More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0053 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0053  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  291  2e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16710  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  46.62 
 
 		 207 aa  99  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  45.71 
 
 		 141 aa  98.6  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  49.48 
 
 		 141 aa  98.2  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  49.04 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  40.62 
 
 		 160 aa  91.7  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01741  ATPase or kinase  40.94 
 
 		 172 aa  88.2  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  44.95 
 
 		 176 aa  87  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  40.77 
 
 		 159 aa  86.7  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0483  protein of unknown function UPF0079  40.32 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.790809  normal  0.0607901 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  37.31 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  40.15 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2605  protein of unknown function UPF0079  45.28 
 
 		 211 aa  84.3  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000205902 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  44.92 
 
 		 155 aa  84.7  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  35.94 
 
 		 158 aa  84.7  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3209  hypothetical protein  43.1 
 
 		 157 aa  84.3  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000564317  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  39.26 
 
 		 152 aa  84  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  39.39 
 
 		 152 aa  83.6  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  39.39 
 
 		 152 aa  83.6  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  42.28 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  36.07 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2895  hypothetical protein  40 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04610  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  40.62 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.343919 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  36.92 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0670  hypothetical protein  50.55 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.169194  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  34.26 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  41.01 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  48.51 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  47.06 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0569  hypothetical protein  50 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000405356 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29240  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  46.15 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3072  protein of unknown function UPF0079  47.12 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351219  normal  0.508247 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  38.21 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl495  ATPase  34.53 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0893  protein of unknown function UPF0079  47.15 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07470  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  47.62 
 
 		 170 aa  80.5  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.565446  normal  0.131404 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0101  hypothetical protein  41.38 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.286215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  40.37 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  40.5 
 
 		 152 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  40.5 
 
 		 152 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  40.5 
 
 		 152 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2636  hypothetical protein  37.61 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00016395  hitchhiker  0.000000000107728 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  40.5 
 
 		 152 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  41.67 
 
 		 162 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  37.04 
 
 		 187 aa  80.1  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  37.7 
 
 		 153 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  39.05 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1300  hypothetical protein  43.75 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0581872  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1784  protein of unknown function UPF0079  43.69 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0485483  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  35.88 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2754  hypothetical protein  35.04 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000152007  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0568  hypothetical protein  41.88 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  42.11 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4174  hypothetical protein  41.51 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  42.16 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  39.47 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0626  hypothetical protein  48.04 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1228  hypothetical protein  40.62 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  39.37 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1190  ATP/GTP hydrolase  40.62 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4946  hypothetical protein  44.68 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2508  hypothetical protein  39.8 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0224892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3315  hypothetical protein  37.61 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00300444  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1203  hypothetical protein  36.21 
 
 		 174 aa  76.6  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0033  protein of unknown function UPF0079  36.79 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  35.07 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  37.93 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3974  hypothetical protein  40.37 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  41.67 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4775  putative ATPase  39.02 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20781  ATPase or kinase  36.21 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.645705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4625  putative ATPase  39.02 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0145  hypothetical protein  40.35 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550915  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4754  putative ATPase  39.02 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  39.45 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0631  hypothetical protein  44.79 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  41.82 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  38.98 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4635  putative ATPase  39.02 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00161848  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4718  putative ATPase  39.02 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.983496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  36.22 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4898  hypothetical protein  44.09 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.44547  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0321  hypothetical protein  41.67 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4774  hypothetical protein  44.09 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.431591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1598  protein of unknown function UPF0079  40.21 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.86964  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4689  hypothetical protein  39.09 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  37.01 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  41.67 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1926  conserved hypothetical protein TIGR00150  40.21 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4265  protein of unknown function UPF0079  45.45 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1296  hypothetical protein  35 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0433075  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0351  putative ATPase  40 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000572111  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18151  ATPase or kinase  36.27 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.343625  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1159  hypothetical protein  35 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147113  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0357  hypothetical protein  41.75 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.479824  normal  0.0878506 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3825  protein of unknown function UPF0079  39.02 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776436  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4725  putative ATPase  39.02 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000010993  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3845  putative ATPase  39.02 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000032368  hitchhiker  0.00000180276 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4639  putative ATPase  39.02 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162208  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4699  putative ATPase  39.02 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000112747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>