More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5590 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
328 aa  675    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5040  glycosyl transferase family 2  50.77 
 
 
323 aa  332  5e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0567661 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1382  glycosyl transferase family protein  48.26 
 
 
333 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6447  glycosyl transferase family protein  48.26 
 
 
333 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6038  glycosyl transferase family protein  48.26 
 
 
333 aa  292  5e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5246  glycosyl transferase family protein  47.09 
 
 
348 aa  291  9e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0170348 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6397  glycosyl transferase family protein  47 
 
 
333 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441453  normal  0.138484 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5649  glycosyl transferase family protein  47 
 
 
333 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0900976  normal  0.264223 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5443  glycosyl transferase family protein  47.63 
 
 
333 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  hitchhiker  0.00908127 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  45.68 
 
 
344 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  45.68 
 
 
344 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4384  glycosyl transferase family protein  47.99 
 
 
328 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1987  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.32 
 
 
333 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1386  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.32 
 
 
333 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.343804  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1010  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.32 
 
 
333 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.374388  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1298  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.32 
 
 
333 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.472979  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3039  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.32 
 
 
333 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2274  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.32 
 
 
333 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102891  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3168  glycosyl transferase, group 2 family protein  47 
 
 
333 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  41.09 
 
 
325 aa  246  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2643  family 2 glycosyl transferase  32.92 
 
 
321 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1570  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  33.85 
 
 
498 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.892629  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0716  HAD family hydrolase  35.25 
 
 
501 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.358199  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11260  histidinol-phosphate phosphatase family protein  31.91 
 
 
499 aa  116  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130521  normal  0.23358 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0456  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  35.8 
 
 
499 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  25.3 
 
 
337 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
310 aa  99.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 
305 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 
310 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0884  b-glycosyltransferase  32.77 
 
 
283 aa  97.4  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030368  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10111  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 
310 aa  96.3  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0906885 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3194  glycosyl transferase family 2  31.5 
 
 
455 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  27.99 
 
 
528 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  29.28 
 
 
310 aa  93.6  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 
344 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  31.8 
 
 
333 aa  92.8  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  29.93 
 
 
344 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 
314 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  33.67 
 
 
272 aa  90.1  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  30.36 
 
 
316 aa  89.7  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  30.67 
 
 
310 aa  89.4  7e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  31.56 
 
 
307 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
305 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  30 
 
 
312 aa  85.9  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08121  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
303 aa  85.9  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08131  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
303 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  33.79 
 
 
300 aa  84  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2476  glycosyl transferase family 2  29.75 
 
 
310 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
322 aa  83.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3632  glycosyl transferase family 2  29.75 
 
 
310 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  26.46 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
331 aa  82.8  0.000000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
924 aa  82  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 
891 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0155  glycosyl transferase family 2  27.9 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0760  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2893  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3182  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08321  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
305 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.389273  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  24.68 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0883  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 
310 aa  77  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1842  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 
884 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4024  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 
322 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02466  glycosyl transferase  32.16 
 
 
286 aa  75.5  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0810983  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1272  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.294715  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  27.85 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  31.5 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
753 aa  72.8  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 
477 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  26.22 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5657  glycosyl transferase family 2  25.09 
 
 
303 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.49465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  26.87 
 
 
312 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 
335 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3324  glycosyl transferase family protein  32.37 
 
 
487 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.624929 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  28.72 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 
1486 aa  69.3  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3392  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 
321 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 
305 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 
312 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1552  glycosyl transferase family 2  25.2 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  27.03 
 
 
1077 aa  67.8  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0962  glycosyl transferase family protein  36.04 
 
 
302 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153227  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  27.13 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1147  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.466774  hitchhiker  0.00852999 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.69 
 
 
310 aa  67  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 
312 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  30.32 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  27.2 
 
 
617 aa  66.2  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0339  glycosyl transferase family 2  37.29 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  23.19 
 
 
988 aa  66.2  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1687  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.165254  normal  0.0664062 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  26.02 
 
 
454 aa  65.9  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>