More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0011 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  100 
 
 		 401 aa  795    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4139  methionine gamma-lyase  56.88 
 
 		 390 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  51.05 
 
 		 386 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  51.31 
 
 		 386 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  50.52 
 
 		 386 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  46.56 
 
 		 394 aa  381  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0729  methionine gamma-lyase  50.52 
 
 		 386 aa  381  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  47.01 
 
 		 392 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  49.87 
 
 		 400 aa  378  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  46.21 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  50.63 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  49.49 
 
 		 398 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  49.24 
 
 		 398 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  48.73 
 
 		 398 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  49.37 
 
 		 399 aa  362  6e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  48.36 
 
 		 418 aa  362  9e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  46.95 
 
 		 401 aa  359  4e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  45.06 
 
 		 413 aa  358  9.999999999999999e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  48.09 
 
 		 397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  45.48 
 
 		 399 aa  353  2.9999999999999997e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  47.44 
 
 		 393 aa  350  3e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  50.13 
 
 		 399 aa  348  7e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  47.12 
 
 		 398 aa  342  9e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  46.02 
 
 		 394 aa  341  1e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  46.23 
 
 		 397 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  43.47 
 
 		 397 aa  339  5.9999999999999996e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  49.49 
 
 		 394 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  45.97 
 
 		 397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  46.55 
 
 		 380 aa  337  2.9999999999999997e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  45.71 
 
 		 397 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  45.69 
 
 		 397 aa  333  4e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  46.43 
 
 		 392 aa  332  6e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  45.94 
 
 		 397 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  44.39 
 
 		 391 aa  332  8e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  43.47 
 
 		 392 aa  332  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  46.43 
 
 		 401 aa  331  1e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  45.94 
 
 		 397 aa  331  2e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  43.22 
 
 		 392 aa  330  3e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  43.47 
 
 		 392 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  44.94 
 
 		 397 aa  330  3e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  44.94 
 
 		 397 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  45.43 
 
 		 397 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  43.22 
 
 		 392 aa  329  6e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  43.47 
 
 		 391 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  43.22 
 
 		 392 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  43.88 
 
 		 391 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  43.47 
 
 		 391 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  45.69 
 
 		 378 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  43.01 
 
 		 380 aa  328  1.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  46.53 
 
 		 390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  48.09 
 
 		 387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  42.96 
 
 		 392 aa  327  3e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0734  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  39.15 
 
 		 429 aa  327  3e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.12755  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  44.19 
 
 		 379 aa  326  4.0000000000000003e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  44.04 
 
 		 379 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  43.96 
 
 		 392 aa  325  7e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  44.91 
 
 		 379 aa  325  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  45.18 
 
 		 407 aa  325  1e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  49.37 
 
 		 392 aa  323  3e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6240  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  45.08 
 
 		 429 aa  323  3e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3821  Cystathionine gamma-synthase  50.27 
 
 		 408 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.6 
 
 		 397 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  45.69 
 
 		 390 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  41.39 
 
 		 392 aa  320  3e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.94 
 
 		 396 aa  319  3.9999999999999996e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  45.78 
 
 		 394 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  45.6 
 
 		 380 aa  319  5e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  47.41 
 
 		 377 aa  318  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  47.86 
 
 		 387 aa  318  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  48.32 
 
 		 394 aa  318  1e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  47.69 
 
 		 391 aa  318  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2823  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  44.1 
 
 		 443 aa  317  2e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561199  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  47.78 
 
 		 377 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  45.36 
 
 		 381 aa  317  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  47.19 
 
 		 392 aa  316  4e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.96 
 
 		 404 aa  315  6e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.96 
 
 		 404 aa  315  6e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  46.91 
 
 		 379 aa  315  7e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  47.42 
 
 		 381 aa  315  9e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1842  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  40.33 
 
 		 430 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000076838  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.41 
 
 		 403 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0976  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  40.33 
 
 		 427 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.913845  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  45.55 
 
 		 390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  46.43 
 
 		 394 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  44.68 
 
 		 378 aa  312  5.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  43.6 
 
 		 377 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  46.17 
 
 		 394 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  44.53 
 
 		 387 aa  312  6.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  44.94 
 
 		 398 aa  312  6.999999999999999e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  43.86 
 
 		 377 aa  311  9e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  42.53 
 
 		 387 aa  311  9e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  43.86 
 
 		 377 aa  311  9e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2339  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  42.65 
 
 		 443 aa  311  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  43.6 
 
 		 377 aa  310  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  43.86 
 
 		 377 aa  311  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  46.11 
 
 		 383 aa  310  2e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  45.85 
 
 		 402 aa  311  2e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  43.9 
 
 		 392 aa  310  2e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  43.6 
 
 		 377 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  43.86 
 
 		 377 aa  310  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>