13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0311 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0311  hypothetical protein  100 
 
 		 1063 aa  2084    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.427486  decreased coverage  0.00324581 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2800  protein of unknown function DUF11  33.81 
 
 		 1861 aa  419  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.515437  normal  0.451772 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0750  hypothetical protein  33.21 
 
 		 1861 aa  402  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2438  hypothetical protein  32.2 
 
 		 562 aa  129  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2435  hypothetical protein  34.15 
 
 		 689 aa  127  8.000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1515  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1580 aa  95.1  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0406  hypothetical protein  23.64 
 
 		 2418 aa  79  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205563 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5943  conserved repeat domain protein  26.32 
 
 		 2434 aa  78.2  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1046  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1757 aa  73.2  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.273403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3254  hypothetical protein  25.35 
 
 		 2118 aa  65.5  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55976  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4948  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1278 aa  55.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0046  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1260 aa  48.5  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744748  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2415  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1260 aa  48.5  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.633946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>