242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5367 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3507  cobaltochelatase subunit CobN  40.91 
 
 		 1253 aa  899    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0883  cobaltochelatase subunit CobN  42.2 
 
 		 1220 aa  797    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.221354  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0749  cobalamin biosynthesis protein CobN, putative  31.66 
 
 		 1244 aa  694    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0626  cobalamin biosynthesis protein  63.29 
 
 		 1379 aa  826    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.941257 
 
 
-
 
NC_004310  BR1306  cobaltochelatase subunit CobN  39.91 
 
 		 1263 aa  826    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3149  cobN/magnesium chelatase family protein  40.4 
 
 		 1254 aa  905    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1170  cobaltochelatase  42.2 
 
 		 1220 aa  797    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.345597  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3015  cobaltochelatase subunit CobN  40.46 
 
 		 1254 aa  900    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  44.47 
 
 		 1209 aa  1008    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0331  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.39 
 
 		 1262 aa  756    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1582  cobaltochelatase subunit CobN  41.09 
 
 		 1269 aa  885    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0866134 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1859  Cobaltochelatase  37.19 
 
 		 1302 aa  807    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.243773 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1771  cobaltochelatase subunit CobN  32.72 
 
 		 1343 aa  666    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0558  cobaltochelatase, CobN subunit  53.41 
 
 		 1453 aa  1497    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3112  cobaltochelatase subunit CobN  42.54 
 
 		 1213 aa  1004    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2647  cobaltochelatase CobN subunit  39.25 
 
 		 1260 aa  812    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.844431  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  40.75 
 
 		 1288 aa  986    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17590  cobaltochelatase subunit CobN  43.29 
 
 		 1199 aa  979    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5367  cobaltochelatase, CobN subunit  100 
 
 		 1426 aa  2939    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2099  cobaltochelatase subunit CobN  40.93 
 
 		 1281 aa  879    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3098  cobaltochelatase subunit CobN  40.65 
 
 		 1257 aa  909    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1759  cobaltochelatase subunit CobN  39.8 
 
 		 1273 aa  833    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193122  normal  0.0775991 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3301  cobaltochelatase, CobN subunit  41.22 
 
 		 1247 aa  977    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4806  cobaltochelatase subunit CobN  41.45 
 
 		 1269 aa  903    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3152  cobaltochelatase subunit CobN  39.86 
 
 		 1267 aa  868    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  52.65 
 
 		 1406 aa  1456    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1576  cobaltochelatase subunit CobN  41.02 
 
 		 1270 aa  902    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104948  normal  0.435931 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1059  cobaltochelatase, CobN subunit  52.62 
 
 		 1435 aa  1510    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1121  cobaltochelatase, CobN subunit  35.57 
 
 		 1256 aa  716    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6126  cobaltochelatase subunit CobN  47.33 
 
 		 1238 aa  1102    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173021  hitchhiker  0.00419275 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0787  cobaltochelatase subunit CobN  37.77 
 
 		 1249 aa  793    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1357  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  34.03 
 
 		 1242 aa  694    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.250832 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2773  cobaltochelatase subunit CobN  40.99 
 
 		 1253 aa  909    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0921  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  32.39 
 
 		 1245 aa  761    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.308916  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5234  cobaltochelatase, CobN subunit  40.33 
 
 		 1261 aa  954    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34386 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  42.84 
 
 		 1263 aa  996    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4488  cobaltochelatase, CobN subunit  40.36 
 
 		 1253 aa  934    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.036895 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1219  cobaltochelatase  34.89 
 
 		 1285 aa  701    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0742888  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3366  cobaltochelatase subunit CobN  38.99 
 
 		 1240 aa  793    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2407  cobaltochelatase subunit CobN  41.1 
 
 		 1278 aa  885    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1518  cobaltochelatase subunit CobN  45.89 
 
 		 1364 aa  982    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0461692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0738  cobaltochelatase subunit CobN  37.11 
 
 		 1286 aa  785    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0158  cobaltochelatase  37.22 
 
 		 1235 aa  767    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.75394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2219  cobaltochelatase subunit CobN  41.45 
 
 		 1248 aa  881    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  37.86 
 
 		 1255 aa  866    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09801  cobalamin biosynthetic protein CobN  32.2 
 
 		 1245 aa  748    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2482  cobaltochelatase, CobN subunit  44.39 
 
 		 1203 aa  991    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.440822  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5001  cobaltochelatase subunit CobN  40.45 
 
 		 1269 aa  866    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0676394  decreased coverage  0.00000811844 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  36.24 
 
 		 1220 aa  874    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2533  cobaltochelatase subunit CobN  43.5 
 
 		 1198 aa  1001    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1646  cobaltochelatase subunit CobN  40.55 
 
 		 1267 aa  875    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244329  normal  0.0408694 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08851  cobalamin biosynthetic protein CobN  32.62 
 
 		 1253 aa  703    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000327208 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2710  cobaltochelatase subunit CobN  45.76 
 
 		 1222 aa  1087    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.381245  decreased coverage  0.0000125335 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0636  cobaltochelatase subunit CobN  38.35 
 
 		 1247 aa  803    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5746  cobaltochelatase, CobN subunit  40.47 
 
 		 1273 aa  846    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000307872 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2352  cobaltochelatase, CobN subunit  59.61 
 
 		 1444 aa  1726    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.113617  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1269  cobaltochelatase subunit CobN  39.98 
 
 		 1263 aa  828    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1177  cobaltochelatase subunit CobN  41.04 
 
 		 1269 aa  899    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2496  cobaltochelatase subunit CobN  43.5 
 
 		 1198 aa  1001    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315782  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  48.41 
 
 		 1237 aa  1186    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0132  cobaltochelatase subunit CobN  39.51 
 
 		 1363 aa  984    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305949  normal  0.0126467 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  43.61 
 
 		 1194 aa  1010    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1646  Cobaltochelatase  36.41 
 
 		 1293 aa  705    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.45922  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1557  cobaltochelatase subunit CobN  41.08 
 
 		 1270 aa  903    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25970  cobaltochelatase subunit CobN  41.17 
 
 		 1248 aa  876    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.359324  normal  0.429696 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1377  cobaltochelatase, CobN subunit  39.36 
 
 		 1293 aa  862    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.376222  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1657  cobaltochelatase subunit CobN  41.04 
 
 		 1269 aa  899    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  41.37 
 
 		 1244 aa  1001    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1877  cobaltochelatase subunit CobN  39.32 
 
 		 1263 aa  811    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  38.04 
 
 		 1259 aa  864    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2815  cobaltochelatase, CobN subunit  41.67 
 
 		 1247 aa  976    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.265823 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  34.71 
 
 		 1266 aa  692    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0496  cobaltochelatase  34.52 
 
 		 1270 aa  668    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176352  normal  0.833561 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  47.89 
 
 		 1222 aa  1107    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  39.78 
 
 		 1256 aa  927    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2082  cobaltochelatase  32.91 
 
 		 1297 aa  637    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1631  cobaltochelatase subunit CobN  41.07 
 
 		 1269 aa  900    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498133  normal  0.0450481 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  38.16 
 
 		 1258 aa  881    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  45.86 
 
 		 1193 aa  1063    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2269  cobaltochelatase subunit CobN  40.99 
 
 		 1253 aa  897    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2878  cobaltochelatase subunit CobN  42.47 
 
 		 1190 aa  970    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0145  cobaltochelatase subunit CobN  43.64 
 
 		 1212 aa  977    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2541  cobaltochelatase subunit CobN  43.5 
 
 		 1198 aa  1001    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  42.42 
 
 		 1205 aa  1008    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1615  cobaltochelatase subunit CobN  42.11 
 
 		 1220 aa  795    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144906  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2371  cobaltochelatase subunit CobN  39.4 
 
 		 1388 aa  737    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.408289  normal  0.0205166 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09821  cobalamin biosynthetic protein CobN  32.31 
 
 		 1245 aa  759    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0816  cobaltochelatase, CobN subunit  39.92 
 
 		 1175 aa  825    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3461  CobN/magnesium chelatase  37.06 
 
 		 1304 aa  775    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09611  cobalamin biosynthetic protein CobN  33.33 
 
 		 1245 aa  768    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10041  cobalamin biosynthetic protein CobN  33.18 
 
 		 1262 aa  758    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.460676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2422  cobaltochelatase subunit CobN  40.91 
 
 		 1253 aa  899    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.842189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4862  cobaltochelatase subunit CobN  45.11 
 
 		 1266 aa  1053    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114113  normal  0.358132 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14911  cobalamin biosynthetic protein CobN  33.82 
 
 		 1259 aa  702    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.629118 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0277  cobaltochelatase subunit CobN  42.2 
 
 		 1220 aa  797    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.408292  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4586  cobaltochelatase subunit CobN  41.5 
 
 		 1248 aa  903    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0648  cobaltochelatase, CobN subunit  54.1 
 
 		 1409 aa  1482    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2131  cobaltochelatase subunit CobN  40.86 
 
 		 1330 aa  775    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0808058  normal  0.0966772 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1938  cobaltochelatase subunit CobN  40.93 
 
 		 1281 aa  877    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.812521  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1954  cobaltochelatase subunit CobN  40.93 
 
 		 1281 aa  878    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>