More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0221 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0221  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 412 aa  841    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2910  glycine hydroxymethyltransferase  79.05 
 
 		 410 aa  630  1e-179  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0959  Glycine hydroxymethyltransferase  70.32 
 
 		 410 aa  573  1.0000000000000001e-162  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.587194  normal  0.162631 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  61.04 
 
 		 418 aa  500  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  63.73 
 
 		 422 aa  498  1e-140  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 427 aa  496  1e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 427 aa  496  1e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  62.28 
 
 		 427 aa  491  9.999999999999999e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  60.92 
 
 		 424 aa  491  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  60.64 
 
 		 412 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  61.24 
 
 		 415 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  59.85 
 
 		 410 aa  488  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  59.16 
 
 		 413 aa  491  1e-137  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1155  serine hydroxymethyltransferase  59.72 
 
 		 436 aa  486  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  58.56 
 
 		 415 aa  486  1e-136  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  60.55 
 
 		 415 aa  485  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  61.04 
 
 		 415 aa  486  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  59.6 
 
 		 410 aa  484  1e-136  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  60.64 
 
 		 411 aa  486  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  58.31 
 
 		 427 aa  486  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4802  serine hydroxymethyltransferase  62.32 
 
 		 427 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  60.55 
 
 		 411 aa  481  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  60.25 
 
 		 412 aa  483  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 417 aa  482  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0389  serine hydroxymethyltransferase  59.35 
 
 		 436 aa  483  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285606 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  57.21 
 
 		 424 aa  481  1e-135  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 		 415 aa  484  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 412 aa  482  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3410  serine hydroxymethyltransferase  59.61 
 
 		 424 aa  482  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.751124  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0256  serine hydroxymethyltransferase  59.85 
 
 		 411 aa  482  1e-135  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.666958 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  59.31 
 
 		 415 aa  482  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 		 415 aa  482  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  60.3 
 
 		 415 aa  480  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  59.06 
 
 		 412 aa  478  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  54.88 
 
 		 423 aa  480  1e-134  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  60.79 
 
 		 413 aa  480  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  58.66 
 
 		 416 aa  480  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  60.55 
 
 		 429 aa  479  1e-134  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  60.79 
 
 		 431 aa  479  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  59.31 
 
 		 422 aa  479  1e-134  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  58.56 
 
 		 411 aa  478  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4027  glycine hydroxymethyltransferase  57.55 
 
 		 421 aa  479  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17117  normal  0.0123375 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  59.27 
 
 		 427 aa  479  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  57.57 
 
 		 425 aa  481  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_002950  PG0042  serine hydroxymethyltransferase  56.29 
 
 		 426 aa  476  1e-133  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  57.32 
 
 		 423 aa  475  1e-133  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  59.01 
 
 		 412 aa  475  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1617  serine hydroxymethyltransferase  57.52 
 
 		 424 aa  475  1e-133  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  58.31 
 
 		 423 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4132  serine hydroxymethyltransferase  61.6 
 
 		 417 aa  475  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000588766  normal  0.517769 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  59.01 
 
 		 412 aa  475  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  57.57 
 
 		 423 aa  475  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1630  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  58.98 
 
 		 566 aa  477  1e-133  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  55.9 
 
 		 425 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  55.9 
 
 		 425 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  58.56 
 
 		 411 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2076  serine hydroxymethyltransferase  59.55 
 
 		 427 aa  473  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.745833  hitchhiker  0.000706319 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  59.2 
 
 		 420 aa  473  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  57.82 
 
 		 423 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  58.84 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  58.05 
 
 		 437 aa  474  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  58.6 
 
 		 417 aa  471  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  58.84 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  58.35 
 
 		 417 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  57.92 
 
 		 413 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  57.92 
 
 		 413 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  58.6 
 
 		 417 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  58.17 
 
 		 414 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  58.17 
 
 		 414 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  57.92 
 
 		 414 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  57.92 
 
 		 413 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09233  serine hydroxymethyltransferase  57.95 
 
 		 439 aa  469  1.0000000000000001e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.293634  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  58.94 
 
 		 417 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  58.17 
 
 		 413 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3814  serine hydroxymethyltransferase  55.35 
 
 		 433 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.866873  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  57.32 
 
 		 416 aa  468  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  58.21 
 
 		 417 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  58.17 
 
 		 413 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  58.94 
 
 		 417 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  58.6 
 
 		 417 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1678  serine hydroxymethyltransferase  61.56 
 
 		 426 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  61.1 
 
 		 420 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  58.71 
 
 		 412 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  61.46 
 
 		 413 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  58.6 
 
 		 417 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  57.67 
 
 		 413 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  57.73 
 
 		 417 aa  467  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  58.11 
 
 		 417 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  57.8 
 
 		 417 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  57.56 
 
 		 417 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  58.35 
 
 		 417 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  58.11 
 
 		 417 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  57.61 
 
 		 412 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  57.8 
 
 		 417 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  59.08 
 
 		 417 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  59.55 
 
 		 415 aa  466  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1344  serine hydroxymethyltransferase  59.08 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  57.18 
 
 		 413 aa  461  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  58.52 
 
 		 412 aa  462  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0275  serine hydroxymethyltransferase  55.11 
 
 		 422 aa  461  1e-129  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.246164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>