More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0407 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0407  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 
435 aa  895    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  37.14 
 
 
351 aa  229  9e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  36.07 
 
 
355 aa  225  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  32.66 
 
 
370 aa  196  8.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  31.58 
 
 
367 aa  194  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  29.46 
 
 
359 aa  161  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  30.94 
 
 
311 aa  160  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  30.11 
 
 
326 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  32.62 
 
 
345 aa  153  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  32.54 
 
 
352 aa  153  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  37.35 
 
 
371 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  34.25 
 
 
434 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  34.45 
 
 
354 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  32.66 
 
 
338 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  32.62 
 
 
346 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  34.04 
 
 
353 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  30.75 
 
 
334 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  32.61 
 
 
330 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  32.51 
 
 
352 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  33.74 
 
 
352 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  32.35 
 
 
334 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  33.89 
 
 
354 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  28.57 
 
 
425 aa  147  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.54281 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  26.74 
 
 
349 aa  147  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  28.98 
 
 
330 aa  146  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  35.19 
 
 
322 aa  146  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  34.26 
 
 
327 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  27.73 
 
 
349 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  27.73 
 
 
349 aa  144  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  27.73 
 
 
349 aa  144  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  27.73 
 
 
349 aa  144  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  27.73 
 
 
349 aa  144  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  31.29 
 
 
370 aa  143  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  28.01 
 
 
349 aa  143  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  28.01 
 
 
349 aa  143  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1705  cytochrome c, monohaem  31.07 
 
 
324 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  33.82 
 
 
372 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  27.45 
 
 
349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  37.32 
 
 
381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  27.45 
 
 
349 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  30.75 
 
 
336 aa  141  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  27.45 
 
 
349 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  33.53 
 
 
372 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1754  cytochrome c, monohaem  33.33 
 
 
324 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0118  cytochrome c oxidase, subunit IIC  32.94 
 
 
324 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134505  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3379  cytochrome c oxidase, subunit II  33.07 
 
 
318 aa  137  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2183  putative cytochrome c oxidase polypeptide II precursor  35.54 
 
 
338 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  34.3 
 
 
346 aa  136  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1855  cytochrome c oxidase, subunit II  29.05 
 
 
356 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0460  cytochrome c oxidase, subunit II  33.93 
 
 
353 aa  131  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11170  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  33.6 
 
 
315 aa  129  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761021  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  31.98 
 
 
342 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  31.6 
 
 
314 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  30.53 
 
 
334 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0983  cytochrome c oxidase, subunit II  28.09 
 
 
356 aa  123  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  28.41 
 
 
350 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  32.81 
 
 
355 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  28.04 
 
 
350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  28.04 
 
 
350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4128  cytochrome c oxidase subunit II  30.99 
 
 
269 aa  117  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  29.04 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  29.04 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3255  cytochrome c oxidase subunit II  30.14 
 
 
316 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000163024  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  30.91 
 
 
377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  27.62 
 
 
385 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  27.38 
 
 
531 aa  114  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  30.43 
 
 
405 aa  113  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  26.79 
 
 
366 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  29.7 
 
 
374 aa  113  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  27.51 
 
 
401 aa  112  9e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  27.51 
 
 
401 aa  112  9e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  27 
 
 
532 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  26.42 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  29.76 
 
 
316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  27 
 
 
532 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  31.37 
 
 
279 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  27.38 
 
 
535 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1367  cytochrome c oxidase, subunit II  30.49 
 
 
311 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4246  cytochrome c oxidase, subunit II  28.09 
 
 
384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  28.24 
 
 
351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  27.38 
 
 
535 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  27.76 
 
 
532 aa  111  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  27 
 
 
532 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  28.3 
 
 
390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  27.55 
 
 
418 aa  110  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  27.17 
 
 
418 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16250  cytochrome c oxidase, subunit II  28.96 
 
 
304 aa  109  9.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.178752  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  27.88 
 
 
385 aa  109  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3150  cytochrome c oxidase, subunit II  30.3 
 
 
340 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  28.24 
 
 
405 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0621  cytochrome c oxidase, subunit II  32.68 
 
 
255 aa  108  2e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345466  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  28.51 
 
 
249 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  27.24 
 
 
342 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  24.63 
 
 
311 aa  107  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  29.44 
 
 
260 aa  107  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0314  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  25.99 
 
 
421 aa  107  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  27.04 
 
 
544 aa  107  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  27.68 
 
 
387 aa  106  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  27.27 
 
 
525 aa  106  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  26.15 
 
 
377 aa  105  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>