74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0312 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0312  hypothetical protein  100 
 
 		 775 aa  1508    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0887413  decreased coverage  0.00223033 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3255  hypothetical protein  28.99 
 
 		 612 aa  138  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  33.14 
 
 		 1989 aa  100  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  27.68 
 
 		 1293 aa  92.8  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  29.19 
 
 		 3921 aa  80.1  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  30.81 
 
 		 2573 aa  77.8  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0749  conserved repeat domain-containing protein  26.97 
 
 		 1129 aa  77.4  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  36.41 
 
 		 3191 aa  76.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  32.99 
 
 		 1118 aa  76.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  40.8 
 
 		 907 aa  71.2  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  29.67 
 
 		 1537 aa  70.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1461  hypothetical protein  28.52 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000257739  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  30.29 
 
 		 4896 aa  68.6  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  29.77 
 
 		 3634 aa  68.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  41.8 
 
 		 826 aa  65.5  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  39.5 
 
 		 3324 aa  62  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3112  hypothetical protein  27.57 
 
 		 744 aa  62  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0359338  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  36.76 
 
 		 1519 aa  60.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  27.37 
 
 		 983 aa  60.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1410  hypothetical protein  35.53 
 
 		 1038 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  35.16 
 
 		 3602 aa  58.9  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3754  hypothetical protein  40.95 
 
 		 801 aa  58.2  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.635488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  34.81 
 
 		 2487 aa  57.8  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0886  hypothetical protein  50 
 
 		 827 aa  57.8  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  28.29 
 
 		 2121 aa  57  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1880  conserved repeat domain protein  28.57 
 
 		 440 aa  56.6  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.152286  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  26.2 
 
 		 2520 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  32.65 
 
 		 3471 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  23.88 
 
 		 3471 aa  55.5  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  22 
 
 		 676 aa  55.1  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2599  hypothetical protein  39.2 
 
 		 726 aa  55.1  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0060  hypothetical protein  46.81 
 
 		 468 aa  54.3  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2441  hypothetical protein  32.26 
 
 		 643 aa  54.3  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  24.15 
 
 		 5298 aa  53.9  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  32.52 
 
 		 587 aa  53.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  23.82 
 
 		 3521 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  25.57 
 
 		 2490 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09240  conserved repeat protein  34.62 
 
 		 2912 aa  52.8  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  24.23 
 
 		 3472 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  24.77 
 
 		 2485 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  26.44 
 
 		 2113 aa  52  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4798  cell surface protein, anchor  22.33 
 
 		 2025 aa  51.6  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  46.3 
 
 		 1779 aa  51.6  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  25.23 
 
 		 2490 aa  51.6  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  27.34 
 
 		 2490 aa  51.2  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5066  hypothetical protein  29.41 
 
 		 807 aa  51.2  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  28.06 
 
 		 2490 aa  50.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  28.06 
 
 		 2358 aa  50.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  28.06 
 
 		 2358 aa  50.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4941  hypothetical protein  30.18 
 
 		 845 aa  49.3  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0859388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1176  hypothetical protein  34.35 
 
 		 1202 aa  48.9  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  27.7 
 
 		 2490 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  33.11 
 
 		 5517 aa  48.1  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2276  proprotein convertase, P  34.44 
 
 		 644 aa  48.1  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4951  hypothetical protein  32.23 
 
 		 3394 aa  48.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  27.82 
 
 		 1809 aa  47.8  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3132  polymorphic membrane protein  36.75 
 
 		 546 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  23.2 
 
 		 3409 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  27.7 
 
 		 1150 aa  47.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3674  conserved repeat domain protein  28.57 
 
 		 1533 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  25.57 
 
 		 2490 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0310  hypothetical protein  30.6 
 
 		 924 aa  46.2  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0718706 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  32.49 
 
 		 2520 aa  46.2  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2801  conserved repeat domain protein  29.77 
 
 		 900 aa  45.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  27.47 
 
 		 2487 aa  45.4  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5514  hypothetical protein  36.52 
 
 		 1504 aa  45.4  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1059 aa  44.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1264  conserved repeat domain protein  40.45 
 
 		 686 aa  44.7  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2348  hypothetical protein  36.44 
 
 		 545 aa  44.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  37.11 
 
 		 5017 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  27.67 
 
 		 1441 aa  44.3  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  37.37 
 
 		 3737 aa  44.3  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  37.11 
 
 		 5010 aa  44.3  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0751  conserved repeat domain-containing protein  31.16 
 
 		 909 aa  44.3  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.149924  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>