More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0193 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0193  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
305 aa  607  1e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0825  alpha/beta hydrolase fold protein  39.67 
 
 
287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1531  alpha/beta hydrolase fold protein  40.61 
 
 
285 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.895965  normal  0.548298 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1623  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8158  alpha/beta hydrolase fold protein  30.84 
 
 
282 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2329  hydrolase, alpha/beta fold family  26.17 
 
 
291 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000968473  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  41.54 
 
 
283 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3126  hydrolase, alpha/beta fold family  25.16 
 
 
301 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.83373  normal  0.0124269 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  26.33 
 
 
286 aa  89.4  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2000  proline iminopeptidase  25.25 
 
 
301 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2962  proline iminopeptidase  25 
 
 
296 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.305011  normal  0.0401306 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2247  alpha/beta fold family hydrolase  24.35 
 
 
291 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371226  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2199  hydrolase, alpha/beta fold family  25.93 
 
 
291 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  28 
 
 
302 aa  87.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2245  hydrolase, alpha/beta fold family  24.92 
 
 
301 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1528899999999994e-27 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2370  proline iminopeptidase  24.29 
 
 
296 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2061  alpha/beta fold family hydrolase  24.92 
 
 
301 aa  86.3  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2217  alpha/beta fold family hydrolase  24.92 
 
 
303 aa  86.3  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.716655  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2042  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 
291 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2001  proline iminopeptidase  24.58 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000475333  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  24.49 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4916  proline iminopeptidase  44.06 
 
 
312 aa  82.8  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  27.97 
 
 
298 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5122  alpha/beta hydrolase fold protein  35.04 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  41.8 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5500  putative prolyl aminopeptidase  35.38 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0980519  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1402  proline iminopeptidase  31.94 
 
 
322 aa  75.5  0.0000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2133  proline iminopeptidase  44.23 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5819  prolyl aminopeptidase  44.12 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07350  prolyl aminopeptidase  41.13 
 
 
332 aa  74.7  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3629  Alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.611576  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67110  prolyl aminopeptidase  42.16 
 
 
323 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  40.2 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  41.46 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0431  proline iminopeptidase  39.68 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284518  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  39.83 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  39.06 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1122  proline iminopeptidase  36.71 
 
 
339 aa  72.8  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.29642  normal  0.0858208 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  41.18 
 
 
316 aa  72.4  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  39.22 
 
 
323 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0513  proline iminopeptidase  39.81 
 
 
323 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4474  proline iminopeptidase  42.06 
 
 
310 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.261766  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04582  proline iminopeptidase  38.93 
 
 
313 aa  72  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0717  proline iminopeptidase  41.46 
 
 
320 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.922147  normal  0.435096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0825  alpha/beta hydrolase fold protein  39.62 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2620  proline iminopeptidase  33.33 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000526602  normal  0.51631 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  33.58 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1603  prolyl aminopeptidase  40 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3526  proline iminopeptidase  40.65 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4151  proline iminopeptidase  39.84 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4009  proline iminopeptidase  40.65 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.241684 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1940  proline iminopeptidase  37.8 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  32.84 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1084  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 
335 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.63067  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0515  alpha/beta hydrolase fold  34.34 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3408  proline iminopeptidase  40.65 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.872292  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4251  proline iminopeptidase  40.65 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130879  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36840  proline iminopeptidase  41.54 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0362084  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4115  proline iminopeptidase  40.65 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2262  proline iminopeptidase  40.78 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181325  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0689  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574556  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1122  proline iminopeptidase  43.22 
 
 
316 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.332223  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0771  proline iminopeptidase  36.97 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.270138  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3091  proline iminopeptidase  36.07 
 
 
319 aa  69.3  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133982  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4387  proline iminopeptidase  36.8 
 
 
326 aa  69.3  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000828974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1877  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
310 aa  69.3  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.175585  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  38.24 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2838  proline iminopeptidase  34.48 
 
 
321 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00251437  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3920  proline iminopeptidase  39.84 
 
 
317 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.805731 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4902  proline iminopeptidase  38.24 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01230  proline iminopeptidase  40.95 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0712  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  38.66 
 
 
314 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0121198  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  41.75 
 
 
323 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3807  proline iminopeptidase  39.84 
 
 
317 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.180049 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1894  proline iminopeptidase  37.4 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  38.24 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  38.24 
 
 
323 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1492  proline iminopeptidase  34.85 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0426318  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0373  proline iminopeptidase  39.02 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1876  proline iminopeptidase  39.02 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756215  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1033  proline iminopeptidase  41.27 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105269  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2193  proline iminopeptidase  38.21 
 
 
414 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3473  proline iminopeptidase  39.52 
 
 
329 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.598272  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0886  proline iminopeptidase  39.02 
 
 
429 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424986  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1173  proline iminopeptidase  39.02 
 
 
429 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2151  proline iminopeptidase  39.02 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0279  proline iminopeptidase  39.02 
 
 
429 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237584  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2349  prolyl aminopeptidase  38.58 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34102  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3492  prolyl aminopeptidase  39.84 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.652932  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1929  prolyl aminopeptidase  37.4 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0601  proline iminopeptidase  35.94 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1559  alpha/beta hydrolase fold protein  36.59 
 
 
284 aa  67  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0478161  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1180  proline iminopeptidase  39.84 
 
 
320 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  0.812597 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0887  prolyl aminopeptidase  35.56 
 
 
320 aa  67  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1728  proline iminopeptidase  38.21 
 
 
436 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4965  proline iminopeptidase  38.21 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328745  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  37.23 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  35.38 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>