More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0043 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0043  response regulator receiver protein  100 
 
 		 144 aa  295  2e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  43.85 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  43.07 
 
 		 145 aa  99.4  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  41.86 
 
 		 144 aa  97.1  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  38.76 
 
 		 139 aa  97.1  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  39.23 
 
 		 165 aa  96.7  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  38.35 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  37.98 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  35.61 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 148 aa  93.6  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 148 aa  92.8  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  37.23 
 
 		 160 aa  92.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  36.64 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 150 aa  92  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  38.93 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  38.64 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  38.93 
 
 		 150 aa  90.1  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  36.62 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  39.86 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  36.57 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  36.3 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  36.3 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  36.3 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  37.12 
 
 		 149 aa  88.2  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  36.92 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  36.92 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  36.92 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  36.92 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  36.92 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 146 aa  87.4  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  36.3 
 
 		 148 aa  87.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  36.92 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  36.92 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  36.92 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  36.64 
 
 		 181 aa  87  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  34.88 
 
 		 154 aa  87  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  35.11 
 
 		 147 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  35.11 
 
 		 147 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  38.17 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  36.43 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  37.4 
 
 		 146 aa  84.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  35.11 
 
 		 162 aa  85.1  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 147 aa  84.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  36.57 
 
 		 146 aa  84.7  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  36.64 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  37.88 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  36.57 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  35.11 
 
 		 162 aa  84.3  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  35.34 
 
 		 146 aa  84.3  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  37.59 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 145 aa  84  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  36.3 
 
 		 145 aa  84  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 141 aa  83.6  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  31.47 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  36.3 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  27.74 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1095  response regulator receiver protein  37.88 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.770292  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  33.82 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  33.83 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2303  response regulator receiver protein  35.11 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  34.29 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  32.31 
 
 		 137 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  37.76 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  29.85 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  34.04 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2912  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  30.88 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3545  response regulator for Gln (sensor glnL) (nitrogen regulator I, NRI)  35.71 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000295304  normal  0.0892706 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  35.07 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  30.66 
 
 		 154 aa  76.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1954  response regulator receiver protein  36.15 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5135  response regulator receiver protein  32.08 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000600577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  32.82 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  31.34 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  32.12 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  41.56 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  30.23 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  35.21 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.64 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  33.58 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  29.77 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  31.39 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0903  response regulator receiver protein  30.56 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24539  decreased coverage  0.00652104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>