More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5759 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5759  magnesium transporter  100 
 
 
450 aa  904    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.180373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3299  magnesium transporter  64.51 
 
 
450 aa  564  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000163374  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1629  magnesium transporter, MgtE  51.45 
 
 
450 aa  465  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0142198  hitchhiker  0.00754264 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1980  magnesium transporter  42.7 
 
 
451 aa  368  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03755  magnesium transporter  40.4 
 
 
449 aa  346  4e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.578894  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0134  magnesium transporter  41.7 
 
 
450 aa  346  6e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.149732 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0843  magnesium transporter  38.39 
 
 
449 aa  324  2e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  34.45 
 
 
451 aa  256  7e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  36.05 
 
 
461 aa  240  5e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  36.05 
 
 
461 aa  240  5e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  35.1 
 
 
450 aa  232  8.000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2169  magnesium transporter  31.81 
 
 
449 aa  232  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  30.59 
 
 
446 aa  226  4e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  32.86 
 
 
442 aa  227  4e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  32.76 
 
 
461 aa  226  8e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  33.73 
 
 
452 aa  226  9e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  31.24 
 
 
443 aa  222  9e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  32.27 
 
 
473 aa  222  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  32.29 
 
 
473 aa  220  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1125  magnesium transporter  32.39 
 
 
444 aa  217  4e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  32.23 
 
 
445 aa  216  8e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  30.14 
 
 
446 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  31.12 
 
 
462 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  31.32 
 
 
471 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0267  magnesium transporter  29.35 
 
 
456 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000106938  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  30.89 
 
 
460 aa  213  5.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2778  magnesium transporter  31.07 
 
 
461 aa  213  7.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.854072  normal  0.0326796 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0320  divalent cation transporter  30.5 
 
 
460 aa  210  3e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0139413 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  31.11 
 
 
449 aa  210  5e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  30.85 
 
 
444 aa  209  8e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  30.62 
 
 
466 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  32.3 
 
 
471 aa  208  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  28.98 
 
 
462 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  30.07 
 
 
470 aa  207  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2058  magnesium transporter  30.15 
 
 
460 aa  206  5e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2282  magnesium transporter  30.32 
 
 
453 aa  206  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0198685  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  29.89 
 
 
480 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  28.98 
 
 
462 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1801  divalent cation transporter  29.32 
 
 
460 aa  204  4e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  31.52 
 
 
445 aa  203  4e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  29.35 
 
 
454 aa  204  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  29.8 
 
 
480 aa  203  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  29.44 
 
 
480 aa  203  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  28.98 
 
 
468 aa  203  5e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  30.25 
 
 
444 aa  202  9e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  29.87 
 
 
476 aa  202  9e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  29.77 
 
 
479 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  30.25 
 
 
459 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1386  magnesium transporter  28.7 
 
 
485 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  30.77 
 
 
482 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  29.44 
 
 
480 aa  200  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  29.44 
 
 
480 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  29.23 
 
 
463 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3533  magnesium transporter  29.12 
 
 
471 aa  200  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.206013 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  28.99 
 
 
480 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  29.69 
 
 
482 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  28.99 
 
 
480 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  29.69 
 
 
482 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  28.9 
 
 
451 aa  199  7.999999999999999e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  31.61 
 
 
462 aa  199  9e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  31.14 
 
 
542 aa  199  9e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18191  Mg2+ transporter  32.55 
 
 
469 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  28.93 
 
 
449 aa  198  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3159  magnesium transporter  32.65 
 
 
489 aa  197  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1890  magnesium transporter  29.48 
 
 
460 aa  197  3e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0714  magnesium transporter  29.44 
 
 
449 aa  197  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  30.77 
 
 
481 aa  197  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  28.76 
 
 
480 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  32.46 
 
 
468 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2786  magnesium transporter  30.6 
 
 
463 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  32.21 
 
 
468 aa  196  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1832  magnesium transporter  32.21 
 
 
460 aa  196  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0187947  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3573  magnesium transporter  31.49 
 
 
473 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433595  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2099  magnesium transporter  30.13 
 
 
460 aa  196  8.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.168721  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  30.87 
 
 
450 aa  196  9e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  29.22 
 
 
453 aa  195  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18401  Mg2+ transporter  32.11 
 
 
468 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.297681  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1722  magnesium transporter  31.7 
 
 
462 aa  195  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2718  magnesium transporter  30.31 
 
 
452 aa  195  2e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3075  magnesium transporter  31.28 
 
 
473 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  32.56 
 
 
471 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  29.49 
 
 
465 aa  194  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4791  putative magnesium transporter MgtE-like (divalent cation transporter Mg2+/Ni2+/Co2+)  31.77 
 
 
472 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  31.93 
 
 
471 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  28.34 
 
 
481 aa  193  6e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  31.79 
 
 
469 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1318  magnesium transporter  29.87 
 
 
458 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  28.8 
 
 
450 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  30.43 
 
 
458 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  30.99 
 
 
469 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  28.93 
 
 
481 aa  191  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1454  magnesium transporter  29.93 
 
 
447 aa  190  4e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192338  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  28.28 
 
 
480 aa  190  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  28.41 
 
 
494 aa  189  9e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  28.94 
 
 
454 aa  189  9e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1742  magnesium transporter  30.18 
 
 
463 aa  189  9e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0138  divalent cation transporter  31.51 
 
 
486 aa  188  1e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4084  magnesium transporter  32.02 
 
 
470 aa  189  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403557  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2269  magnesium transporter  33.7 
 
 
454 aa  189  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0532952  hitchhiker  0.0000374811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  28.94 
 
 
454 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>