162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0234 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 		 342 aa  694    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  50 
 
 		 339 aa  328  6e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  47.81 
 
 		 343 aa  325  8.000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  49.12 
 
 		 339 aa  320  1.9999999999999998e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  50.73 
 
 		 343 aa  320  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  48.99 
 
 		 344 aa  317  1e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  47.21 
 
 		 344 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  49.71 
 
 		 342 aa  311  9e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  46.65 
 
 		 344 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  46.11 
 
 		 344 aa  291  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  43.06 
 
 		 346 aa  291  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  44.83 
 
 		 344 aa  281  8.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.82 
 
 		 343 aa  281  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  45.09 
 
 		 344 aa  281  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  41.4 
 
 		 343 aa  278  8e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  43.4 
 
 		 346 aa  278  8e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  40.52 
 
 		 343 aa  278  1e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  41.4 
 
 		 343 aa  276  5e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.06 
 
 		 338 aa  275  8e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  41.98 
 
 		 343 aa  270  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.11 
 
 		 341 aa  269  4e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  43.23 
 
 		 346 aa  269  5.9999999999999995e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.27 
 
 		 343 aa  267  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  41.4 
 
 		 342 aa  266  2.9999999999999995e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  44.31 
 
 		 343 aa  265  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.7 
 
 		 344 aa  261  8.999999999999999e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.76 
 
 		 343 aa  261  8.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  39.48 
 
 		 343 aa  261  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  43.4 
 
 		 344 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  38.48 
 
 		 343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  38.19 
 
 		 343 aa  243  5e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.07 
 
 		 343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  36.72 
 
 		 598 aa  214  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  34.81 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  36.98 
 
 		 580 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  36.55 
 
 		 559 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  33.82 
 
 		 545 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  35.4 
 
 		 570 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  35.22 
 
 		 553 aa  186  7e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  38.51 
 
 		 326 aa  182  7e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  31.64 
 
 		 550 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.07 
 
 		 339 aa  178  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  35.86 
 
 		 339 aa  176  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.82 
 
 		 544 aa  176  7e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  37.13 
 
 		 525 aa  169  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.46 
 
 		 731 aa  169  8e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  30.86 
 
 		 325 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  38.21 
 
 		 594 aa  165  9e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  31.78 
 
 		 731 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  30.03 
 
 		 727 aa  160  4e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.93 
 
 		 339 aa  160  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.75 
 
 		 334 aa  159  5e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.2 
 
 		 350 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.61 
 
 		 347 aa  155  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  30.92 
 
 		 325 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  30.59 
 
 		 325 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.33 
 
 		 350 aa  150  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  30.9 
 
 		 336 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  32.96 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  30.51 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  33.33 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.08 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  31.23 
 
 		 336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.29 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.52 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.96 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  34.2 
 
 		 336 aa  133  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  32.75 
 
 		 337 aa  132  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  28.32 
 
 		 331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.67 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  27.3 
 
 		 333 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.41 
 
 		 331 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.44 
 
 		 332 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.94 
 
 		 331 aa  126  5e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0708  CRISPR-associated protein Cas1  31.55 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000161833  hitchhiker  0.00702489 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  27.89 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  29.53 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.95 
 
 		 332 aa  123  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  28.1 
 
 		 558 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  26.88 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.84 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  27.38 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  26.11 
 
 		 330 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  25.08 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.39 
 
 		 330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.07 
 
 		 330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.13 
 
 		 319 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  27.9 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.79 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.22 
 
 		 330 aa  112  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1630  CRISPR-associated protein Cas1  28.19 
 
 		 360 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.010071  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0573  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.95 
 
 		 398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00904377  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  27.25 
 
 		 331 aa  110  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  29.33 
 
 		 329 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.4 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.6 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  27.65 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  25 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1127  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.97 
 
 		 333 aa  106  7e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.168006  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0445  CRISPR-associated protein Cas1  25.16 
 
 		 384 aa  105  9e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>