More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0017 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0017  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 		 587 aa  1160    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.164121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1825  cytochrome c oxidase subunit I  51.96 
 
 		 560 aa  521  1e-146  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00349232  normal  0.170097 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2020  cytochrome c oxidase subunit I  51.36 
 
 		 557 aa  517  1.0000000000000001e-145  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0934  cytochrome c oxidase, subunit I  48.66 
 
 		 561 aa  479  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1575  cytochrome c oxidase subunit I  47.58 
 
 		 561 aa  479  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2966  Cytochrome-c oxidase  43.84 
 
 		 559 aa  456  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000678538 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1564  cytochrome c oxidase subunit I  43.19 
 
 		 561 aa  426  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2413  cytochrome c oxidase subunit I  39.21 
 
 		 597 aa  357  3.9999999999999996e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3803  cytochrome c oxidase subunit I  38.31 
 
 		 590 aa  355  1e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3372  Cytochrome-c oxidase  40.82 
 
 		 582 aa  353  4e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3755  cytochrome c oxidase subunit I  41.22 
 
 		 590 aa  349  1e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2384  cytochrome c oxidase subunit I  44.39 
 
 		 549 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0463  cytochrome c oxidase subunit I  38.13 
 
 		 583 aa  343  5.999999999999999e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1900  cytochrome c oxidase subunit I  41.61 
 
 		 549 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2396  cytochrome c oxidase, subunit I  39.43 
 
 		 537 aa  329  7e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185995  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5761  cytochrome c oxidase subunit I  37.83 
 
 		 541 aa  299  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.942787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8117  cytochrome c oxidase subunit I  38.3 
 
 		 540 aa  293  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0510084  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1949  cytochrome-c oxidase  39.85 
 
 		 560 aa  293  6e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1403  cytochrome c oxidase, subunit I  36.36 
 
 		 541 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2874  cytochrome C oxidase subunit 1  36.91 
 
 		 534 aa  287  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4078  putative cytochrome c oxidase, subunit I  38.32 
 
 		 541 aa  281  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652884  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1353  cytochrome c oxidase, subunit I  36.4 
 
 		 541 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1492  cytochrome c oxidase subunit 1  36.4 
 
 		 534 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593595  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1359  cytochrome c oxidase, subunit I  36.4 
 
 		 541 aa  280  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0622  cytochrome c oxidase subunit I  38.28 
 
 		 541 aa  279  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.996251  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0347  cytochrome c oxidase subunit I  36.09 
 
 		 541 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0161  cytochrome c oxidase subunit I  28.04 
 
 		 570 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0570  cytochrome-c oxidase  28.09 
 
 		 546 aa  101  5e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2032  cytochrome c oxidase, subunit I  28.52 
 
 		 585 aa  100  8e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.329827  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1026  cytochrome c oxidase subunit I  29.41 
 
 		 590 aa  92.8  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0485  cytochrome c oxidase, subunit I  26.69 
 
 		 585 aa  84.7  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2267  cytochrome-c oxidase  25.55 
 
 		 843 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0715373  hitchhiker  0.007718 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0484  cytochrome c oxidase, subunit I  26.89 
 
 		 570 aa  81.3  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.469347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3850  cytochrome-c oxidase  26.7 
 
 		 840 aa  80.5  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.550588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  26.22 
 
 		 542 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5671  Cytochrome-c oxidase  30.71 
 
 		 627 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2206  cytochrome c oxidase, subunit I  26.23 
 
 		 609 aa  79.3  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000515262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11180  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  24.75 
 
 		 835 aa  77.8  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00773028  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3470  Cytochrome-c oxidase  29.88 
 
 		 627 aa  77.4  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127917 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0155  cytochrome-c oxidase  26.17 
 
 		 841 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.479577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6950  Cytochrome-c oxidase  28.83 
 
 		 616 aa  74.3  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.910069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1142  cytochrome-c oxidase  26.32 
 
 		 670 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.303035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3734  Cytochrome-c oxidase  28.33 
 
 		 657 aa  72  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0522  Cytochrome-c oxidase  23.28 
 
 		 610 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000527837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2167  Cytochrome-c oxidase  28.33 
 
 		 657 aa  72  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760505 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0727  cytochrome-c oxidase  24.37 
 
 		 588 aa  71.2  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0467  cytochrome c oxidase subunit I  26.88 
 
 		 511 aa  70.9  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  27.46 
 
 		 542 aa  70.5  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140919 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0710  cytochrome c oxidase subunit I  25.36 
 
 		 806 aa  70.5  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0095  cytochrome c oxidase, subunit I  28.05 
 
 		 638 aa  70.5  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  24.36 
 
 		 554 aa  70.5  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1448  cytochrome-c oxidase  26.78 
 
 		 631 aa  70.5  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0923755 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5827  cytochrome c oxidase, subunit I  26.06 
 
 		 635 aa  69.3  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3633  cytochrome-c oxidase  24.36 
 
 		 585 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769302  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0290  cytochrome-c oxidase  26.05 
 
 		 550 aa  69.3  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0048384  normal  0.666159 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  23.6 
 
 		 588 aa  68.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0564  cytochrome c oxidase subunit I type  24.64 
 
 		 840 aa  68.9  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3576  cytochrome c oxidase, subunit I  26.98 
 
 		 553 aa  68.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0128043 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1641  cytochrome-c oxidase  25.25 
 
 		 600 aa  68.2  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.00000000172632  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2344  cytochrome c oxidase, subunit I  26.01 
 
 		 584 aa  67.8  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.250818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0241  cytochrome-c oxidase  22.81 
 
 		 669 aa  67.8  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.515417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  28.32 
 
 		 560 aa  67.8  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0324  cytochrome-c oxidase  25.38 
 
 		 801 aa  67.4  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2990  cytochrome c oxidase, subunit I  26.83 
 
 		 638 aa  67.8  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155569  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  25.89 
 
 		 541 aa  67.4  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01476  putative cytochrome c oxidase subunit I  26.46 
 
 		 835 aa  67.8  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4853  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  24.3 
 
 		 667 aa  67.8  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1291  cytochrome-c oxidase  24.76 
 
 		 664 aa  67.4  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  28.8 
 
 		 594 aa  67.4  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0914  cytochrome-c oxidase  27.55 
 
 		 562 aa  67.4  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00560774  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  25 
 
 		 615 aa  67.4  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0367  cytochrome-c oxidase  25.54 
 
 		 662 aa  67  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12210  cytochrome c oxidase, subunit I  24.69 
 
 		 551 aa  66.6  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0223  cytochrome-c oxidase  24.95 
 
 		 660 aa  66.6  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  25.63 
 
 		 638 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1326  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  26.4 
 
 		 670 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3586  cytochrome c oxidase, subunit I  27.55 
 
 		 542 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.962782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3262  cytochrome c oxidase, subunit I  27.55 
 
 		 542 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  25.93 
 
 		 541 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2948  cytochrome c oxidase subunit I  28.62 
 
 		 511 aa  65.5  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.180624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3458  cytochrome c oxidase, subunit I  27.55 
 
 		 542 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2009  cytochrome-c oxidase  29.66 
 
 		 571 aa  65.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3380  cytochrome c oxidase, subunit I  25.7 
 
 		 650 aa  65.5  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6355  cytochrome c oxidase subunit I type  25.91 
 
 		 635 aa  65.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1802  cytochrome c oxidase subunit I type  29.24 
 
 		 568 aa  65.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.115752 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0629  cytochrome c oxidase, subunit I  23.8 
 
 		 796 aa  64.7  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3859  cytochrome-c oxidase  25.74 
 
 		 659 aa  64.7  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  28.4 
 
 		 542 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.056683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0261  cytochrome c oxidase, subunit I  28.4 
 
 		 542 aa  64.7  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043486  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  25.69 
 
 		 541 aa  64.7  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3824  cytochrome-c oxidase  23.29 
 
 		 825 aa  64.7  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.961299 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3097  QoxA, quinol oxidase subunit I  23.29 
 
 		 825 aa  64.3  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.866737  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1732  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  24.26 
 
 		 666 aa  64.3  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1901  cytochrome c oxidase, subunit I  25 
 
 		 559 aa  64.3  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0984776  normal  0.277007 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2031  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  23.66 
 
 		 669 aa  64.3  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0504466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0032  cytochrome c oxidase, subunit I  27.8 
 
 		 542 aa  64.3  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.616804 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5129  cytochrome c oxidase, subunit I  25.06 
 
 		 590 aa  64.3  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.828431  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  26.94 
 
 		 555 aa  63.9  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0043  cytochrome c oxidase, subunit I  25.82 
 
 		 539 aa  63.9  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4762  cytochrome c oxidase subunit I type  30.38 
 
 		 840 aa  63.9  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>