More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0198 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 		 322 aa  644    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  49 
 
 		 313 aa  283  2.0000000000000002e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2083  cobalamin synthesis protein P47K  47.84 
 
 		 311 aa  265  8.999999999999999e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.083483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  38.22 
 
 		 323 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  35.67 
 
 		 319 aa  206  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  36.28 
 
 		 335 aa  206  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  35.88 
 
 		 349 aa  205  8e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  38.49 
 
 		 332 aa  205  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.67 
 
 		 316 aa  202  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  35.35 
 
 		 316 aa  202  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.03 
 
 		 316 aa  202  6e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.67 
 
 		 316 aa  202  8e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.67 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.71 
 
 		 316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.03 
 
 		 319 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  36.31 
 
 		 404 aa  200  3e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.03 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  35.19 
 
 		 350 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  34.29 
 
 		 323 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  34.71 
 
 		 316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  35.5 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  35.29 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  36 
 
 		 364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  34.71 
 
 		 319 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  35.46 
 
 		 323 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  33.86 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  33.86 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  37.03 
 
 		 320 aa  192  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  36.97 
 
 		 343 aa  192  5e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  34.6 
 
 		 323 aa  192  5e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  36.54 
 
 		 320 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  35.87 
 
 		 328 aa  192  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  35.87 
 
 		 328 aa  192  6e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  34.88 
 
 		 329 aa  192  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  35.71 
 
 		 354 aa  192  9e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  33.52 
 
 		 353 aa  191  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35 
 
 		 345 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  32.76 
 
 		 355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  36.86 
 
 		 320 aa  189  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  34.39 
 
 		 353 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  36.1 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  33.82 
 
 		 361 aa  187  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  33.91 
 
 		 355 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  32.58 
 
 		 363 aa  185  8e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  32.77 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  36.16 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  33.99 
 
 		 358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  32.85 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  35.24 
 
 		 337 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29990  predicted protein  33.54 
 
 		 339 aa  182  9.000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120572  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  32.79 
 
 		 369 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.52 
 
 		 374 aa  179  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  34.38 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  31.73 
 
 		 365 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  36 
 
 		 328 aa  172  9e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  29.88 
 
 		 394 aa  171  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  35.02 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  30.68 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  33.14 
 
 		 360 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  30.84 
 
 		 347 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5092  cobalamin synthesis protein P47K  37.07 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2571  normal  0.304684 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  30.77 
 
 		 362 aa  167  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  31.66 
 
 		 346 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  30.68 
 
 		 353 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  42.5 
 
 		 460 aa  165  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  42.42 
 
 		 460 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  43.94 
 
 		 449 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  42.42 
 
 		 460 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  40.71 
 
 		 493 aa  164  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  43.43 
 
 		 449 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  43 
 
 		 452 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  40.72 
 
 		 457 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  42.93 
 
 		 449 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5963  cobalamin synthesis protein P47K  37.07 
 
 		 372 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103061  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7138  cobalamin synthesis protein P47K  31.41 
 
 		 360 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775863  normal  0.480911 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  29.71 
 
 		 349 aa  161  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  43.41 
 
 		 393 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2305  cobalamin synthesis protein, P47K  33.96 
 
 		 329 aa  159  8e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.394905  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  29.11 
 
 		 373 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  32.04 
 
 		 375 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2829  cobalamin synthesis protein P47K  32.98 
 
 		 406 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62152 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  30.53 
 
 		 380 aa  157  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3924  cobalamin synthesis protein P47K  37.05 
 
 		 344 aa  156  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0777863  normal  0.0144678 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  28.35 
 
 		 327 aa  156  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3017  cobalamin synthesis protein P47K  32.98 
 
 		 415 aa  155  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  36.12 
 
 		 377 aa  155  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0634  cobalamin synthesis protein/P47K  31.79 
 
 		 369 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1001  cobalamin synthesis protein, P47K  32.42 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  29.8 
 
 		 353 aa  153  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  29.19 
 
 		 346 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5629  cobalamin synthesis protein P47K  36.65 
 
 		 361 aa  152  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431844  normal  0.176187 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  30.48 
 
 		 366 aa  153  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  33.24 
 
 		 388 aa  153  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  30.57 
 
 		 352 aa  152  7e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  29.55 
 
 		 349 aa  151  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1160  cobalamin synthesis protein, P47K  33.61 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0507  cobalamin synthesis protein P47K  33.05 
 
 		 377 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  39.39 
 
 		 378 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  39.39 
 
 		 378 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  28.9 
 
 		 346 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>