protein L20  57.39 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187432  normal  0.12551 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  54.78 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  54.78 
 
 		 118 aa  130  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1278  50S ribosomal protein L20  56.52 
 
 		 118 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1402  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 		 119 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1374  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 		 119 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.107797  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1163  50S ribosomal protein L20  56.52 
 
 		 118 aa  130  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322945  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2753  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 		 119 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0178087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1362  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 		 119 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1235  ribosomal protein L20  52.59 
 
 		 117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000439682  normal  0.0943757 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0451  50S ribosomal protein L20  54.24 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 119 aa  128  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1736  50S ribosomal protein L20  54.31 
 
 		 118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000116439  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1770  50S ribosomal protein L20  54.31 
 
 		 118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000104745  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1092  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 		 118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000110509  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1738  50S ribosomal protein L20  56.03 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183281  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  55.08 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1776  50S ribosomal protein L20  56.03 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.462713 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1093  50S ribosomal protein L20  56.03 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0111531  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0966  50S ribosomal protein L20  56.03 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1893  50S ribosomal protein L20  56.03 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292968  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4618  50S ribosomal protein L20  56.03 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0133372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2592  50S ribosomal protein L20  56.03 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.808755  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1715  50S ribosomal protein L20  56.03 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179133  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1536  50S ribosomal protein L20  56.03 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1555  50S ribosomal protein L20  56.03 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0996  50S ribosomal protein L20  56.03 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1455  50S ribosomal protein L20  56.03 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0200  50S ribosomal protein L20  56.03 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00269198  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1478  50S ribosomal protein L20  56.03 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.727027  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0981  50S ribosomal protein L20  56.03 
 
 		 117 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0960905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>