148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5306 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5306  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  639    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939469  normal  0.0565222 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0898  hypothetical protein  51.54 
 
 
283 aa  250  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148019 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1091  hypothetical protein  40.19 
 
 
322 aa  242  7e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0528026  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0598  hypothetical protein  42.52 
 
 
296 aa  229  5e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0615  hypothetical protein  41.72 
 
 
300 aa  224  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1737  hypothetical protein  38.89 
 
 
318 aa  221  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033036 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0749  hypothetical protein  40.2 
 
 
288 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1763  hypothetical protein  38.16 
 
 
300 aa  205  7e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0148846 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1070  hypothetical protein  42.68 
 
 
287 aa  204  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1830  hypothetical protein  40.59 
 
 
290 aa  195  8.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00791791  hitchhiker  0.0000000000564838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0886  transposase and inactivated derivative  36.6 
 
 
310 aa  187  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615238  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1534  hypothetical protein  34.11 
 
 
233 aa  144  3e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0511  hypothetical protein  29.9 
 
 
309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00971553  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3232  hypothetical protein  30.36 
 
 
382 aa  129  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0627  hypothetical protein  30.19 
 
 
298 aa  129  7.000000000000001e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.261327  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3230  hypothetical protein  30.85 
 
 
326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593282  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3231  hypothetical protein  30 
 
 
382 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0885  hypothetical protein  35.03 
 
 
183 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00688729 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2384  hypothetical protein  29.11 
 
 
314 aa  116  5e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000288219  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2497  hypothetical protein  29.8 
 
 
309 aa  115  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1947  hypothetical protein  25.99 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000247154  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4711  hypothetical protein  27.36 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0013874  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1131  hypothetical protein  28.34 
 
 
298 aa  113  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0296  hypothetical protein  29.41 
 
 
303 aa  112  7.000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0337026  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2384  hypothetical protein  29.72 
 
 
325 aa  109  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000252943  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1941  hypothetical protein  25.33 
 
 
288 aa  106  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000016272  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1487  hypothetical protein  27.27 
 
 
302 aa  104  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0528  hypothetical protein  28.94 
 
 
311 aa  103  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.261127  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0294  hypothetical protein  27.56 
 
 
315 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0766  hypothetical protein  28.63 
 
 
303 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4940  hypothetical protein  25.71 
 
 
327 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5077  hypothetical protein  25.55 
 
 
325 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0397  hypothetical protein  26.63 
 
 
317 aa  98.6  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0807  hypothetical protein  27.9 
 
 
298 aa  98.2  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.098381  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4715  hypothetical protein  25.55 
 
 
331 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1178  hypothetical protein  26.46 
 
 
314 aa  93.6  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4944  hypothetical protein  26.45 
 
 
319 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2565  hypothetical protein  25.62 
 
 
313 aa  87.8  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136363  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1931  hypothetical protein  26.09 
 
 
308 aa  87.4  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3010  hypothetical protein  26.59 
 
 
326 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0413061  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1611  hypothetical protein  26.11 
 
 
318 aa  86.7  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.5466e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1236  hypothetical protein  25.38 
 
 
311 aa  86.3  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00145215  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1608  hypothetical protein  25.76 
 
 
306 aa  85.1  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1240  hypothetical protein  25.81 
 
 
334 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0820  hypothetical protein  25.9 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2145  hypothetical protein  27.85 
 
 
285 aa  82  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2429  hypothetical protein  26.16 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0230  hypothetical protein  24.61 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00383338  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3057  hypothetical protein  26.78 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2698  hypothetical protein  26.02 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0300  hypothetical protein  25.24 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000400684  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3058  hypothetical protein  26.23 
 
 
289 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.669677  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2583  hypothetical protein  24.09 
 
 
317 aa  75.5  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.21441e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0226  hypothetical protein  43.48 
 
 
147 aa  74.7  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0216  hypothetical protein  26.89 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115501  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2413  hypothetical protein  25.47 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000810744  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0006  hypothetical protein  25.16 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00155614  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0885  hypothetical protein  23.75 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0996  hypothetical protein  29.37 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0539  hypothetical protein  27.67 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0257  hypothetical protein  26.95 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4555  hypothetical protein  25.88 
 
 
234 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.166025  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0142  hypothetical protein  24.76 
 
 
298 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.836251  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0597  hypothetical protein  25 
 
 
330 aa  72  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.946017  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2719  hypothetical protein  22.62 
 
 
296 aa  71.2  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1114  hypothetical protein  25.46 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0550  hypothetical protein  37.5 
 
 
109 aa  70.5  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.15726  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3043  hypothetical protein  55.74 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.190501  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0058  hypothetical protein  24.84 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00639651  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1261  hypothetical protein  25 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0691  hypothetical protein  37.63 
 
 
147 aa  68.6  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0223479  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1137  hypothetical protein  28.74 
 
 
256 aa  68.9  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2786  hypothetical protein  47.83 
 
 
340 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1182  hypothetical protein  44.32 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0958  hypothetical protein  25.29 
 
 
285 aa  65.5  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4573  hypothetical protein  24.78 
 
 
230 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0127  hypothetical protein  23.08 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000393642 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0049  hypothetical protein  21.1 
 
 
296 aa  63.9  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2432  hypothetical protein  22.92 
 
 
259 aa  64.3  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.870937 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0655  hypothetical protein  46.43 
 
 
300 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2607  hypothetical protein  25.55 
 
 
289 aa  64.3  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.989258  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2444  hypothetical protein  25.24 
 
 
299 aa  63.5  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.445451  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0536  hypothetical protein  36.56 
 
 
147 aa  63.2  0.000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.392908  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0669  hypothetical protein  22.8 
 
 
292 aa  62  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0398  hypothetical protein  35.48 
 
 
147 aa  62  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0993  hypothetical protein  35.48 
 
 
147 aa  61.6  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0031  hypothetical protein  26.92 
 
 
307 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0158  hypothetical protein  26.92 
 
 
307 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.459825  hitchhiker  4.24073e-17 
 
 
-
 
NC_002978  WD1140  hypothetical protein  34.41 
 
 
147 aa  59.7  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4981  hypothetical protein  29.2 
 
 
160 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1344  hypothetical protein  21.75 
 
 
292 aa  57.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0101  hypothetical protein  27.47 
 
 
298 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2696  hypothetical protein  21.24 
 
 
291 aa  57  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4962  hypothetical protein  28.89 
 
 
192 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0395  hypothetical protein  26.61 
 
 
246 aa  56.2  0.0000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2707  hypothetical protein  22.26 
 
 
300 aa  55.1  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3455  hypothetical protein  54 
 
 
283 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1707  hypothetical protein  45.61 
 
 
280 aa  53.5  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.420351  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1221  hypothetical protein  54.35 
 
 
292 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1976  hypothetical protein  21.97 
 
 
287 aa  53.1  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>