More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0016 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0016  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 186 aa  379  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  40.85 
 
 		 156 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  39.88 
 
 		 156 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  48.25 
 
 		 168 aa  121  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  42.5 
 
 		 168 aa  121  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  38.95 
 
 		 160 aa  119  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  44.83 
 
 		 162 aa  114  8.999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  39.02 
 
 		 266 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3802  cytochrome c oxidase subunit II  37.11 
 
 		 262 aa  112  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  39.64 
 
 		 160 aa  111  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2412  cytochrome c oxidase subunit II  34.97 
 
 		 171 aa  111  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1565  cytochrome c oxidase subunit II  32.5 
 
 		 155 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3756  cytochrome c oxidase subunit II  34.81 
 
 		 300 aa  105  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3373  cytochrome c oxidase subunit II  36.48 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5762  cytochrome c oxidase subunit II  47.06 
 
 		 195 aa  99  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336691  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2397  cytochrome c oxidase, subunit II  33.15 
 
 		 177 aa  98.2  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1950  cytochrome c oxidase, subunit II  32.74 
 
 		 158 aa  95.9  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0348  cytochrome c oxidase subunit II  34.52 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1491  cytochrome c oxidase, subunit II  46.39 
 
 		 190 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403979  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2875  hypothetical protein  46.39 
 
 		 165 aa  94  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.902113  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1352  cytochrome c oxidase, subunit II  46.39 
 
 		 185 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1358  cytochrome c oxidase, subunit II  46.39 
 
 		 185 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1402  cytochrome c oxidase, subunit II  47.25 
 
 		 162 aa  90.5  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4077  putative cytochrome c oxidase subunit II  34.52 
 
 		 190 aa  90.5  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.357197 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0623  cytochrome c oxidase subunit II  34.52 
 
 		 190 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8116  cytochrome c oxidase subunit II  32.3 
 
 		 187 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  34.86 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  36.11 
 
 		 389 aa  74.7  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  35.24 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  35.24 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  34.29 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0162  cytochrome c oxidase subunit II  28.4 
 
 		 179 aa  70.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  30.81 
 
 		 444 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  27.91 
 
 		 342 aa  68.6  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  33.03 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0186  cytochrome c oxidase subunit II  42.25 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.721142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  34.26 
 
 		 426 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  32.11 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  35.24 
 
 		 362 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  35.24 
 
 		 362 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  35.24 
 
 		 362 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  35.19 
 
 		 405 aa  65.5  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  44 
 
 		 274 aa  65.5  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 		 316 aa  65.1  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  41.56 
 
 		 337 aa  64.7  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  41.56 
 
 		 337 aa  64.7  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  41.56 
 
 		 337 aa  64.7  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  29.63 
 
 		 300 aa  64.7  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2958  cytochrome c oxidase subunit II  40.85 
 
 		 269 aa  64.3  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  36.36 
 
 		 271 aa  64.3  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2971  cytochrome c oxidase, subunit II  40.79 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297195  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  43.04 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2268  cytochrome c oxidase subunit II  34.21 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  32.38 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3898  cytochrome c oxidase subunit II  41.89 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  41.56 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2712  cytochrome c oxidase, subunit II  34.78 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.925486  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2594  cytochrome c oxidase subunit II  34.21 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0132206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  30.69 
 
 		 321 aa  62  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  40.26 
 
 		 314 aa  62  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0320  cytochrome c oxidase, subunit II  26.15 
 
 		 147 aa  62  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  39.39 
 
 		 311 aa  61.6  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2167  cytochrome c oxidase, subunit II  36.05 
 
 		 316 aa  61.6  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.238577  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  30.48 
 
 		 408 aa  61.2  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  31.48 
 
 		 399 aa  61.2  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2667  cytochrome c oxidase, subunit II  38.67 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000731969  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2358  cytochrome c oxidase subunit II  41.56 
 
 		 280 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382023  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  28.36 
 
 		 273 aa  60.8  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  40 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  35 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  40.28 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  31.62 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  41.89 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0254  cytochrome c oxidase subunit II  30.05 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00721127 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  39.73 
 
 		 382 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  38.57 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  39.73 
 
 		 382 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  35.45 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3849  cytochrome c oxidase, subunit II  36.36 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  32.41 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  39.47 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  34.48 
 
 		 382 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  34.48 
 
 		 382 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  30.39 
 
 		 301 aa  58.5  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  35.19 
 
 		 314 aa  58.2  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02212  putative cytochrome C oxidase polypeptide II oxidoreductase protein  31.71 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0599  cytochrome c oxidase subunit II  32.89 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  32.67 
 
 		 243 aa  57.8  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  36.36 
 
 		 354 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  38.81 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  36.36 
 
 		 244 aa  57  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  34.26 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0956  cytochrome c oxidase, subunit II  34.69 
 
 		 280 aa  57  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  33.64 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  28.43 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  34.15 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  41.79 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  34.78 
 
 		 291 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  35.06 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  35.53 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>