26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0492 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0492  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  684    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2025  hypothetical protein  59.06 
 
 		 299 aa  365  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0375526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1830  hypothetical protein  56.44 
 
 		 304 aa  347  2e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.290615 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0807  hypothetical protein  48.33 
 
 		 302 aa  295  6e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00370253  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00720  hypothetical protein  48.15 
 
 		 305 aa  291  1e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000877673  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0475  hypothetical protein  50.67 
 
 		 299 aa  288  9e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0114  hypothetical protein  46.69 
 
 		 302 aa  287  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0358289  hitchhiker  0.00078389 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0149  hypothetical protein  47.51 
 
 		 300 aa  278  7e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0567257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0112  hypothetical protein  46.05 
 
 		 304 aa  278  9e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000282861  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1511  hypothetical protein  46.18 
 
 		 301 aa  259  6e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.850305  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2695  hypothetical protein  44.82 
 
 		 317 aa  255  9e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3630  dehydrogenase-like protein  44.88 
 
 		 312 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.496684  normal  0.352042 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0587  hypothetical protein  39.93 
 
 		 303 aa  241  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0873705  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1330  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  35.78 
 
 		 685 aa  176  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.372745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4364  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  36.6 
 
 		 691 aa  175  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103685  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1617  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  35.46 
 
 		 685 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0662  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  34.97 
 
 		 681 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0104064  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2305  dehydrogenase-like  28.85 
 
 		 720 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1964  putative dehydrogenase  28.05 
 
 		 710 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2483  dehydrogenase-like protein  28.82 
 
 		 728 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0417165  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1059  dehydrogenase-like  27.78 
 
 		 684 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2362  dehydrogenase-like protein  31.27 
 
 		 728 aa  99.4  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.221453 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1644  dehydrogenase-like protein  27.78 
 
 		 707 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1566  dehydrogenase-like protein  26.73 
 
 		 707 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1668  putative dehydrogenase  24.91 
 
 		 689 aa  73.2  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0410472  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0238  PII uridylyl-transferase  30.91 
 
 		 890 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>