60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5617 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5617  peptidase M50  100 
 
 		 399 aa  802    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2710  peptidase M50  59.26 
 
 		 388 aa  476  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0908  zinc protease  41.69 
 
 		 422 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00811957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0511  peptidase M50  35.73 
 
 		 330 aa  204  3e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0463  peptidase M50  37.72 
 
 		 342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0506  peptidase M50  34.68 
 
 		 350 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0921606  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0258  peptidase M50  36.44 
 
 		 397 aa  190  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1984  peptidase M50  32.49 
 
 		 341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186308  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0500  peptidase M50  39.76 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.394939  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1675  zinc protease, putative  29.94 
 
 		 317 aa  143  5e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4470  peptidase M50  31.8 
 
 		 322 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.503859 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0087  hypothetical protein  34.16 
 
 		 503 aa  129  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4461  peptidase M50  35.68 
 
 		 315 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4480  peptidase M50  36.76 
 
 		 315 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.948254  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4325  peptidase M50  35.68 
 
 		 315 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1514  peptidase M50  36.36 
 
 		 392 aa  119  9e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1977  peptidase M50  30.94 
 
 		 378 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1446  peptidase M50  38.27 
 
 		 550 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3285  peptidase M50  32 
 
 		 494 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00379295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2814  peptidase M50  32 
 
 		 494 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1470  peptidase M50  32.86 
 
 		 369 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4003  peptidase M50  38 
 
 		 493 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0618882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3438  peptidase M50  36.46 
 
 		 491 aa  116  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.526789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1707  peptidase M50  36.46 
 
 		 491 aa  115  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.195139  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2383  peptidase M50  34.82 
 
 		 383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.796244 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5131  peptidase M50  36.98 
 
 		 493 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.628863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1296  peptidase M50  25.07 
 
 		 381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3483  peptidase M50  35.48 
 
 		 388 aa  110  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3897  peptidase M50  33.82 
 
 		 499 aa  109  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.725325  normal  0.5726 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0719  zinc metalloprotease  34.67 
 
 		 369 aa  102  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2060  peptidase M50  34.91 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1182  peptidase M50  35.64 
 
 		 326 aa  95.9  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1523  peptidase M50  32.67 
 
 		 423 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.379776  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0291  peptidase M50  35.29 
 
 		 368 aa  91.7  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00037958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3682  peptidase M50  31.23 
 
 		 378 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1247  peptidase M50  31.1 
 
 		 379 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2489  peptidase M50  27.52 
 
 		 492 aa  87.4  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.896404  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2388  peptidase M50  31.05 
 
 		 499 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4976  peptidase M50  29.38 
 
 		 505 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2307  predicted protein  28.18 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00988345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1070  peptidase M50  27.69 
 
 		 493 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0318096 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2035  peptidase M50  26.19 
 
 		 501 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0417  peptidase M50  28.5 
 
 		 500 aa  73.9  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.807166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2061  peptidase M50  26.19 
 
 		 501 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2576  hypothetical protein  25.49 
 
 		 504 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000057775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33462  predicted protein  25.7 
 
 		 684 aa  65.5  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44486  predicted protein  26.2 
 
 		 834 aa  63.2  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.330794  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2595  peptidase M50  26.35 
 
 		 337 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2396  peptidase M50  33.33 
 
 		 239 aa  49.7  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1818  peptidase M50  35.79 
 
 		 293 aa  49.7  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000422753  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2524  hypothetical protein  34.41 
 
 		 241 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0445127  hitchhiker  0.00571488 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0326  peptidase M50  32.53 
 
 		 241 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4945  peptidase M50  32.53 
 
 		 241 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365281  normal  0.0922667 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3043  peptidase M50  32.53 
 
 		 241 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5323  peptidase M50  32.53 
 
 		 241 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4681  peptidase M50  32.53 
 
 		 241 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5208  peptidase M50  32.53 
 
 		 241 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.125374 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2946  peptidase M50  34.52 
 
 		 313 aa  46.6  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000715843  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1771  peptidase M50  30.23 
 
 		 247 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000535238 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4579  peptidase M50  27.47 
 
 		 305 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>