40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0097 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0097  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 311 aa  613  9.999999999999999e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.848842  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0623  twin-arginine translocation pathway signal  63.8 
 
 		 296 aa  307  1.0000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.846977 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0940  hypothetical protein  56.27 
 
 		 297 aa  303  3.0000000000000004e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1323  dessication-associated protein  52.98 
 
 		 307 aa  269  5e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.693322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0162  hypothetical protein  47.04 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.390523 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5246  hypothetical protein  44.22 
 
 		 290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.435436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5785  hypothetical protein  44.62 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150184  hitchhiker  0.00326204 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1051  hypothetical protein  43.14 
 
 		 326 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3428  hypothetical protein  44.68 
 
 		 325 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6576  hypothetical protein  44.71 
 
 		 325 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3704  hypothetical protein  39.06 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2811  hypothetical protein  36.53 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1522  hypothetical protein  32.84 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4517  hypothetical protein  32.86 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4335  hypothetical protein  32.85 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5433  hypothetical protein  32.57 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.447331  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1458  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0671711  normal  0.0432371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5555  hypothetical protein  33.73 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0629  hypothetical protein  29.77 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0630  hypothetical protein  29.78 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1457  hypothetical protein  32.26 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.036624  normal  0.0457082 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3504  twin-arginine translocation pathway signal  33.73 
 
 		 203 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4334  hypothetical protein  31.18 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1613  hypothetical protein  34.09 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.262413  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1587  hypothetical protein  34.91 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.0327578 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3240  hypothetical protein  30.99 
 
 		 241 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.769724 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1645  hypothetical protein  30.06 
 
 		 320 aa  55.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0388574 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3241  conserved hypothetical protein, secreted  26.83 
 
 		 262 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2716  hypothetical protein  32.74 
 
 		 216 aa  53.9  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0285801  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1614  hypothetical protein  29.73 
 
 		 248 aa  53.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.328172  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5421  hypothetical protein  29.59 
 
 		 222 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.320411  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2810  hypothetical protein  24.05 
 
 		 239 aa  49.7  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.364259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1665  twin-arginine translocation pathway signal  29.65 
 
 		 228 aa  49.7  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267089  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5422  hypothetical protein  29.41 
 
 		 209 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817274  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0385  hypothetical protein  26.82 
 
 		 234 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4516  hypothetical protein  31.61 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3503  twin-arginine translocation pathway signal  26.11 
 
 		 228 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5556  hypothetical protein  28.83 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5432  conserved hypothetical protein, secreted  26.13 
 
 		 263 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0701309 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1586  hypothetical protein  29.59 
 
 		 240 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200822  normal  0.0181196 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>