More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5425 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
188 aa  386  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.62 
 
 
188 aa  156  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.92 
 
 
192 aa  155  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.71 
 
 
199 aa  155  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  43.32 
 
 
190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  37.84 
 
 
182 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.23 
 
 
188 aa  137  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.46 
 
 
183 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  36.9 
 
 
185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  39.2 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  38.38 
 
 
183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  37.97 
 
 
178 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  41.08 
 
 
181 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  40.54 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.56 
 
 
182 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.92 
 
 
201 aa  125  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  38.38 
 
 
181 aa  124  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  34.04 
 
 
199 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.1 
 
 
180 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  34.95 
 
 
182 aa  121  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.22 
 
 
188 aa  121  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  34.22 
 
 
188 aa  121  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.64 
 
 
186 aa  121  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.02 
 
 
182 aa  120  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.17 
 
 
188 aa  120  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.3 
 
 
185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  38.92 
 
 
180 aa  120  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  38.92 
 
 
178 aa  118  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  34.04 
 
 
188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  35.33 
 
 
179 aa  117  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.83 
 
 
187 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  37.1 
 
 
179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.57 
 
 
187 aa  114  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.63 
 
 
189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  35.64 
 
 
187 aa  112  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.04 
 
 
187 aa  112  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  32.79 
 
 
200 aa  111  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  34.04 
 
 
183 aa  111  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.51 
 
 
187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
189 aa  108  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  34.39 
 
 
204 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  37.84 
 
 
183 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.83 
 
 
183 aa  105  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.46 
 
 
194 aa  105  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
177 aa  104  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.8 
 
 
190 aa  104  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  32.66 
 
 
198 aa  102  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  35.33 
 
 
181 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.63 
 
 
181 aa  101  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.43 
 
 
178 aa  101  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.87 
 
 
188 aa  101  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.59 
 
 
188 aa  101  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  30.65 
 
 
180 aa  100  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.85 
 
 
224 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4298  deaminase-reductase domain-containing protein  35.33 
 
 
186 aa  99.8  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.943714 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  31.47 
 
 
196 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.65 
 
 
192 aa  99.4  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.18 
 
 
178 aa  99.4  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0541  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.98 
 
 
185 aa  98.6  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.932074 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  32.8 
 
 
180 aa  98.2  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.53 
 
 
186 aa  97.8  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.98 
 
 
183 aa  97.8  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.62 
 
 
204 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.32 
 
 
185 aa  97.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.83 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  33.51 
 
 
215 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3644  hypothetical protein  34.04 
 
 
190 aa  96.3  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.43 
 
 
187 aa  96.3  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.75 
 
 
187 aa  96.3  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4307  bifunctional deaminase-reductase-like  37.34 
 
 
167 aa  95.1  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912167  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2397  dihydrofolate reductase  41.07 
 
 
116 aa  95.1  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.5 
 
 
185 aa  94.7  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  32.95 
 
 
208 aa  94.4  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  32.97 
 
 
178 aa  94.7  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.16 
 
 
178 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  30.81 
 
 
181 aa  94  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
185 aa  93.2  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000023862  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.53 
 
 
200 aa  93.2  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  31.82 
 
 
200 aa  93.2  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  33.51 
 
 
188 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5956  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.65 
 
 
188 aa  93.2  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.09 
 
 
204 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.12 
 
 
178 aa  92.4  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.47 
 
 
221 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.33 
 
 
201 aa  92  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1705  deaminase-reductase domain-containing protein  32.28 
 
 
194 aa  91.7  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.65 
 
 
196 aa  91.7  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  32.8 
 
 
185 aa  91.7  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.74 
 
 
202 aa  90.5  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.31 
 
 
219 aa  90.9  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.15 
 
 
188 aa  90.1  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  31.72 
 
 
181 aa  90.1  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.5 
 
 
221 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.16 
 
 
183 aa  89.4  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.93 
 
 
217 aa  89.4  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.86 
 
 
176 aa  89  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  32 
 
 
221 aa  88.6  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4932  deaminase-reductase domain-containing protein  34.67 
 
 
182 aa  88.6  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.916718  normal  0.605792 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  32.62 
 
 
199 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>