More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5760 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5760  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 266 aa  544  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.220306 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3812  dimethyladenosine transferase  60.96 
 
 		 260 aa  313  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1628  dimethyladenosine transferase  61.75 
 
 		 258 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0961527  hitchhiker  0.00711372 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3300  dimethyladenosine transferase  60 
 
 		 271 aa  304  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000380546  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0135  dimethyladenosine transferase  60.85 
 
 		 258 aa  290  2e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0844  dimethyladenosine transferase  60.56 
 
 		 261 aa  287  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1981  dimethyladenosine transferase  59.04 
 
 		 257 aa  286  2.9999999999999996e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03760  dimethyladenosine transferase  54.58 
 
 		 269 aa  266  2e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1238  dimethyladenosine transferase  51.84 
 
 		 249 aa  229  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  44.62 
 
 		 266 aa  178  9e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0907  dimethyladenosine transferase  41.52 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000552021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  39.39 
 
 		 275 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  46.06 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  44.22 
 
 		 267 aa  165  8e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  42.48 
 
 		 264 aa  165  8e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1287  dimethyladenosine transferase  41.7 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.652271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  37.5 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  43.58 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  41.7 
 
 		 269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  40.78 
 
 		 269 aa  162  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  39 
 
 		 278 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  41.13 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  39.92 
 
 		 272 aa  159  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  41.67 
 
 		 263 aa  159  6e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  39.29 
 
 		 255 aa  158  7e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2340  dimethyladenosine transferase  41.13 
 
 		 255 aa  158  9e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.365581 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0873  dimethyladenosine transferase  41.43 
 
 		 263 aa  157  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  40.84 
 
 		 268 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  41.54 
 
 		 268 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  41.89 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  41.5 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  40 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  41.5 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1172  dimethyladenosine transferase  40.87 
 
 		 262 aa  156  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173217  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  41.89 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1456  dimethyladenosine transferase  38.32 
 
 		 287 aa  157  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  41.89 
 
 		 266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  39 
 
 		 274 aa  155  9e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  38.46 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  37.92 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0944  dimethyladenosine transferase  39.46 
 
 		 280 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2079  dimethyladenosine transferase  39.76 
 
 		 258 aa  155  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1169  dimethyladenosine transferase  41.11 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.013755  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  39.46 
 
 		 268 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  39.16 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0103  dimethyladenosine transferase  39.37 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  40.08 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  40.08 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  39.16 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  39.53 
 
 		 268 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  37.6 
 
 		 278 aa  152  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  39.16 
 
 		 271 aa  152  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  39.53 
 
 		 268 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0518  dimethyladenosine transferase  39.06 
 
 		 281 aa  152  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  39.08 
 
 		 268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0961  dimethyladenosine transferase  38.35 
 
 		 287 aa  152  7e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  39.26 
 
 		 275 aa  152  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  41.89 
 
 		 266 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  37.91 
 
 		 285 aa  151  8.999999999999999e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  41.26 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  39.33 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  39.25 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1185  dimethyladenosine transferase  37.5 
 
 		 280 aa  149  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  0.468097 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  39.22 
 
 		 268 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  39.44 
 
 		 259 aa  149  5e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  38.4 
 
 		 261 aa  149  6e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0858  dimethyladenosine transferase  35.36 
 
 		 258 aa  149  6e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0394  dimethyladenosine transferase  38.67 
 
 		 281 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0409  dimethyladenosine transferase  37.5 
 
 		 281 aa  148  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.689254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  38.02 
 
 		 271 aa  148  8e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  39.53 
 
 		 265 aa  148  9e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  38.82 
 
 		 268 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  39.53 
 
 		 269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  40.47 
 
 		 268 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  39.13 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  38.98 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  38.25 
 
 		 267 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0678  dimethyladenosine transferase  37.11 
 
 		 276 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  39.13 
 
 		 267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  38.74 
 
 		 267 aa  145  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0996  dimethyladenosine transferase  37.96 
 
 		 249 aa  145  9e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.143714  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0399  dimethyladenosine transferase  38.1 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.136903 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1571  dimethyladenosine transferase  39.29 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.836645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1867  dimethyladenosine transferase  39.44 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2888  dimethyladenosine transferase  38.46 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  39 
 
 		 282 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001665  dimethyladenosine transferase  37.59 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00808  dimethyladenosine transferase  37.5 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  37.4 
 
 		 305 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1901  dimethyladenosine transferase  37.01 
 
 		 272 aa  142  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.13527 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  41.38 
 
 		 288 aa  142  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0096  dimethyladenosine transferase  38.55 
 
 		 261 aa  142  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0057  dimethyladenosine transferase  37.16 
 
 		 273 aa  142  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4021  dimethyladenosine transferase  36.72 
 
 		 277 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00888486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0055  dimethyladenosine transferase  37.16 
 
 		 273 aa  142  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00458871  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1762  dimethyladenosine transferase  39.08 
 
 		 275 aa  142  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3548  dimethyladenosine transferase  37.16 
 
 		 273 aa  142  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0057  dimethyladenosine transferase  37.16 
 
 		 273 aa  142  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581995  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0095  dimethyladenosine transferase  36.88 
 
 		 273 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.12943  normal  0.356513 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0096  dimethyladenosine transferase  36.88 
 
 		 273 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>