220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0331 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  100 
 
 
946 aa  1878    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  34.7 
 
 
932 aa  371  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  31.81 
 
 
919 aa  316  9.999999999999999e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  43.17 
 
 
416 aa  128  7e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  29.93 
 
 
673 aa  105  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  39.13 
 
 
424 aa  93.2  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3023  S-layer domain-containing protein  33.79 
 
 
408 aa  89.4  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.80605  normal  0.105642 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  29.08 
 
 
330 aa  84.3  0.000000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  43.96 
 
 
485 aa  84.3  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  26.92 
 
 
361 aa  80.5  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  30.65 
 
 
441 aa  80.5  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  27.96 
 
 
255 aa  78.6  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  29.41 
 
 
784 aa  77.8  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  32.79 
 
 
578 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0863  S-layer domain protein  31.3 
 
 
694 aa  76.6  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000121904  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  36.5 
 
 
581 aa  73.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  36.5 
 
 
581 aa  73.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  35.66 
 
 
586 aa  73.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  35.66 
 
 
586 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  28.37 
 
 
343 aa  73.9  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  38.71 
 
 
639 aa  73.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1024  S-layer domain-containing protein  34.4 
 
 
403 aa  72.8  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000117034  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1096  S-layer domain-containing protein  34.4 
 
 
403 aa  72.8  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0047  S-layer domain-containing protein  27.6 
 
 
468 aa  72  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498121  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  41.24 
 
 
641 aa  71.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  37.69 
 
 
543 aa  71.2  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  25.85 
 
 
400 aa  70.9  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000061041  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  38.1 
 
 
551 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  33.79 
 
 
581 aa  68.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  37.31 
 
 
604 aa  68.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  36.72 
 
 
531 aa  68.9  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  32.09 
 
 
539 aa  68.9  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  38.1 
 
 
593 aa  68.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  36.15 
 
 
548 aa  68.2  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  24.31 
 
 
400 aa  68.2  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  38.14 
 
 
666 aa  68.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  38.14 
 
 
666 aa  68.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  38.1 
 
 
591 aa  67.8  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1065  S-layer protein EA1  42.86 
 
 
859 aa  67.8  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000432724  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  34.29 
 
 
550 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  38.28 
 
 
658 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  37.74 
 
 
574 aa  67  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  39.13 
 
 
531 aa  66.6  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  35.67 
 
 
629 aa  67  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  35.34 
 
 
561 aa  67  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  40.4 
 
 
572 aa  66.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  39.5 
 
 
622 aa  65.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  27.27 
 
 
563 aa  66.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  34.42 
 
 
542 aa  66.2  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  22.22 
 
 
1036 aa  65.9  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  38.94 
 
 
529 aa  65.5  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0534  S-layer domain-containing protein  28.32 
 
 
466 aa  65.5  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00470893  normal  0.0913053 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  38.53 
 
 
624 aa  65.5  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0842  S-layer protein EA1  42.86 
 
 
862 aa  65.1  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00698001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0887  s-layer protein ea1  42.86 
 
 
862 aa  65.1  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000735579  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0790  S-layer protein, EA1 protein  42.86 
 
 
861 aa  64.7  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0118731  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  48.44 
 
 
629 aa  64.7  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  39.39 
 
 
550 aa  64.7  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  38.18 
 
 
533 aa  64.7  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  37.61 
 
 
518 aa  64.3  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  37.11 
 
 
632 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  38.39 
 
 
643 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  37.11 
 
 
645 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0519  S-layer domain protein  26.89 
 
 
466 aa  62.4  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.28861  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  32.35 
 
 
524 aa  62  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  34.25 
 
 
491 aa  61.6  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  31.88 
 
 
510 aa  61.2  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1227  S-layer protein, putative  31.41 
 
 
219 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  33.82 
 
 
514 aa  60.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  27.98 
 
 
500 aa  60.8  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  37.37 
 
 
571 aa  60.1  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  35.23 
 
 
575 aa  59.7  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  32.35 
 
 
513 aa  60.1  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  32.62 
 
 
531 aa  60.1  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1683  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.45 
 
 
459 aa  59.3  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00306779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0975  S-layer protein EA1  42.11 
 
 
863 aa  59.7  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000553738 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1180  S-layer domain protein  34.35 
 
 
220 aa  59.3  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0776761  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  30 
 
 
561 aa  59.7  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1818  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.45 
 
 
459 aa  59.3  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000545238  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  34.82 
 
 
606 aa  58.9  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  38.38 
 
 
530 aa  59.3  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  39.08 
 
 
820 aa  59.3  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4159  S-layer domain protein  34.35 
 
 
220 aa  58.9  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.767768  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1285  putative S-layer protein  33.12 
 
 
219 aa  58.5  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0266369  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1028  S-layer protein  39.58 
 
 
220 aa  58.5  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.317814  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  30.13 
 
 
475 aa  58.2  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1050  S-layer protein  30.77 
 
 
218 aa  57.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1208  putative S-layer protein  30.77 
 
 
218 aa  57.8  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.447852 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1629  S-layer protein  31.79 
 
 
470 aa  57.8  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00040233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1130  S-layer protein  30.77 
 
 
218 aa  57.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0431486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3093  S-layer protein  40.22 
 
 
360 aa  57.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000122253  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2990  S-layer protein  40.22 
 
 
360 aa  57.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000541964  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1556  S-layer domain-containing protein  43.28 
 
 
536 aa  57.4  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013554 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3338  S-layer protein  40.22 
 
 
360 aa  57.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656673  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  38.64 
 
 
685 aa  57.4  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3315  putative S-layer protein  40.22 
 
 
360 aa  57.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  31.91 
 
 
555 aa  57.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1787  S-layer protein  31 
 
 
344 aa  56.6  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000174638  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1744  S-layer protein  40.58 
 
 
332 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000139139  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  31.91 
 
 
543 aa  56.6  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>