More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0083 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0083  FolC bifunctional protein  100 
 
 
404 aa  795    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2502  FolC bifunctional protein  44.83 
 
 
389 aa  250  4e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.274647 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2632  FolC bifunctional protein  45.36 
 
 
403 aa  247  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  39.01 
 
 
414 aa  199  6e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0333  FolC bifunctional protein  42.12 
 
 
414 aa  192  9e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0256813  normal  0.0230172 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  34.76 
 
 
431 aa  187  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  30.36 
 
 
429 aa  183  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  36.57 
 
 
421 aa  180  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1236  FolC bifunctional protein  37.91 
 
 
428 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  37.29 
 
 
424 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  35.95 
 
 
424 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0949  FolC bifunctional protein  34.55 
 
 
433 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  33.1 
 
 
440 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3284  dihydropteroate synthase  34.43 
 
 
847 aa  170  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  29.9 
 
 
424 aa  169  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  35.04 
 
 
424 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  29.22 
 
 
441 aa  168  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  37.2 
 
 
425 aa  168  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  29.22 
 
 
433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  33.94 
 
 
431 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  28.77 
 
 
441 aa  167  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  34.25 
 
 
437 aa  164  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  29.22 
 
 
433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  29.22 
 
 
433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  29.22 
 
 
433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  34.41 
 
 
878 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  29.22 
 
 
433 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  28.44 
 
 
428 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  36.45 
 
 
434 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  28.03 
 
 
433 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  28.03 
 
 
433 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  31.52 
 
 
435 aa  162  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  37.9 
 
 
425 aa  162  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  28.27 
 
 
433 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  29.86 
 
 
427 aa  161  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  31.52 
 
 
437 aa  161  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  28.94 
 
 
433 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  29.12 
 
 
433 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  33.75 
 
 
412 aa  160  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  27.55 
 
 
433 aa  160  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1830  FolC bifunctional protein  33.25 
 
 
432 aa  159  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0684286  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  32.06 
 
 
817 aa  159  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3755  FolC bifunctional protein  39.22 
 
 
461 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0263882  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  30.4 
 
 
424 aa  157  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  28.1 
 
 
432 aa  157  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1299  FolC bifunctional protein  36.82 
 
 
435 aa  157  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2353  FolC bifunctional protein  35.19 
 
 
430 aa  157  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167549  normal  0.0264715 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  31.19 
 
 
435 aa  156  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  32.49 
 
 
429 aa  156  7e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1277  FolC bifunctional protein  31.26 
 
 
419 aa  155  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.12741  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4713  dihydropteroate synthase  32.85 
 
 
810 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.464706  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0918  FolC bifunctional protein  39.14 
 
 
404 aa  155  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2985  FolC bifunctional protein  35.9 
 
 
412 aa  154  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0759  FolC bifunctional protein  37.01 
 
 
413 aa  153  5e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0577538  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1988  FolC bifunctional protein  34.67 
 
 
422 aa  153  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362806  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  32.12 
 
 
427 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  31.5 
 
 
424 aa  152  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2554  dihydropteroate synthase  32.41 
 
 
840 aa  152  8e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.324611  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1883  FolC bifunctional protein  29.12 
 
 
407 aa  151  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  30.42 
 
 
431 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0930  folylpolyglutamate synthetase  35.81 
 
 
424 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  36.41 
 
 
426 aa  150  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  30.16 
 
 
459 aa  150  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3099  FolC bifunctional protein  32.94 
 
 
438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  36.04 
 
 
423 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1391  folylpolyglutamate synthase  29.8 
 
 
404 aa  148  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  32.66 
 
 
416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1739  FolC bifunctional protein  37.42 
 
 
444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.281034  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.59 
 
 
427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  32.68 
 
 
813 aa  147  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0461  FolC bifunctional protein  26.71 
 
 
408 aa  147  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1963  FolC bifunctional protein  37.76 
 
 
432 aa  147  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1549  FolC bifunctional protein  27.1 
 
 
422 aa  147  4.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  29.04 
 
 
431 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2729  FolC bifunctional protein  36.07 
 
 
453 aa  146  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1996  FolC bifunctional protein  31.47 
 
 
428 aa  147  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0222652 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1456  FolC bifunctional protein  27.68 
 
 
438 aa  146  6e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  30.3 
 
 
428 aa  145  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  31.13 
 
 
425 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1092  FolC bifunctional protein  31.94 
 
 
410 aa  145  1e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1697  FolC bifunctional protein  35.4 
 
 
447 aa  144  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000041019 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  29.73 
 
 
416 aa  143  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  30.86 
 
 
438 aa  142  8e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2983  FolC bifunctional protein  34.13 
 
 
421 aa  142  8e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00108921  normal  0.642049 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl060  putative folyl-polyglutamate synthetase  28.29 
 
 
368 aa  142  9e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3525  FolC bifunctional protein  35.44 
 
 
440 aa  142  9e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  37.17 
 
 
381 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0087  FolC bifunctional protein  32 
 
 
454 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0279686 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1535  folylpolyglutamate synthetase  34.97 
 
 
415 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1979  FolC bifunctional protein  27.91 
 
 
404 aa  142  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4541  FolC bifunctional protein  32.58 
 
 
453 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.774158 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13501  putative bifunctional dihydrofolate/folylpolyglutamate synthase  30.4 
 
 
413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1404  FolC bifunctional protein  34.41 
 
 
438 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1117  folylpolyglutamate synthase  28.24 
 
 
420 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  34.47 
 
 
437 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  33.5 
 
 
422 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  38.58 
 
 
428 aa  140  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5701  FolC bifunctional protein  34.4 
 
 
467 aa  139  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.504133  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0702  folylpolyglutamate synthase  30.37 
 
 
435 aa  139  7e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1860  FolC bifunctional protein  32.85 
 
 
441 aa  139  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410312  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>