More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5278 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5278  Gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 642 aa  1334    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1305  Gamma-glutamyltransferase  66.67 
 
 		 643 aa  879    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82304 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3042  gamma-glutamyltransferase  61.94 
 
 		 630 aa  802    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5360  gamma-glutamyltransferase  37.13 
 
 		 594 aa  319  9e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2965  gamma-glutamyltransferase  35.05 
 
 		 599 aa  296  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4106  Gamma-glutamyltransferase  35.48 
 
 		 594 aa  290  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3779  Gamma-glutamyltransferase  35.91 
 
 		 593 aa  289  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3078  gamma-glutamyltransferase 2  34.15 
 
 		 562 aa  281  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.588204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2852  putative gamma-glutamyltranspeptidase  32.94 
 
 		 600 aa  281  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4650  Gamma-glutamyltransferase  31.05 
 
 		 594 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3965  gamma-glutamyltransferase  31.22 
 
 		 609 aa  242  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.322229  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  30.56 
 
 		 563 aa  238  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00700  gamma-glutamyltransferase 2  31.02 
 
 		 594 aa  237  6e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.303259 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  30.46 
 
 		 570 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  30.46 
 
 		 570 aa  234  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  30.46 
 
 		 570 aa  234  5e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3531  gamma-glutamyltransferase  30.61 
 
 		 613 aa  233  7.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  30.63 
 
 		 545 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0574  gamma-glutamyltranspeptidase  31.23 
 
 		 601 aa  233  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1089  Gamma-glutamyltransferase  30.91 
 
 		 607 aa  231  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19053  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  29.83 
 
 		 573 aa  229  8e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  30.92 
 
 		 593 aa  229  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  29.55 
 
 		 590 aa  229  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  30.12 
 
 		 570 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0049  Gamma-glutamyltransferase  32.06 
 
 		 593 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  30.73 
 
 		 580 aa  228  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  29.95 
 
 		 570 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  31.85 
 
 		 541 aa  225  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4046  gamma-glutamyltranspeptidase  29.55 
 
 		 624 aa  224  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358962  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  29.95 
 
 		 570 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  30.05 
 
 		 565 aa  224  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4674  gamma-glutamyltransferase  30.44 
 
 		 592 aa  224  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  29.95 
 
 		 570 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  29.78 
 
 		 570 aa  223  9e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2757  Gamma-glutamyltransferase  31.05 
 
 		 586 aa  220  6e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147984 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  30.18 
 
 		 581 aa  220  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  29.22 
 
 		 590 aa  219  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0385  gamma-glutamyltransferase 1  28.64 
 
 		 576 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1456  gamma-glutamyltransferase  32.07 
 
 		 587 aa  218  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0464  Gamma-glutamyltransferase  29.62 
 
 		 616 aa  218  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0782147  normal  0.0485525 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  29.51 
 
 		 568 aa  216  9e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6122  Gamma-glutamyltransferase  33.27 
 
 		 597 aa  215  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223308  normal  0.010406 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0026  gamma-glutamyltransferase  29.13 
 
 		 577 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  30.43 
 
 		 579 aa  215  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0082  gamma-glutamyltransferase  29.2 
 
 		 594 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.437082 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  29.33 
 
 		 583 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  29.01 
 
 		 564 aa  213  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0722  gamma-glutamyltransferase  27.72 
 
 		 594 aa  211  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  28.24 
 
 		 576 aa  209  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  28.43 
 
 		 563 aa  209  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  28.7 
 
 		 617 aa  207  4e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1982  gamma-glutamyltransferase  29.48 
 
 		 565 aa  207  6e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.576386 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  29.11 
 
 		 556 aa  206  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  28.95 
 
 		 556 aa  204  3e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2481  gamma-glutamyltransferase  30.47 
 
 		 587 aa  204  5e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566525  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  28.28 
 
 		 576 aa  203  6e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  27.57 
 
 		 587 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  28.2 
 
 		 645 aa  202  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  27.81 
 
 		 645 aa  201  3e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  28.39 
 
 		 599 aa  201  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  29.71 
 
 		 583 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0062  gamma-glutamyltransferase  29.2 
 
 		 592 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0068  gamma-glutamyltransferase  30.3 
 
 		 597 aa  198  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  27.48 
 
 		 582 aa  198  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3004  Gamma-glutamyltransferase  30.58 
 
 		 612 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  29.02 
 
 		 553 aa  197  5.000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  29.13 
 
 		 580 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4199  gamma-glutamyltransferase  27.69 
 
 		 586 aa  196  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0825429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0896  gamma-glutamyltransferase  27.7 
 
 		 615 aa  196  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  28.96 
 
 		 580 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  27.65 
 
 		 581 aa  196  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  28.57 
 
 		 579 aa  195  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4485  gamma-glutamyltransferase  27.33 
 
 		 583 aa  194  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3269  gamma-glutamyltransferase  29.11 
 
 		 587 aa  194  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.546804  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4137  gamma-glutamyltransferase  29.64 
 
 		 583 aa  193  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4601  gamma-glutamyltransferase  29.64 
 
 		 583 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00594681  normal  0.046207 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0026  gamma-glutamyltransferase  29.96 
 
 		 599 aa  192  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.165843  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1727  gamma-glutamyltransferase  27.6 
 
 		 579 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0612761  normal  0.0127871 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  28.8 
 
 		 580 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2658  gamma-glutamyltransferase  27.6 
 
 		 579 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0212012  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  28.76 
 
 		 580 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1667  gamma-glutamyltransferase  26.45 
 
 		 579 aa  191  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505372  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0161  gamma-glutamyltranspeptidase  28.79 
 
 		 584 aa  191  5e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2620  gamma-glutamyltransferase  27.44 
 
 		 579 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2733  gamma-glutamyltransferase  27.44 
 
 		 579 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215634  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4426  gamma-glutamyltransferase  29.06 
 
 		 601 aa  190  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0996  gamma-glutamyltransferase 1  30 
 
 		 583 aa  190  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3128  gamma-glutamyltransferase  28.73 
 
 		 587 aa  190  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1625  gamma-glutamyltransferase  29 
 
 		 578 aa  190  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441001  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3168  gamma-glutamyltransferase  27.2 
 
 		 604 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1540  gamma-glutamyltransferase  28.94 
 
 		 610 aa  189  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00533292 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1057  gamma-glutamyltransferase  29.14 
 
 		 587 aa  189  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0021  gamma-glutamyltransferase  27.37 
 
 		 586 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0191  gamma-glutamyltransferase  27.46 
 
 		 581 aa  189  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2297  gamma-glutamyltransferase 1  28.38 
 
 		 579 aa  189  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0286048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0148  Gamma-glutamyltransferase  29.1 
 
 		 601 aa  188  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0170697  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  28.48 
 
 		 580 aa  188  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2487  gamma-glutamyltransferase 1  28.19 
 
 		 579 aa  187  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395225 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  28.47 
 
 		 589 aa  187  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4931  gamma-glutamyltranspeptidase  28.69 
 
 		 619 aa  187  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>