More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0572 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  65.18 
 
 		 636 aa  766    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  63.62 
 
 		 644 aa  785    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 650 aa  1308    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1690  alpha amylase catalytic region  56.84 
 
 		 639 aa  652    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.526546  normal  0.114706 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1267  alpha amylase, catalytic region  58.84 
 
 		 645 aa  637    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1153  alpha amylase catalytic region  51.58 
 
 		 657 aa  637    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00213284  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3590  alpha amylase catalytic region  48.03 
 
 		 661 aa  595  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0704974 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3860  alpha amylase catalytic region  55.81 
 
 		 667 aa  593  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  45.85 
 
 		 652 aa  512  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2611  alpha amylase, catalytic region  45.1 
 
 		 650 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0218  Alpha amylase, catalytic region  44.65 
 
 		 650 aa  495  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  45.2 
 
 		 672 aa  493  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  42.01 
 
 		 663 aa  492  1e-137  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  40.73 
 
 		 649 aa  490  1e-137  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  41.05 
 
 		 645 aa  488  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  45.65 
 
 		 651 aa  488  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1797  Alpha amylase, catalytic region  46.03 
 
 		 651 aa  481  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126302  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  41.67 
 
 		 650 aa  481  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  40.32 
 
 		 646 aa  479  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  44.52 
 
 		 643 aa  478  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  43.31 
 
 		 638 aa  477  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25520  glycosidase  47.01 
 
 		 642 aa  459  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.563974  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02416  alpha-amlyase  42.9 
 
 		 638 aa  456  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  38.67 
 
 		 641 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  30.58 
 
 		 553 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  30.12 
 
 		 551 aa  187  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  30.75 
 
 		 572 aa  183  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  30.51 
 
 		 553 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  30.75 
 
 		 572 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1799  alpha amylase catalytic region  26.15 
 
 		 534 aa  181  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  35.24 
 
 		 558 aa  179  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  29.44 
 
 		 551 aa  178  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  28.4 
 
 		 1100 aa  176  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  28.36 
 
 		 1085 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  30.47 
 
 		 548 aa  176  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  29.85 
 
 		 1099 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6073  trehalose synthase  35.23 
 
 		 604 aa  172  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.887339  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  28.4 
 
 		 1088 aa  172  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  28.4 
 
 		 1088 aa  172  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  28.96 
 
 		 1094 aa  172  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  28.16 
 
 		 1088 aa  172  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  28.29 
 
 		 1092 aa  171  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  28.33 
 
 		 1093 aa  170  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  27.31 
 
 		 1088 aa  170  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  28.15 
 
 		 606 aa  170  7e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  30.92 
 
 		 556 aa  170  7e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  28.61 
 
 		 1101 aa  170  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3091  trehalose synthase  30.96 
 
 		 582 aa  170  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000061423  hitchhiker  0.00000215015 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  27.56 
 
 		 1113 aa  170  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  27.54 
 
 		 1094 aa  169  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  27.86 
 
 		 1100 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  30.34 
 
 		 1139 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  28.33 
 
 		 1093 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  28.95 
 
 		 1061 aa  169  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  28.89 
 
 		 1114 aa  168  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  28.67 
 
 		 1100 aa  167  4e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  25.81 
 
 		 571 aa  167  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  27.86 
 
 		 1100 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  29.03 
 
 		 1108 aa  166  9e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  26.96 
 
 		 567 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  27.54 
 
 		 1098 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  28.41 
 
 		 1101 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  27.61 
 
 		 1100 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  33.55 
 
 		 1130 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  27.78 
 
 		 601 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  27.63 
 
 		 1088 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  28.22 
 
 		 1099 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  28.47 
 
 		 1108 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  29.14 
 
 		 601 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000502471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  28.89 
 
 		 1108 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  27.43 
 
 		 1112 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  29.53 
 
 		 596 aa  164  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  29.53 
 
 		 596 aa  164  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  29.53 
 
 		 596 aa  164  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  26.86 
 
 		 1098 aa  163  7e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  27.6 
 
 		 1102 aa  163  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  26.06 
 
 		 591 aa  162  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1096  trehalose synthase  29.98 
 
 		 587 aa  163  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  27.31 
 
 		 1121 aa  162  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  28.57 
 
 		 1110 aa  162  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  27.43 
 
 		 1100 aa  162  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  27.91 
 
 		 1121 aa  161  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  27.19 
 
 		 1110 aa  161  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  28.02 
 
 		 1113 aa  160  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  27.54 
 
 		 577 aa  160  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  28.5 
 
 		 1123 aa  160  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2310  trehalose synthase  27.05 
 
 		 1098 aa  160  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.178439  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  28.4 
 
 		 1108 aa  160  8e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  26.36 
 
 		 1098 aa  160  8e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  27.56 
 
 		 1115 aa  160  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  27.36 
 
 		 1102 aa  160  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  27.6 
 
 		 1111 aa  160  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  27.18 
 
 		 1152 aa  160  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  30.1 
 
 		 567 aa  159  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  27.36 
 
 		 1102 aa  160  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  27.98 
 
 		 1121 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  28.16 
 
 		 598 aa  159  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  28.11 
 
 		 1142 aa  159  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  27.97 
 
 		 1109 aa  159  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  27.25 
 
 		 1164 aa  159  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>