More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0324 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0324  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
586 aa  1195  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  2.61589e-07  hitchhiker  0.0038707 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2731  extracellular solute-binding protein family 5  43.28 
 
 
622 aa  465  1e-130  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2277  extracellular solute-binding protein family 5  38.65 
 
 
615 aa  407  1e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00527261  decreased coverage  2.10766e-10 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3074  extracellular solute-binding protein family 5  39.46 
 
 
621 aa  380  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  1.49398e-06  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 
617 aa  206  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  2.97428e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  31.24 
 
 
639 aa  204  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  2.68642e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.28 
 
 
556 aa  166  1e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3875  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.15 
 
 
568 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 
541 aa  150  9e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  25.37 
 
 
576 aa  146  9e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1356  extracellular solute-binding protein family 5  26.25 
 
 
596 aa  142  2e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.19 
 
 
538 aa  140  9e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 
540 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 
538 aa  139  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0892  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 
596 aa  137  7e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3874  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.36 
 
 
585 aa  136  1e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  23.71 
 
 
546 aa  135  2e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  7.75897e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  23.94 
 
 
581 aa  135  2e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  23.64 
 
 
533 aa  133  8e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 
539 aa  130  8e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  1.25789e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2321  extracellular solute-binding protein family 5  23.59 
 
 
580 aa  130  9e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.815964 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2270  extracellular solute-binding protein family 5  23.59 
 
 
580 aa  130  9e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  22.56 
 
 
540 aa  129  1e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2944  extracellular solute-binding protein family 5  25.39 
 
 
587 aa  128  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0305195 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  22.37 
 
 
534 aa  127  4e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0093  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 
604 aa  126  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0197  extracellular solute-binding protein  29.59 
 
 
605 aa  126  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386701  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6956  oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  25.19 
 
 
571 aa  126  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2770  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 
603 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.14158  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1563  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 
588 aa  123  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  0.279007 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6955  oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  25.72 
 
 
597 aa  123  1e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0608  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 
566 aa  122  1e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4579  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 
596 aa  122  2e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1410  extracellular solute-binding protein family 5  25.59 
 
 
615 aa  119  2e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3496  extracellular solute-binding protein  22.6 
 
 
590 aa  118  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 
508 aa  118  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  24.83 
 
 
535 aa  117  7e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  24.16 
 
 
524 aa  116  1e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  22.46 
 
 
565 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2082  ABC transporter, binding protein component  24.73 
 
 
605 aa  113  1e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3294  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 
573 aa  112  1e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.207016 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 
567 aa  112  2e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0520  extracellular solute-binding protein family 5  24.1 
 
 
545 aa  112  2e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  24.83 
 
 
580 aa  112  2e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  3.07469e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0715  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 
565 aa  111  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109389  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  24.61 
 
 
563 aa  111  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15570  extracellular solute-binding protein, family 5  25.55 
 
 
619 aa  111  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497629  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 
581 aa  111  4e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  23.3 
 
 
607 aa  111  4e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  24.17 
 
 
584 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 
555 aa  110  7e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 
591 aa  110  8e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0383  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 
618 aa  110  9e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.531894  normal  0.778896 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 
503 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  23.53 
 
 
567 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  24.74 
 
 
522 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  24.57 
 
 
526 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  23.3 
 
 
607 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  25.11 
 
 
503 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  21.92 
 
 
551 aa  108  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  25.21 
 
 
525 aa  108  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4599  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 
621 aa  107  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.593059  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0900  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 
561 aa  107  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.26 
 
 
532 aa  107  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  22.88 
 
 
566 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  23.95 
 
 
515 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  23.61 
 
 
575 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3058  extracellular solute-binding protein family 5  23.37 
 
 
554 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104524 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  24.16 
 
 
552 aa  105  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  23.61 
 
 
575 aa  105  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.79 
 
 
575 aa  105  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  27.27 
 
 
580 aa  104  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  27.27 
 
 
579 aa  104  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 
595 aa  104  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0691  extracellular solute-binding protein family 5  23.29 
 
 
600 aa  103  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1143  extracellular solute-binding protein family 5  26.76 
 
 
577 aa  103  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0057674  normal  0.283725 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  24.01 
 
 
538 aa  103  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.67 
 
 
567 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  23.76 
 
 
587 aa  102  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4534  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  24.63 
 
 
504 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7448  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.35 
 
 
626 aa  102  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338891  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  23.52 
 
 
604 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 
549 aa  100  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.73 
 
 
511 aa  100  8e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  4.30411e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4211  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 
504 aa  100  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744589  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  24.51 
 
 
575 aa  100  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0145  extracellular solute-binding protein family 5  24.16 
 
 
552 aa  100  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2023  extracellular solute-binding protein family 5  22.83 
 
 
531 aa  100  9e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0292401  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  24.49 
 
 
516 aa  99.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 
575 aa  99.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 
529 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  22.54 
 
 
529 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2999  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 
549 aa  99.4  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305947  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1765  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.7 
 
 
596 aa  99.4  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.220703  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.79 
 
 
524 aa  99  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0190  extracellular solute-binding protein  22.04 
 
 
533 aa  99  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0614  extracellular solute-binding protein family 5  23.48 
 
 
593 aa  99  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459899  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1367  extracellular solute-binding protein family 5  26.49 
 
 
577 aa  98.6  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0090511  hitchhiker  0.000580883 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  22.05 
 
 
535 aa  98.6  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  23.13 
 
 
529 aa  98.6  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>