72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0409 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0409  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 
326 aa  618  1e-176  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4134  cytochrome oxidase assembly  44.64 
 
 
318 aa  229  7e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1459  cytochrome oxidase assembly  44.88 
 
 
337 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.494782  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0213  cytochrome oxidase assembly  46.46 
 
 
318 aa  225  9e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0224  cytochrome oxidase assembly  46.46 
 
 
318 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15999  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2414  cytochrome oxidase assembly  44 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0989704  normal  0.228946 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0200  cytochrome oxidase assembly protein  47.22 
 
 
316 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.571706  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0545  cytochrome oxidase assembly  48.23 
 
 
335 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0340  cytochrome oxidase assembly  40.26 
 
 
319 aa  183  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  43.26 
 
 
624 aa  179  4.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0707  cytochrome oxidase assembly  42.04 
 
 
317 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3706  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  26.9 
 
 
311 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.006652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4156  cytochrome aa3 controlling protein  26.9 
 
 
311 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3961  cytochrome aa3 controlling protein  26.9 
 
 
311 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3858  cytochrome aa3 controlling protein  26.9 
 
 
311 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3689  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  26.9 
 
 
311 aa  90.5  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3993  cytochrome aa3 controlling protein  26.55 
 
 
311 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4064  cytochrome aa3 controlling protein  26.55 
 
 
311 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.839964  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1191  cytochrome aa3 controlling protein  26.55 
 
 
311 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4049  cytochrome aa3 controlling protein  26.55 
 
 
311 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3772  cytochrome oxidase assembly  27.17 
 
 
311 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2648  cytochrome oxidase assembly  40.7 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1853  cytochrome oxidase assembly  39.18 
 
 
317 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  30.95 
 
 
331 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  37.11 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  28.1 
 
 
311 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0705  cytochrome oxidase assembly protein  34.44 
 
 
302 aa  63.9  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  34.73 
 
 
622 aa  63.2  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1197  cytochrome oxidase assembly  33.33 
 
 
356 aa  60.1  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1175  cytochrome oxidase assembly  33.33 
 
 
356 aa  60.1  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2061  cytochrome oxidase assembly  40.35 
 
 
309 aa  58.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.603923  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2268  cytochrome oxidase assembly  41.74 
 
 
337 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00686495  normal  0.0860504 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1977  cytochrome oxidase assembly  33.33 
 
 
328 aa  57.4  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.628163 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2076  cytochrome oxidase assembly  29.49 
 
 
326 aa  56.6  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.809724 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2347  cytochrome oxidase assembly  31.67 
 
 
328 aa  56.2  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0173507  normal  0.0130822 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2217  cytochrome oxidase assembly  27.78 
 
 
351 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000899528  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  28.81 
 
 
351 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3312  cytochrome oxidase assembly  32.22 
 
 
325 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000656603 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1353  cytochrome oxidase assembly  33.94 
 
 
320 aa  54.7  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  29.63 
 
 
307 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3264  cytochrome oxidase assembly  36.36 
 
 
298 aa  53.1  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1135  cytochrome oxidase assembly  30.36 
 
 
318 aa  52.8  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  33.03 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1133  cytochrome oxidase assembly  31.82 
 
 
370 aa  51.2  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  28.75 
 
 
313 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  28.17 
 
 
333 aa  50.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  28.75 
 
 
313 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  28.53 
 
 
327 aa  50.1  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  28.74 
 
 
363 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  24.7 
 
 
339 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2430  cytochrome oxidase assembly  28.08 
 
 
325 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3085  cytochrome oxidase assembly  44.26 
 
 
326 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734948  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2249  cytochrome oxidase assembly  34.78 
 
 
386 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000165994 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  35.71 
 
 
337 aa  47  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  26.76 
 
 
311 aa  46.6  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1666  cytochrome oxidase assembly  33.56 
 
 
348 aa  46.6  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00799414  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1803  cytochrome oxidase assembly  28.74 
 
 
297 aa  46.6  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0193  cytochrome oxidase assembly  27.1 
 
 
321 aa  46.6  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  28.81 
 
 
304 aa  45.8  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2543  cytochrome oxidase assembly  33.59 
 
 
305 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0684946  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2956  Uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly-like protein  33.64 
 
 
328 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14570  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  34.21 
 
 
307 aa  45.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852831  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  28.61 
 
 
363 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  33.93 
 
 
328 aa  44.3  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1653  cytochrome oxidase assembly  53.19 
 
 
342 aa  44.3  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2099  cytochrome oxidase assembly  29.06 
 
 
301 aa  43.5  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  26.28 
 
 
325 aa  43.5  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4613  cytochrome oxidase assembly protein, putative  36.59 
 
 
330 aa  43.5  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  28.9 
 
 
327 aa  43.1  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0662  cytochrome oxidase assembly  23.46 
 
 
335 aa  42.7  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1841  cytochrome oxidase assembly  31.97 
 
 
314 aa  42.4  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355712 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  38.3 
 
 
361 aa  42.4  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>