72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0344 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 430 aa  847    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4442  polysaccharide biosynthesis protein  38.56 
 
 		 398 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3183  polysaccharide biosynthesis protein  33.59 
 
 		 424 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1078  polysaccharide biosynthesis protein  32.9 
 
 		 424 aa  169  9e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2586  polysaccharide biosynthesis protein  33.85 
 
 		 411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  24.21 
 
 		 440 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  25.42 
 
 		 478 aa  66.6  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3948  polysaccharide biosynthesis protein  26.86 
 
 		 473 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  23.41 
 
 		 444 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  21.38 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2268  polysaccharide biosynthesis protein  25.87 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.199754 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5553  oligosaccharide translocase  27.47 
 
 		 471 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5611  oligosaccharide translocase  27.47 
 
 		 470 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  22.57 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  23.37 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  27.16 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  24.14 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  24.81 
 
 		 490 aa  59.7  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0386  polysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  22.36 
 
 		 477 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3170  polysaccharide biosynthesis protein  25.79 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 504 aa  57.8  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  25.92 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  28.42 
 
 		 489 aa  57.4  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  21.37 
 
 		 476 aa  56.6  0.0000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  22.08 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  29.19 
 
 		 499 aa  56.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5396  oligosaccharide translocase  27.41 
 
 		 473 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  28.87 
 
 		 484 aa  54.7  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  21.57 
 
 		 449 aa  54.7  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  28.21 
 
 		 419 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  24.81 
 
 		 440 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  24.54 
 
 		 488 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  28.41 
 
 		 489 aa  53.5  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  30.32 
 
 		 477 aa  52.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4577  polysaccharide biosynthesis protein  24.06 
 
 		 452 aa  51.2  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  28.89 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 		 471 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0406  polysaccharide biosynthesis protein  27.19 
 
 		 458 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  21.13 
 
 		 466 aa  48.5  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  25.14 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4497  polysaccharide biosynthesis protein  32.58 
 
 		 472 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0243  polysaccharide biosynthesis protein  22.86 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  35.33 
 
 		 495 aa  47.8  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0919  polysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 		 420 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  22.86 
 
 		 448 aa  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2176  exporter of O-antigen and teichoic acid  21.43 
 
 		 456 aa  47.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.311164 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  28.66 
 
 		 490 aa  47.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  28.05 
 
 		 490 aa  47.4  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  26.07 
 
 		 433 aa  46.6  0.0009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  23.31 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  26.23 
 
 		 447 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  29.61 
 
 		 583 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  30.88 
 
 		 475 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  24.61 
 
 		 483 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2124  hypothetical protein  23.7 
 
 		 461 aa  44.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.553505 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  27.22 
 
 		 474 aa  44.7  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1274  polysaccharide export protein  28.85 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212391 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3702  polysaccharide exporter, PST family  23.86 
 
 		 420 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4351  polysaccharide biosynthesis protein  22.15 
 
 		 435 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0736127  normal  0.47272 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  27.43 
 
 		 476 aa  44.3  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  27.43 
 
 		 476 aa  44.3  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  23.22 
 
 		 475 aa  44.3  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  28.12 
 
 		 494 aa  43.9  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  23.19 
 
 		 446 aa  43.9  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  27.81 
 
 		 444 aa  43.9  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  26.83 
 
 		 410 aa  43.9  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  29.19 
 
 		 474 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  22.49 
 
 		 464 aa  43.5  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  23.72 
 
 		 492 aa  43.1  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  25.79 
 
 		 446 aa  43.1  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>