92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0213 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0213  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 
154 aa  310  3.9999999999999997e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2694  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  64.79 
 
 
153 aa  196  7.999999999999999e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0998879  normal  0.661336 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  57.53 
 
 
149 aa  175  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.667187  normal  0.46376 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0971  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.82 
 
 
269 aa  77.4  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301105  normal  0.374469 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2235  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.87 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000000688113  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0040  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.73 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.97 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2073  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  31.97 
 
 
980 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.576081  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0339  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.97 
 
 
241 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.30715 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0056  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.53 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752516  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5862  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.94 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1744  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  31.94 
 
 
1011 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.919932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2052  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  31.94 
 
 
1011 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.806962 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2185  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  30.61 
 
 
1012 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3719  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  29.29 
 
 
983 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0844  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.78 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777561  hitchhiker  0.00161698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  28.86 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0644  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.49 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0290775  normal  0.389247 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.17 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3679  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.1 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5890  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  32.41 
 
 
1012 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614012  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1781  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.1 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4327  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.67 
 
 
154 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0848  carbon-monoxide dehydrogenase  27.97 
 
 
997 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.682595 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0023  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.8 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137248 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.52 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.85 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2531  hypothetical protein  24.67 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.46 
 
 
216 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3296  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  32.86 
 
 
987 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0204451  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.65 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30 
 
 
151 aa  61.6  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6673  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  29.73 
 
 
1019 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.581747  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.41 
 
 
147 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.17 
 
 
154 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2608  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.35 
 
 
148 aa  60.8  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1525  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.59 
 
 
176 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.187738  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4723  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  30.5 
 
 
991 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102833  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.32 
 
 
155 aa  60.5  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2879  hypothetical protein  27.59 
 
 
176 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434233  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0032  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  29.2 
 
 
206 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.262475 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0470  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.52 
 
 
213 aa  58.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0235  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  21.53 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.548712  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1141  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.31 
 
 
178 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.654627  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0072  putative carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.2 
 
 
246 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766775  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2147  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  29.93 
 
 
208 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.295033  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1445  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.66 
 
 
158 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.101992  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1464  hypothetical protein  25.58 
 
 
213 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1283  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.66 
 
 
158 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.112632  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0298  hypothetical protein  26.11 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0284  hypothetical protein  26.11 
 
 
150 aa  55.1  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0365  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.32 
 
 
198 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0368  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.62 
 
 
152 aa  54.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4356  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  22.14 
 
 
232 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0668  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  26.95 
 
 
988 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295598  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1349  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.41 
 
 
224 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1413  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.41 
 
 
224 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  0.135915 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25 
 
 
193 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1874  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.24 
 
 
223 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2526  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.71 
 
 
181 aa  51.2  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1301  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  30.95 
 
 
988 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.648743 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2661  putative carbon monoxide dehydrogenase  30.5 
 
 
176 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283506  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20930  hypothetical protein  25.36 
 
 
221 aa  50.4  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.451934  normal  0.0186523 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2767  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.97 
 
 
185 aa  49.7  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1232  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.17 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.304231 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0573  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.56 
 
 
197 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1350  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.71 
 
 
146 aa  48.1  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1865  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.86 
 
 
254 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1598  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.14 
 
 
204 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3597  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  21.58 
 
 
254 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237636  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1564  carbon monoxide dehydrogenase, large subunit apoprotein  25.35 
 
 
1027 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151361  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4984  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.79 
 
 
240 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.990283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4601  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.79 
 
 
240 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3913  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.97 
 
 
221 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0164888  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4689  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.79 
 
 
240 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.969168 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0420  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.9 
 
 
182 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110218  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4562  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.67 
 
 
306 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3210  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.29 
 
 
237 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.924727  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1572  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.14 
 
 
241 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615405  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0569  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.22 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0217411 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0168  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.4 
 
 
220 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0360  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.3 
 
 
187 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1636  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.67 
 
 
237 aa  44.3  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4535  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.39 
 
 
202 aa  44.3  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6656  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.66 
 
 
222 aa  44.3  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.03 
 
 
225 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0343994  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13140  hypothetical protein  30.56 
 
 
262 aa  43.9  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5184  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.38 
 
 
232 aa  43.9  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1731  Polyketide cyclase/dehydrase  27.54 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1814  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25 
 
 
208 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96745  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0323  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.65 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.108056  normal  0.0606842 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1798  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000155018  normal  0.388936 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>