More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0075 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0075  NUDIX hydrolase  100 
 
 
208 aa  407  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.8643  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 
199 aa  90.1  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
194 aa  89  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
178 aa  88.6  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 
180 aa  88.2  8e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 
173 aa  87.8  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 
177 aa  87.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 
180 aa  87.4  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 
173 aa  85.9  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  36.49 
 
 
177 aa  85.5  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  36.3 
 
 
182 aa  85.5  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 
183 aa  84.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  34.16 
 
 
184 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1520  NUDIX hydrolase  36.56 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234445  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  34.1 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 
176 aa  80.9  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0219  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 
184 aa  80.5  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  32.03 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  36.94 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1242  NUDIX hydrolase  36.53 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0212  NUDIX hydrolase  32.22 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.465676  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  32.57 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  31.84 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 
180 aa  74.3  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  28.65 
 
 
177 aa  73.9  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 
196 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  35.07 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 
180 aa  74.3  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  36.5 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  32.18 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3586  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25181  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 
189 aa  72  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2928  NUDIX hydrolase  29.38 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15030  NTP pyrophosphohydrolase  38.32 
 
 
181 aa  71.2  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202896  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 
196 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  29.32 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  30.49 
 
 
184 aa  70.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  32.18 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  29.48 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0333  MutT/nudix family protein  34.76 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0452702  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  31.93 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3753  NUDIX hydrolase  31.14 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.641661  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  31.21 
 
 
194 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.64 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  30.64 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.64 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.64 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  30.64 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.64 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.64 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  36.3 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  30.68 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.64 
 
 
196 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1495  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 
182 aa  67.8  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.403846  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1519  NUDIX hydrolase  34.08 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000389624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  29.89 
 
 
195 aa  67  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1429  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 
176 aa  67  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.742876  normal  0.0486947 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  36.09 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  28.39 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0268  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.880251  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1507  NUDIX hydrolase  32.75 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.694951  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  33.61 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  31.82 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  31.82 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  31.82 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  31.82 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  31.82 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>