More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0472 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  100 
 
 		 450 aa  926    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  45.87 
 
 		 444 aa  373  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  47.39 
 
 		 453 aa  351  1e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  43.81 
 
 		 435 aa  339  5e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  38.58 
 
 		 434 aa  290  3e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  36.94 
 
 		 445 aa  236  6e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0959  FeS assembly protein SufD  33.7 
 
 		 404 aa  226  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2391  FeS assembly protein SufD  35.14 
 
 		 455 aa  225  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0727  FeS assembly protein SufD  31.18 
 
 		 441 aa  208  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  29.5 
 
 		 444 aa  206  7e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0174  FeS assembly protein SufD  33.1 
 
 		 441 aa  206  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000908978 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  27.78 
 
 		 467 aa  205  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  29.75 
 
 		 471 aa  205  2e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  27.66 
 
 		 463 aa  201  3e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  28.34 
 
 		 470 aa  200  5e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5393  FeS assembly protein SufD  32 
 
 		 420 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  27.13 
 
 		 475 aa  197  3e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  28.15 
 
 		 476 aa  197  3e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  26.95 
 
 		 470 aa  196  7e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5394  FeS assembly protein SufB  27.56 
 
 		 477 aa  195  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0709  FeS assembly protein SufD  31.35 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  26.42 
 
 		 469 aa  194  3e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  28.48 
 
 		 475 aa  194  4e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1698  FeS assembly protein SufB  28.83 
 
 		 469 aa  193  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0305  FeS assembly protein SufD  30.89 
 
 		 405 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  27.39 
 
 		 464 aa  191  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  27.82 
 
 		 468 aa  190  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  27.39 
 
 		 464 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  27.42 
 
 		 476 aa  190  5e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0537  FeS assembly protein SufD  31.21 
 
 		 445 aa  190  5.999999999999999e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04460  FeS assembly protein SufD  29.55 
 
 		 437 aa  189  7e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0543  FeS assembly protein SufB  27.84 
 
 		 466 aa  189  8e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2919  FeS assembly protein SufB  27.29 
 
 		 476 aa  188  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  30.53 
 
 		 445 aa  188  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  26.94 
 
 		 472 aa  188  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.18 
 
 		 470 aa  187  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  33.89 
 
 		 439 aa  186  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1840  FeS assembly protein SufB  26.05 
 
 		 474 aa  186  8e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  26.04 
 
 		 467 aa  186  9e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  28.51 
 
 		 428 aa  185  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.22 
 
 		 490 aa  184  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  25.62 
 
 		 476 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  28.08 
 
 		 481 aa  184  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  28.02 
 
 		 465 aa  184  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.49 
 
 		 470 aa  183  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  28.11 
 
 		 485 aa  182  7e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3578  FeS assembly protein SufD  31.89 
 
 		 430 aa  182  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2340  FeS assembly protein SufB  27.33 
 
 		 479 aa  182  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  27.13 
 
 		 485 aa  182  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  27.33 
 
 		 465 aa  181  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  27.64 
 
 		 472 aa  182  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  27.44 
 
 		 470 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  26.68 
 
 		 480 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  26.68 
 
 		 481 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1237  FeS assembly protein SufD  30.37 
 
 		 433 aa  181  2.9999999999999997e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0496  FeS assembly protein SufD  26.94 
 
 		 466 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  26.58 
 
 		 487 aa  181  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0378  SufBD protein  29.41 
 
 		 403 aa  180  4e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0643358  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  27.29 
 
 		 487 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  27.8 
 
 		 470 aa  180  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.188846 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1906  FeS assembly protein SufB  26.28 
 
 		 479 aa  179  7e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  28.08 
 
 		 428 aa  179  7e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  27.79 
 
 		 470 aa  179  8e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1657  FeS assembly protein SufB  27.82 
 
 		 483 aa  179  1e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  27.15 
 
 		 470 aa  179  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  31.28 
 
 		 436 aa  179  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0292386 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2733  FeS assembly protein SufB  27.35 
 
 		 479 aa  179  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  0.116285 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  26.47 
 
 		 476 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  27.11 
 
 		 465 aa  178  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  27.06 
 
 		 469 aa  178  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1671  FeS assembly protein SufB  27.71 
 
 		 485 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.225457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  26.91 
 
 		 482 aa  178  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  27.11 
 
 		 465 aa  178  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  26.44 
 
 		 471 aa  178  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3677  FeS assembly protein SufB  27.35 
 
 		 479 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.971678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1660  FeS assembly protein SufB  27.09 
 
 		 470 aa  177  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0336452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5087  FeS assembly protein SufD  30.82 
 
 		 430 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4850  hypothetical protein  30.82 
 
 		 430 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4691  iron-regulated ABC transporter  30.82 
 
 		 430 aa  177  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5216  hypothetical protein  30.82 
 
 		 430 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0308  FeS assembly protein SufB  26.7 
 
 		 471 aa  177  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0830737 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4706  iron-regulated ABC transporter  30.82 
 
 		 430 aa  176  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2430  SufBD protein  31.94 
 
 		 408 aa  176  6e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0712  FeS assembly protein SufB  26.7 
 
 		 471 aa  176  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0566441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4804  FeS assembly protein SufD  30.82 
 
 		 430 aa  176  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  27.56 
 
 		 465 aa  176  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.11 
 
 		 483 aa  176  9e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2085  FeS assembly protein SufB  26.86 
 
 		 470 aa  176  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  25.23 
 
 		 472 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  26.24 
 
 		 476 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  26.88 
 
 		 470 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329158  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  26.01 
 
 		 472 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1206  FeS assembly protein SufB  27.92 
 
 		 470 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0384919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5122  FeS assembly protein SufD  30.59 
 
 		 430 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.273896  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0116  FeS assembly protein SufD  30.59 
 
 		 430 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4271  FeS assembly protein SufD  31.4 
 
 		 447 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1180  FeS assembly protein SufD  27.94 
 
 		 438 aa  174  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1140  FeS assembly protein SufB  27.88 
 
 		 481 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0592763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5124  FeS assembly protein SufD  30.59 
 
 		 430 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.233215  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5119  hypothetical protein  30.59 
 
 		 430 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>