More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0355 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0355  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  100 
 
 
544 aa  1049    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0834  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  44.49 
 
 
540 aa  321  1.9999999999999998e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0952704  normal  0.0982471 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3991  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.17 
 
 
553 aa  235  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00164194  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2441  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.95 
 
 
540 aa  231  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0700  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.88 
 
 
543 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2789  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.07 
 
 
536 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4645  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.23 
 
 
529 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0010254  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2898  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.93 
 
 
553 aa  214  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0472  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.16 
 
 
532 aa  210  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0318  sensor kinase citA  30.57 
 
 
565 aa  209  9e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0615  sensor histidine kinase  28.24 
 
 
534 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0527  sensor histidine kinase  27.52 
 
 
536 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0559  sensor histidine kinase  27.52 
 
 
536 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0470  sensor histidine kinase  27.85 
 
 
536 aa  206  9e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.974367  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0837  sensor histidine kinase  27.25 
 
 
529 aa  206  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0515  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.47 
 
 
526 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0965  sensor histidine kinase  27.25 
 
 
529 aa  205  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0869  sensor histidine kinase  27.45 
 
 
529 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0470  sensor histidine kinase  28.05 
 
 
536 aa  205  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.398861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0923  sensor histidine kinase  27.45 
 
 
529 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0876  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.59 
 
 
537 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0688  sensor histidine kinase  27.85 
 
 
534 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3867  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.84 
 
 
543 aa  204  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4679  sensory histidine kinase DcuS  26.65 
 
 
543 aa  204  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4366  sensory histidine kinase DcuS  26.65 
 
 
543 aa  203  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.206477  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8065  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  38.62 
 
 
583 aa  204  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1009  sensor histidine kinase  26.67 
 
 
529 aa  203  7e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5639  sensory histidine kinase DcuS  26.65 
 
 
543 aa  203  7e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3902  sensory histidine kinase DcuS  26.65 
 
 
543 aa  203  7e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4744  sensor protein CitS  27.66 
 
 
533 aa  203  7e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4592  sensory histidine kinase DcuS  26.65 
 
 
543 aa  203  8e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1089  sensor histidine kinase  27.25 
 
 
529 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1377  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.2 
 
 
525 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0620  sensor histidine kinase  28.12 
 
 
536 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4311  sensory histidine kinase DcuS  30.47 
 
 
533 aa  201  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412968  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0642  sensor histidine kinase DpiB  31.07 
 
 
552 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0459667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1004  sensor histidine kinase  27.02 
 
 
529 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.68776e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0595  sensor protein CitS  26.99 
 
 
533 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0060  sensor kinase DpiB  29.55 
 
 
552 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3025  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.07 
 
 
552 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0057  sensor kinase DpiB  29.55 
 
 
552 aa  200  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0425242  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00589  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with citB  31.07 
 
 
552 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3006  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.07 
 
 
552 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0058  sensor kinase DpiB  29.55 
 
 
552 aa  199  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.736152  normal  0.965676 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3432  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.98 
 
 
537 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0496  sensory histidine kinase DcuS  29.06 
 
 
528 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0904  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.72 
 
 
537 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3096  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.67 
 
 
537 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0707  sensor histidine kinase DpiB  30.89 
 
 
552 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0928  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.72 
 
 
537 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4346  sensor histidine kinase  26.86 
 
 
529 aa  197  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149156  hitchhiker  0.000000000000186115 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0938  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.72 
 
 
537 aa  198  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.101589 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0058  sensor kinase DpiB  29.36 
 
 
552 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  0.361929 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0638  sensor histidine kinase DpiB  30.7 
 
 
552 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.736103  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0670  sensor histidine kinase DpiB  30.89 
 
 
552 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0246714  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0059  sensor kinase DpiB  29.36 
 
 
552 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0044  sensory histidine kinase DcuS  30 
 
 
542 aa  192  9e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0038  sensory histidine kinase DcuS  29.56 
 
 
542 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5600  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.4 
 
 
549 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02431  sensor kinase CitA  29.83 
 
 
541 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0811  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.83 
 
 
529 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3378  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.77 
 
 
545 aa  189  9e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.960766  normal  0.505448 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37840  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.16 
 
 
527 aa  188  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.183307 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0487  sensory histidine kinase DcuS  27.41 
 
 
534 aa  187  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1210  putative sensor kinase citA  33.83 
 
 
538 aa  187  5e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000551679  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0632  sensory histidine kinase DcuS  27.41 
 
 
534 aa  186  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3869  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.37 
 
 
540 aa  186  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0780654  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3731  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.29 
 
 
532 aa  186  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.95506  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3910  sensory histidine kinase DcuS  28.95 
 
 
537 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4699  sensory histidine kinase DcuS  27.87 
 
 
543 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4102  sensory histidine kinase DcuS  28.46 
 
 
537 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0489  sensory histidine kinase DcuS  27.03 
 
 
534 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4650  sensory histidine kinase DcuS  27.92 
 
 
543 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.414572  normal  0.461897 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1959  sensory histidine kinase DcuS  29.08 
 
 
533 aa  185  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516955 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4650  sensory histidine kinase DcuS  27.92 
 
 
543 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0065  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  37.37 
 
 
529 aa  185  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633378  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0639  sensory histidine kinase DcuS  27.22 
 
 
534 aa  184  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4567  sensory histidine kinase DcuS  27.87 
 
 
543 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4559  sensory histidine kinase DcuS  27.68 
 
 
543 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2224  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.99 
 
 
541 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.691075  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0490  sensory histidine kinase DcuS  27.66 
 
 
534 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0614  sensory histidine kinase DcuS  27.97 
 
 
534 aa  182  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0545  sensory histidine kinase DcuS  26.84 
 
 
534 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.847766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0576  sensory histidine kinase DcuS  26.84 
 
 
534 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2258  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.84 
 
 
542 aa  177  5e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0498367  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0680  sensor kinase DpiB  29.16 
 
 
553 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.520362  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4725  sensory histidine kinase DcuS  28.48 
 
 
534 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.678206  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0784  sensor kinase DpiB  28.79 
 
 
553 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.636686  normal  0.450792 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0666  sensor kinase DpiB  28.97 
 
 
553 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.863518  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0740  sensor kinase DpiB  28.97 
 
 
553 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2325  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.16 
 
 
531 aa  173  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.18048  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1396  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.79 
 
 
556 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0792453  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0597  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.52 
 
 
524 aa  171  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0511  sensor histidine kinase  27.31 
 
 
516 aa  171  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003319  sensor kinase CitA  31.64 
 
 
539 aa  170  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8198  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.69 
 
 
538 aa  170  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0500  sensor histidine kinase  27.05 
 
 
516 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3249  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.87 
 
 
539 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.710576  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2021  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30 
 
 
534 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3238  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.67 
 
 
539 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.698752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>